Домен LysM

Домен белка
Домен белка
Домен LysM
Идентификаторы
СимволЛизМ
ПфамПФ01476
ИнтерПроIPR000644
УМНЫЙЛизМ
ПРОСИТPS51782
СКОП21e0g / SCOPe / SUPFAM
CDDcd00118
Мембранома1306
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры

В молекулярной биологии домен LysM — это белковый домен, обнаруженный в большом количестве внеклеточных белков и рецепторов. Домен LysM назван в честь мотива лизина, который был первоначальным названием, данным мотиву последовательности, идентифицированному в бактериальных белках. Первоначально эта область была идентифицирована как C-концевой повтор, обнаруженный в мурамидазе Enterococcus hirae . [1] Домен LysM обнаружен в большом количестве микробных внеклеточных белков, где, как полагают, домен LysM обеспечивает прикрепление к внеклеточным полисахаридам, таким как пептидогликан и хитин . Домены LysM также обнаружены в растительных рецепторах, включая NFP, рецептор для фактора Nod , который необходим для симбиоза корневых клубеньков между бобовыми и симбиотическими бактериями . [2] Длина домена LysM обычно составляет от 44 до 65 аминокислотных остатков. [3] Структура домена LysM показала, что он состоит из пары антипараллельных бета-нитей, разделенных парой коротких альфа-спиралей . [4]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Joris B, Englebert S, Chu CP, Kariyama R, Daneo-Moore L, Shockman GD, Ghuysen JM (март 1992 г.). «Модульная конструкция мурамидазы-2 Enterococcus hirae и аутолизина Streptococcus faecalis». FEMS Microbiology Letters . 70 (3): 257– 64. doi : 10.1016/0378-1097(92)90707-u . PMID  1352512.
  2. ^ Арриги, Жан-Франсуа; Барре, Анник; Бен Амор, Бесма; Берсу, Энн; Сориано, Лидия Кампос; Мирабелла, Россана; де Карвалью-Нибель, Фернанда; Журне, Этьен-Паскаль; Жерарди, Мишель; Уге, Тьерри; Гертс, Рене (2006). «Семейство генов киназы, подобной лизиновому мотиву и рецептору Medicago truncatula, включает NFP и новые гены, экспрессируемые узелками». Физиология растений . 142 (1): 265–279 . doi :10.1104/стр.106.084657. ISSN  0032-0889. ПМЦ 1557615 . PMID  16844829. 
  3. ^ Buist G, Steen A, Kok J, Kuipers OP (май 2008 г.). "LysM, широко распространенный белковый мотив для связывания с (пептидо)гликанами". Молекулярная микробиология . 68 (4): 838–47 . doi : 10.1111/j.1365-2958.2008.06211.x . PMID  18430080.
  4. ^ Бейтман А., Байкрофт М. (июнь 2000 г.). «Структура домена LysM из связанной с мембраной литической муреинтрансгликозилазы D (MltD) E. coli». Журнал молекулярной биологии . 299 (4): 1113– 9. doi :10.1006/jmbi.2000.3778. PMID  10843862.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=LysM_domain&oldid=1249763761"