ЛокДБ
 | |
| Содержание | |
|---|---|
| Описание | экспериментальные аннотации локализации |
| Организмы | Homo sapiens Arabidopsis thaliana |
| Контакт | |
| Исследовательский центр | Колумбийский университет |
| Лаборатория | Кафедра биохимии и молекулярной биофизики |
| Авторы | Шрути Растоги |
| Первичная ссылка | Растоги и др. (2011) [1] |
| Дата выпуска | 2010 |
| Доступ | |
| Формат данных | База данных MySQL |
| Веб-сайт | http://www.rostlab.org/services/locDB |
| URL веб-сервиса | http://www.rostlab.org/services/locDB/search.php |
| Разнообразный | |
| Версия | Выпуск 1.0 |
LocDB [1] — это база данных, курируемая экспертами, которая собирает экспериментальные аннотации для субклеточной локализации белков у Homo sapiens (человек) и Arabidopsis thaliana (Weed). База данных также содержит прогнозы субклеточной локализации из различных современных методов прогнозирования для всех белков с экспериментальной информацией.
Белки являются основными функциональными компонентами клеток. Они отвечают за преобразование генетической информации в физическую реальность. Эти макромолекулы опосредуют регуляцию генов, ферментативный катализ, клеточный метаболизм, репликацию ДНК и транспорт питательных веществ, распознавание и передачу сигналов. Интерпретация этого богатства данных для выяснения функции белков в постгеномную эру является фундаментальной проблемой. На сегодняшний день даже для самых хорошо изученных организмов, таких как дрожжи, около четверти белков остаются неохарактеризованными. Основным препятствием в экспериментальном определении функции белков является то, что исследования требуют огромных ресурсов. Следовательно, разрыв между количеством последовательностей, размещенных в базах данных, и экспериментальной характеристикой соответствующих белков постоянно растет. Биоинформатика играет центральную роль в преодолении этого разрыва между последовательностью и функцией посредством разработки инструментов для более быстрого и эффективного прогнозирования функции белков. Этот репозиторий эффективно заполняет пробел между экспериментальными аннотациями и прогнозами и предоставляет более крупный и надежный набор данных для тестирования новых методов прогнозирования. [1]
Смотрите также
Ссылки
 | Эта статья, связанная с Биологической базой данных , является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее. |
