мотив РНК ldcC

Мотив РНК ldcC представляет собой консервативную структуру РНК , которая была открыта биоинформатикой . [1] РНК с мотивом ldcC обнаружены у Bacillota и двух видов Spirochaetota .

РНК с мотивом ldcC, вероятно, функционируют как цис-регуляторные элементы , ввиду их расположения выше генов , кодирующих белок . Гены, предположительно регулируемые РНК ldcC, представляют собой декарбоксилазы аргинина , орнитина , S -аденозилметионина или других субстратов. Эндопептидаза C39A и potA ( транспортер спермидина / путресцина ) также относительно распространены. Таким образом, РНК ldcC могут регулировать метаболизм полиаминов .

Мотив ldcC может иметь псевдоузел во вторичной структуре , но это неясно.

Ссылки

  1. ^ Weinberg Z, Lünse CE, Corbino KA, Ames TD, Nelson JW, Roth A, Perkins KR, Sherlock ME, Breaker RR (октябрь 2017 г.). «Обнаружение 224 структурированных РНК-кандидатов путем сравнительного анализа определенных подмножеств межгенных регионов». Nucleic Acids Res . 45 (18): 10811– 10823. doi :10.1093/nar/gkx699. PMC  5737381. PMID  28977401 .


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=LdcC_RNA_motif&oldid=1249798008"