LYPD1

LYPD1
Идентификаторы
Псевдонимы	LYPD1 , LYPDC1, PHTS, домен LY6/PLAUR, содержащий 1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 610450; МГИ : 1919835; гомологен : 16937; Генные карты : LYPD1; OMA :LYPD1 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 2 (человек)
Конец	132,671,579 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 1 (мышь)
Конец	125,840,838 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	правая маточная труба; ; прилежащее ядро; ; хвостатое ядро; ; путамен; ; желудочковая зона; ; Гипоталамус; ; Миндалевидное тело; ; Гипофиз; ; поясная извилина; ; передняя поясная кора;
	Верх выражен в
	глоссофарингеальный ганглий; ; ганглий блуждающего нерва; ; зубчатая извилина гиппокампа гранулярная клетка образования; ; клиновидные кости; ; черепно-мозговые нервы; ; нижний ганглий блуждающего нерва; ; Миндалевидное тело; ; обонятельный нерв; ; первичная зрительная кора; ; верхняя лобная извилина;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	Связывание ацетилхолинового рецептора; активность ингибитора ацетилхолинового рецептора;
Клеточный компонент	мембрана; закрепленный компонент мембраны; внеклеточная область; плазматическая мембрана;
Биологический процесс	реакция на никотин; поведенческая реакция страха; негативная регуляция активности сигнальных рецепторов; синаптическая передача, холинергическая; активация клеток; сигнальный путь ацетилхолинового рецептора; отрицательная регуляция локализации белка на плазматической мембране;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	116372
	72585
	ENSG00000150551
	ENSMUSG00000026344
	Q8N2G4
	Q8BLC3
	NM_001077427 ; NM_144586 ; NM_001321234 ; NM_001321235
	НМ_145100 ; НМ_001311089 ; НМ_001311090
	НП_001070895 ; НП_001308163 ; НП_001308164 ; НП_653187
	НП_001298018 ; НП_001298019 ; НП_659568
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Белок 1, содержащий домен Ly6/PLAUR, представляет собой белок , который у людей кодируется геном LYPD1 . [ ^5]^[6]

Этот белок также известен как Lynx2, член семейства белков, связывающих рецепторы нейротрансмиттеров Lynx . ^[7] Трансгенные мыши без экспрессии Lynx2 демонстрируют повышенное тревожное поведение. ^[8]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000150551 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000026344 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Э.А., Гроус Л.Х., Дерге Дж.Г., Клаузнер Р.Д., Коллинз Ф.С., Вагнер Л., Шенмен СМ, Шулер Г.Д., Альтшул С.Ф., Зееберг Б., Бютов К.Х., Шефер К.Ф., Бхат Н.К., Хопкинс РФ, Джордан Х., Мур Т, Макс СИ, Ван Дж., Се Ф, Дьяченко Л., Марусина К., Фармер А.А., Рубин Г.М., Хонг Л., Стэплтон М., Соарес М.Б., Бональдо М.Ф., Казавант Т.Л., Шитц Т.Э., Браунштейн М.Дж., Усдин Т.Б., Тошиюки С., Карнинчи П., Пранге С., Раха С.С., Локельяно Н.А., Питерс Г.Дж., Абрамсон Р.Д., Муллахи С.Дж., Босак С.А., Макьюэн П.Дж., МакКернан К.Дж., Малек ЙА, Gunaratne PH, Richards S, Worley KC, Hale S, Garcia AM, Gay LJ, Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG, Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, Krzywinski MI, Skalska U, Smailus DE, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Marra MA (декабрь 2002 г.). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc Natl Acad Sci USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
^ «Ген Entrez: домен LYPD1 LY6/PLAUR, содержащий 1».
^ Мива, Дж. М.; Лестер, HA; Уолц, А. (2012). «Оптимизация холинергического тонуса с помощью модуляторов никотиновых рецепторов Lynx: последствия для пластичности и никотиновой зависимости». Физиология . 27 (4): 187–199 . doi :10.1152/physiol.00002.2012. PMID 22875450.
^ Tekinay, AB; Nong, Y.; Miwa, JM; Lieberam, I.; Ibanez-Tallon, I.; Greengard, P.; Heintz, N. (2009). «Роль LYNX2 в поведении, связанном с тревогой». Труды Национальной академии наук . 106 (11): 4477– 4482. Bibcode : 2009PNAS..106.4477T. doi : 10.1073/pnas.0813109106 . PMC 2657456. PMID 19246390 .

Дальнейшее чтение

Yu DH, Fan W, Liu G и др. (2006). «PHTS, новый предполагаемый супрессор опухолей, участвует в реверсии трансформации клеток HeLaHF независимо от пути p53». Exp. Cell Res . 312 (6): 865–76 . doi :10.1016/j.yexcr.2005.12.006. PMID 16413018.
Choy KW, Wang CC, Ogura A и др. (2007). «Геномная аннотация 15 809 EST, идентифицированных из объединенных ранних гестационных человеческих глаз». Physiol. Genomics . 25 (1): 9– 15. doi :10.1152/physiolgenomics.00121.2005. PMID 16368877.
Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Й и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов». Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560 .
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевых слов in silico для выбора полноразмерных человеческих кДНК, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек кДНК с олиго-кэпом». DNA Res . 12 (2): 117– 26. doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID 16303743.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
Clark HF, Gurney AL, Abaya E и др. (2003). «Инициатива по обнаружению секретируемых белков (SPDI), крупномасштабные усилия по выявлению новых секретируемых и трансмембранных белков человека: биоинформатическая оценка». Genome Res . 13 (10): 2265– 70. doi :10.1101/gr.1293003. PMC 403697. PMID 12975309 .

Эта статья о гене на хромосоме 2 человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000150551 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000026344 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid12477932-5] Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Э.А., Гроус Л.Х., Дерге Дж.Г., Клаузнер Р.Д., Коллинз Ф.С., Вагнер Л., Шенмен СМ, Шулер Г.Д., Альтшул С.Ф., Зееберг Б., Бютов К.Х., Шефер К.Ф., Бхат Н.К., Хопкинс РФ, Джордан Х., Мур Т, Макс СИ, Ван Дж., Се Ф, Дьяченко Л., Марусина К., Фармер А.А., Рубин Г.М., Хонг Л., Стэплтон М., Соарес М.Б., Бональдо М.Ф., Казавант Т.Л., Шитц Т.Э., Браунштейн М.Дж., Усдин Т.Б., Тошиюки С., Карнинчи П., Пранге С., Раха С.С., Локельяно Н.А., Питерс Г.Дж., Абрамсон Р.Д., Муллахи С.Дж., Босак С.А., Макьюэн П.Дж., МакКернан К.Дж., Малек ЙА, Gunaratne PH, Richards S, Worley KC, Hale S, Garcia AM, Gay LJ, Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG, Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, Krzywinski MI, Skalska U, Smailus DE, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Marra MA (декабрь 2002 г.). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc Natl Acad Sci USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .

[entrez-6] «Ген Entrez: домен LYPD1 LY6/PLAUR, содержащий 1».

[7] Мива, Дж. М.; Лестер, HA; Уолц, А. (2012). «Оптимизация холинергического тонуса с помощью модуляторов никотиновых рецепторов Lynx: последствия для пластичности и никотиновой зависимости». Физиология . 27 (4): 187–199 . doi :10.1152/physiol.00002.2012. PMID 22875450.

[8] Tekinay, AB; Nong, Y.; Miwa, JM; Lieberam, I.; Ibanez-Tallon, I.; Greengard, P.; Heintz, N. (2009). «Роль LYNX2 в поведении, связанном с тревогой». Труды Национальной академии наук . 106 (11): 4477– 4482. Bibcode : 2009PNAS..106.4477T. doi : 10.1073/pnas.0813109106 . PMC 2657456. PMID 19246390 .