ЖМО1

ЖМО1
Идентификаторы
Псевдонимы	LMO1 , RBTN1, RHOM1, TTG1, LIM только домен 1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 186921; МГИ : 102812; гомологен : 48101; Генные карты : LMO1; OMA :LMO1 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 11 (человек)
Конец	8,268,716 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 7 (мышь)
Конец	108,774,414 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	гонада; ; широкая латеральная мышца бедра; ; мышца бедра; ; ооцит; ; яичко; ; пигментный эпителий сетчатки; ; вторичный ооцит; ; двуглавая мышца плеча; ; островок Лангерганса; ; икроножная мышца;
	Верх выражен в
	медиальное ганглиозное возвышение; ; стенка мочевого пузыря; ; слизистая оболочка мочевого пузыря; ; переходный эпителий мочевого пузыря; ; первичный ооцит; ; зигота; ; губа; ; вторичный ооцит; ; двигательное ядро лица; ; верхний шейный ганглий;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание белков; связывание ионов металлов;
Клеточный компонент	ядро; нуклеоплазма;
Биологический процесс	регуляция гомеостатической пролиферации Т-клеток; отрицательная регуляция транскрипции РНК-полимеразой II; положительная регуляция транскрипции РНК-полимеразой II; регуляция дифференцировки гемопоэтических стволовых клеток;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	4004
	109594
	ENSG00000166407
	ENSMUSG00000036111
	P25800
	Q924W9
	NM_001270428 ; NM_002315
	NM_001302205 ; NM_001302206 ; NM_057173 ; NM_001382564
	NP_001257357 ; NP_002306
	NP_001289134 ; NP_001289135 ; NP_476514 ; NP_001369493
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Ромботин-1 — это белок , который у людей кодируется геном LMO1 . [ ^5]^[6]^[7]

LMO1 кодирует богатый цистеином двухдоменный регулятор транскрипции LIM. Он сопоставлен с областью последовательной хромосомной транслокации в хромосоме 11, нарушая ее при Т-клеточной лейкемии, хотя реже, чем связанный ген, LMO2 нарушается. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что LMO1 взаимодействует с GATA3 ^[8]^[9] и TAL1 . ^[10]^[11]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000166407 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000036111 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Boehm T, Foroni L, Kaneko Y, Perutz MF, Rabbitts TH (июнь 1991 г.). «Семейство ромботинов богатых цистеином LIM-доменных онкогенов: отдельные члены участвуют в транслокациях Т-клеток на человеческие хромосомы 11p15 и 11p13». Proc Natl Acad Sci USA . 88 (10): 4367– 71. Bibcode :1991PNAS...88.4367B. doi : 10.1073/pnas.88.10.4367 . PMC 51660 . PMID 2034676.
^ McGuire EA, Davis AR, Korsmeyer SJ (март 1991). «Ген транслокации Т-клеток 1 (Ttg-1) кодирует ядерный белок, обычно экспрессируемый в клетках нейральной линии». Blood . 77 (3): 599– 606. doi : 10.1182/blood.V77.3.599.599 . PMID 1703797.
^ ab "Ген Entrez: LMO1 LIM домен только 1 (ромботин 1)".
^ Оно Y, Фукухара N, Йоши O (декабрь 1998 г.). «Протеины TAL1 и LIM-only синергически индуцируют экспрессию ретинальдегиддегидрогеназы 2 при остром лимфобластном лейкозе Т-клеток, действуя как кофакторы для GATA3». Mol. Cell. Biol . 18 (12): 6939– 50. doi :10.1128/MCB.18.12.6939. ISSN 0270-7306. PMC 109277. PMID 9819382 .
^ Оно Y, Фукухара N, Йоши O (февраль 1997 г.). «Транскрипционная активность TAL1 при остром лимфобластном лейкозе Т-клеток (T-ALL) требует RBTN1 или -2 и индуцирует TALLA1, высокоспецифичный опухолевый маркер T-ALL». J. Biol. Chem . 272 (7): 4576– 81. doi : 10.1074/jbc.272.7.4576 . ISSN 0021-9258. PMID 9020185.
^ Valge-Archer VE, Osada H, Warren AJ, Forster A, Li J, Baer R, Rabbitts TH (август 1994). «Белок LIM RBTN2 и основной белок спираль-петля-спираль TAL1 присутствуют в комплексе в эритроидных клетках». Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91 (18): 8617– 21. Bibcode :1994PNAS...91.8617V. doi : 10.1073/pnas.91.18.8617 . ISSN 0027-8424. PMC 44657 . PMID 8078932.
^ Wadman I, Li J, Bash RO, Forster A, Osada H, Rabbitts TH, Baer R (октябрь 1994 г.). «Специфическая in vivo ассоциация между белками bHLH и LIM, вовлеченными в лейкемию Т-клеток человека». EMBO J . 13 (20): 4831– 9. doi :10.1002/j.1460-2075.1994.tb06809.x. ISSN 0261-4189. PMC 395422 . PMID 7957052.

Дальнейшее чтение

Foroni L, Boehm T, White L и др. (1992). «Семейство генов ромботина кодирует родственные белки LIM-домена, чья различная экспрессия предполагает множественные роли в развитии мыши». J. Mol. Biol . 226 (3): 747– 61. doi :10.1016/0022-2836(92)90630-3. PMID 1507224.
Boehm T, Spillantini MG, Sofroniew MV и др. (1991). «Регулируемая развитием и специфичная для тканей экспрессия мРНК, кодирующих две альтернативные формы домена LIM онкогена ромботина: доказательства экспрессии в тимусе». Oncogene . 6 (5): 695–703 . PMID 2052354.
Chen Q, Cheng JT, Tasi LH и др. (1990). «Ген tal подвергается транслокации хромосом при лейкемии Т-клеток и потенциально кодирует белок спираль-петля-спираль». EMBO J . 9 (2): 415– 24. doi :10.1002/j.1460-2075.1990.tb08126.x. PMC 551682 . PMID 2303035.
Boehm T, Greenberg JM, Buluwela L и др. (1990). «Необычная структура предполагаемого онкогена Т-клеток, которая позволяет производить схожие белки из различных мРНК». EMBO J . 9 (3): 857– 68. doi :10.1002/j.1460-2075.1990.tb08183.x. PMC 551746 . PMID 2311586.
McGuire EA, Hockett RD, Pollock KM и др. (1989). «T(11;14)(p15;q11) в клеточной линии острого лимфобластного лейкоза Т-клеток активирует множественные транскрипты, включая Ttg-1, ген, кодирующий потенциальный белок цинкового пальца». Mol. Cell. Biol . 9 (5): 2124– 32. doi :10.1128/MCB.9.5.2124. PMC 363006. PMID 2501659 .
Boehm T, Baer R, Lavenir I и др. (1988). «Механизм хромосомной транслокации t(11;14) с участием локуса дельта рецептора Т-клеток C на человеческой хромосоме 14q11 и транскрибируемой области хромосомы 11p15». EMBO J . 7 (2): 385–94 . doi :10.1002/j.1460-2075.1988.tb02825.x. PMC 454331 . PMID 3259177.
Wadman I, Li J, Bash RO и др. (1994). «Специфическая in vivo ассоциация между белками bHLH и LIM, вовлеченными в лейкемию Т-клеток человека». EMBO J . 13 (20): 4831– 9. doi :10.1002/j.1460-2075.1994.tb06809.x. PMC 395422 . PMID 7957052.
Valge-Archer VE, Osada H, Warren AJ и др. (1994). «Белок LIM RBTN2 и основной белок спираль-петля-спираль TAL1 присутствуют в комплексе в эритроидных клетках». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 91 (18): 8617– 21. Bibcode :1994PNAS...91.8617V. doi : 10.1073/pnas.91.18.8617 . PMC 44657 . PMID 8078932.
Arber S, Caroni P (1996). «Специфичность отдельных мотивов LIM в нацеливании и взаимодействиях LIM/LIM in situ». Genes Dev . 10 (3): 289– 300. doi : 10.1101/gad.10.3.289 . PMID 8595880.
Jurata LW, Kenny DA, Gill GN (1996). «Ядерный интерактор LIM, белок, взаимодействующий с ромботином и гомеодоменом LIM, экспрессируется на ранних стадиях развития нейронов». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (21): 11693– 8. Bibcode :1996PNAS...9311693J. doi : 10.1073/pnas.93.21.11693 . PMC 38120 . PMID 8876198.
Оно Y, Фукухара N, Йоши O (1997). «Транскрипционная активность TAL1 при остром лимфобластном лейкозе Т-клеток (T-ALL) требует RBTN1 или -2 и индуцирует TALLA1, высокоспецифичный опухолевый маркер T-ALL». J. Biol. Chem . 272 (7): 4576– 81. doi : 10.1074/jbc.272.7.4576 . PMID 9020185.
Valge-Archer V, Forster A, Rabbitts TH (1999). «Взаимодействие белков LMO1 и LDB1 при остром лейкозе Т-клеток человека с хромосомной транслокацией t(11;14)(p15;q11)». Онкоген . 17 (24): 3199– 202. doi :10.1038/sj.onc.1202353. PMID 9872335. S2CID 9835264.
Bao J, Talmage DA, Role LW, Gautier J (2000). «Регуляция нейрогенеза путем взаимодействия между HEN1 и нейрональными белками LMO». Development . 127 (2): 425–35 . doi :10.1242/dev.127.2.425. PMID 10603358.
Cichutek A, Brueckmann T, Seipel B и др. (2001). «Сравнительные архитектурные аспекты регионов консервативной синтении на человеческой хромосоме 11p15.3 и мышиной хромосоме 7 (включая гены WEE1 и LMO1)». Cytogenet. Cell Genet . 93 ( 3– 4): 277– 83. doi :10.1159/000056998. PMID 11528126. S2CID 25807985.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
Lin YW, Deveney R, Barbara M и др. (2005). "OLIG2 (BHLHB1), фактор транскрипции bHLH, способствует лейкемогенезу совместно с LMO1". Cancer Res . 65 (16): 7151– 8. doi :10.1158/0008-5472.CAN-05-1400. PMC 1681523. PMID 16103065 .
Saeki N, Kim DH, Usui T и др. (2007). «GASDERMIN, часто подавляемый при раке желудка, является мишенью LMO1 в TGF-бета-зависимой апоптотической сигнализации». Oncogene . 26 (45): 6488– 98. doi :10.1038/sj.onc.1210475. PMID 17471240. S2CID 31245781.

Эта статья о гене на хромосоме 11 человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000166407 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000036111 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid2034676-5] Boehm T, Foroni L, Kaneko Y, Perutz MF, Rabbitts TH (июнь 1991 г.). «Семейство ромботинов богатых цистеином LIM-доменных онкогенов: отдельные члены участвуют в транслокациях Т-клеток на человеческие хромосомы 11p15 и 11p13». Proc Natl Acad Sci USA . 88 (10): 4367– 71. Bibcode :1991PNAS...88.4367B. doi : 10.1073/pnas.88.10.4367 . PMC 51660 . PMID 2034676.

[pmid1703797-6] McGuire EA, Davis AR, Korsmeyer SJ (март 1991). «Ген транслокации Т-клеток 1 (Ttg-1) кодирует ядерный белок, обычно экспрессируемый в клетках нейральной линии». Blood . 77 (3): 599– 606. doi : 10.1182/blood.V77.3.599.599 . PMID 1703797.

[entrez-7] "Ген Entrez: LMO1 LIM домен только 1 (ромботин 1)".

[pmid9819382-8] Оно Y, Фукухара N, Йоши O (декабрь 1998 г.). «Протеины TAL1 и LIM-only синергически индуцируют экспрессию ретинальдегиддегидрогеназы 2 при остром лимфобластном лейкозе Т-клеток, действуя как кофакторы для GATA3». Mol. Cell. Biol . 18 (12): 6939– 50. doi :10.1128/MCB.18.12.6939. ISSN 0270-7306. PMC 109277. PMID 9819382 .

[pmid9020185-9] Оно Y, Фукухара N, Йоши O (февраль 1997 г.). «Транскрипционная активность TAL1 при остром лимфобластном лейкозе Т-клеток (T-ALL) требует RBTN1 или -2 и индуцирует TALLA1, высокоспецифичный опухолевый маркер T-ALL». J. Biol. Chem . 272 (7): 4576– 81. doi : 10.1074/jbc.272.7.4576 . ISSN 0021-9258. PMID 9020185.

[pmid8078932-10] Valge-Archer VE, Osada H, Warren AJ, Forster A, Li J, Baer R, Rabbitts TH (август 1994). «Белок LIM RBTN2 и основной белок спираль-петля-спираль TAL1 присутствуют в комплексе в эритроидных клетках». Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91 (18): 8617– 21. Bibcode :1994PNAS...91.8617V. doi : 10.1073/pnas.91.18.8617 . ISSN 0027-8424. PMC 44657 . PMID 8078932.

[pmid7957052-11] Wadman I, Li J, Bash RO, Forster A, Osada H, Rabbitts TH, Baer R (октябрь 1994 г.). «Специфическая in vivo ассоциация между белками bHLH и LIM, вовлеченными в лейкемию Т-клеток человека». EMBO J . 13 (20): 4831– 9. doi :10.1002/j.1460-2075.1994.tb06809.x. ISSN 0261-4189. PMC 395422 . PMID 7957052.