LIN7C

LIN7C
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	3ЛРА
Идентификаторы
Псевдонимы	LIN7C , LIN-7-C, LIN-7C, MALS-3, MALS3, VELI3, гомолог C lin-7, компонент комплекса полярности клеток крошек
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 612332; МГИ : 1330839; гомологен : 22649; Генные карты : LIN7C; OMA :LIN7C — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 11 (человек)
Конец	27,506,769 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	109,731,348 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	Эпителий сосудистого сплетения; ; зародышевый эпителий; ; эпителий носоглотки; ; пигментный эпителий сетчатки; ; большеберцовая кость; ; полость рта; ; Район Бродмана 23; ; висцеральная плевра; ; париетальная плевра; ; почечный каналец;
	Верх выражен в
	обонятельный эпителий; ; доля мозжечка; ; медиальное ганглиозное возвышение; ; срединное возвышение; ; шишковидная железа; ; червь мозжечка; ; зигота; ; хвост эмбриона; ; зубчатая извилина; ; верхний шейный ганглий;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	специфическое связывание домена белка; связывание цитоскелетных белков; Связывание домена L27; Привязка домена PDZ;
Клеточный компонент	цитоплазма; постсинаптическая мембрана; постсинаптическая плотность; мембрана; соединение клетка-клетка; двуклеточный плотный контакт; плазматическая мембрана; Комплекс MPP7-DLG1-LIN7; клеточный переход; базолатеральная плазматическая мембрана; проекция нейрона; пресинапс; синапс; глутаматергический синапс;
Биологический процесс	локализация белка на базолатеральной плазматической мембране; поддержание апикальной/базальной полярности эпителиальных клеток; транспорт белков; морфогенез эпителиального пласта; секреция нейромедиатора; экзоцитоз;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	55327
	22343
	ENSG00000148943
	ENSMUSG00000027162
	Q9NUP9
	О88952
	NM_018362
	NM_011699
	NP_060832
	NP_035829
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Гомолог Lin-7 C — это белок , который у людей кодируется геном LIN7C . [ ^5]^[6]

Взаимодействия

Было показано, что LIN7C взаимодействует с:

DLG1 , ^[7]
KCNJ12 , ^[7]^[8] и
KCNJ4 . ^[7]^[8]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000148943 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000027162 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Джо К, Дерин Р., Ли М., Бредт Д.С. (июнь 1999 г.). «Характеристика MALS/Velis-1, -2 и -3: семейство гомологов млекопитающих LIN-7, обогащенных в синапсах мозга в связи с постсинаптической плотностью-95/постсинаптическим комплексом рецептора NMDA». J Neurosci . 19 (11): 4189– 99. doi : 10.1523/JNEUROSCI.19-11-04189.1999 . PMC 6782594 . PMID 10341223.
^ "Ген Энтреза: LIN7C lin-7 гомолог C (C. elegans)".
^ abc Leonoudakis D, Conti LR, Radeke CM, McGuire LM, Vandenberg CA (апрель 2004 г.). «Мультипротеиновый транспортный комплекс, состоящий из SAP97, CASK, Veli и Mint1, связан с внутренними выпрямляющими калиевыми каналами Kir2». J. Biol. Chem . 279 (18): 19051– 63. doi : 10.1074/jbc.M400284200 . PMID 14960569.
^ ab Leonoudakis D, Conti LR, Anderson S, Radeke CM, McGuire LM, Adams ME, Froehner SC, Yates JR, Vandenberg CA (май 2004 г.). «Белковый транспорт и якорные комплексы, выявленные с помощью протеомного анализа белков, связанных с внутренним выпрямительным калиевым каналом (Kir2.x)». J. Biol. Chem . 279 (21): 22331– 46. doi : 10.1074/jbc.M400285200 . PMID 15024025.

Дальнейшее чтение

Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Bécamel C, Alonso G, Galéotti N, Demey E, Jouin P, Ullmer C, Dumuis A, Bockaert J, Marin P (2002). «Синаптические мультипротеиновые комплексы, связанные с рецепторами 5-HT(2C): протеомный подход». EMBO J . 21 (10): 2332– 42. doi :10.1093/emboj/21.10.2332. PMC 126011 . PMID 12006486.
Hori K, Konno D, Maruoka H, Sobue K (2003). "MALS является связывающим партнером IRSp53 в межклеточных контактах". FEBS Lett . 554 ( 1– 2): 30– 4. Bibcode :2003FEBSL.554...30H. doi : 10.1016/S0014-5793(03)01074-3 . PMID 14596909. S2CID 30329043.
Leonoudakis D, Conti LR, Radeke CM, McGuire LM, Vandenberg CA (2004). «Мультипротеиновый транспортный комплекс, состоящий из SAP97, CASK, Veli и Mint1, связан с внутренними выпрямляющими калиевыми каналами Kir2». J. Biol. Chem . 279 (18): 19051– 63. doi : 10.1074/jbc.M400284200 . PMID 14960569.
Leonoudakis D, Conti LR, Anderson S, Radeke CM, McGuire LM, Adams ME, Froehner SC, Yates JR, Vandenberg CA (2004). «Белковый транспорт и якорные комплексы, выявленные с помощью протеомного анализа белков, связанных с внутренним выпрямительным калиевым каналом (Kir2.x)». J. Biol. Chem . 279 (21): 22331– 46. doi : 10.1074/jbc.M400285200 . PMID 15024025.
Petrosky KY, Ou HD, Löhr F, Dötsch V, Lim WA (2006). "Общая модель предпочтительной гетероолигомеризации доменов LIN-2/7: механизм, лежащий в основе направленной сборки супрамолекулярных сигнальных комплексов". J. Biol. Chem . 280 (46): 38528– 36. doi : 10.1074/jbc.M506536200 . PMID 16147993.
Mendes CC, Gomes DA, Thompson M, Souto NC, Goes TS, Goes AM, Rodrigues MA, Gomez MV, Nathanson MH, Leite MF (2006). «Рецептор инозитола 1,4,5-трифосфата III типа преимущественно передает апоптотические сигналы Ca2+ в митохондрии». J. Biol. Chem . 280 (49): 40892– 900. doi : 10.1074/jbc.M506623200 . PMID 16192275.
Bohl J, Brimer N, Lyons C, Vande Pol SB (2007). «Белок семейства звездной пыли MPP7 образует трехкомпонентный комплекс с LIN7 и DLG1, который регулирует стабильность и локализацию DLG1 в клеточных соединениях». J. Biol. Chem . 282 (13): 9392– 400. doi : 10.1074/jbc.M610002200 . PMID 17237226.
Онда Т., Узава К., Накашима Д., Сайто К., Ивадате Й., Секи Н., Шибахара Т., Танзава Х. (2007). «Lin-7C/VELI3/MALS-3: важный компонент метастазов плоскоклеточного рака человека» (PDF) . Cancer Res . 67 (20): 9643– 8. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-07-1911 . hdl :10130/633. PMID 17942893.

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 11 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000148943 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000027162 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10341223-5] Джо К, Дерин Р., Ли М., Бредт Д.С. (июнь 1999 г.). «Характеристика MALS/Velis-1, -2 и -3: семейство гомологов млекопитающих LIN-7, обогащенных в синапсах мозга в связи с постсинаптической плотностью-95/постсинаптическим комплексом рецептора NMDA». J Neurosci . 19 (11): 4189– 99. doi : 10.1523/JNEUROSCI.19-11-04189.1999 . PMC 6782594 . PMID 10341223.

[entrez-6] "Ген Энтреза: LIN7C lin-7 гомолог C (C. elegans)".

[pmid14960569-7] Leonoudakis D, Conti LR, Radeke CM, McGuire LM, Vandenberg CA (апрель 2004 г.). «Мультипротеиновый транспортный комплекс, состоящий из SAP97, CASK, Veli и Mint1, связан с внутренними выпрямляющими калиевыми каналами Kir2». J. Biol. Chem . 279 (18): 19051– 63. doi : 10.1074/jbc.M400284200 . PMID 14960569.

[pmid15024025-8] Leonoudakis D, Conti LR, Anderson S, Radeke CM, McGuire LM, Adams ME, Froehner SC, Yates JR, Vandenberg CA (май 2004 г.). «Белковый транспорт и якорные комплексы, выявленные с помощью протеомного анализа белков, связанных с внутренним выпрямительным калиевым каналом (Kir2.x)». J. Biol. Chem . 279 (21): 22331– 46. doi : 10.1074/jbc.M400285200 . PMID 15024025.