ЛИН7А

ЛИН7А
Идентификаторы
Псевдонимы	LIN7A , LIN-7A, LIN7, MALS-1, TIP-33, VELI1, гомолог A lin-7, компонент комплекса полярности клеток крошки, MALS1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 603380; МГИ : 2135609; гомологен : 20976; Генные карты : LIN7A; OMA :LIN7A — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 12 (человек)
Конец	80,937,934 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 10 (мышь)
Конец	107,257,335 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	Район Бродмана 23; ; эндотелиальная клетка; ; средняя височная извилина; ; пигментный эпителий сетчатки; ; первичная зрительная кора; ; трабекулярная кость; ; кровь; ; кора мозжечка; ; полушарие мозжечка; ; энторинальная кора;
	Верх выражен в
	доля мозжечка; ; семенной каналец; ; червь мозжечка; ; латеральное септальное ядро; ; поясничный спинномозговой ганглий; ; прилежащее ядро; ; нервный слой сетчатки; ; первичная моторная кора; ; нижние холмики; ; верхний шейный ганглий;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание белков; Связывание домена L27;
Клеточный компонент	постсинаптическая мембрана; мембрана; постсинаптическая плотность; соединение клетка-клетка; двуклеточный плотный контакт; плазматическая мембрана; клеточный переход; базолатеральная плазматическая мембрана; проекция нейрона; внеклеточная экзосома; пресинапс; синапс; Комплекс MPP7-DLG1-LIN7; внутриклеточная анатомическая структура;
Биологический процесс	локализация белка на базолатеральной плазматической мембране; поддержание апикальной/базальной полярности эпителиальных клеток; транспорт белков; синаптический везикулярный транспорт; развитие внутреннего уха; секреция нейромедиатора; экзоцитоз; транспорт; белок-содержащий комплексный агрегат;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	8825
	108030
	ENSG00000111052
	ENSMUSG00000019906
	О14910
	Q8JZS0
	NM_004664 ; NM_001324423
	НМ_001033223 ; НМ_001039354 ; НМ_001284329
	NP_001311352 ; NP_004655
	НП_001028395 ; НП_001034443 ; НП_001271258
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у человека

Гомолог А Lin-7 — это белок , который у людей кодируется геном LIN7A . [ ^5]^[6]^[7]

Взаимодействия

Было показано, что LIN7A взаимодействует с:

КАСК , ^[8]^[9]
DLG1 , ^[8] и
KCNJ12 . ^[8]^[10]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000111052 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000019906 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Джо К, Дерин Р., Ли М., Бредт Д.С. (июнь 1999 г.). «Характеристика MALS/Velis-1, -2 и -3: семейство гомологов млекопитающих LIN-7, обогащенных в синапсах мозга в связи с постсинаптической плотностью-95/постсинаптическим комплексом рецептора NMDA». J Neurosci . 19 (11): 4189– 99. doi : 10.1523/JNEUROSCI.19-11-04189.1999 . PMC 6782594 . PMID 10341223.
^ Bohl J, Brimer N, Lyons C, Vande Pol SB (март 2007 г.). «Белок семейства звездной пыли MPP7 образует трехкомпонентный комплекс с LIN7 и DLG1, который регулирует стабильность и локализацию DLG1 в клеточных соединениях». J Biol Chem . 282 (13): 9392– 400. doi : 10.1074/jbc.M610002200 . PMID 17237226.
^ "Ген Entrez: LIN7A lin-7 гомолог A (C. elegans)".
^ abc Leonoudakis D, Conti LR, Radeke CM, McGuire LM, Vandenberg CA (апрель 2004 г.). «Мультипротеиновый транспортный комплекс, состоящий из SAP97, CASK, Veli и Mint1, связан с внутренними выпрямляющими калиевыми каналами Kir2». J. Biol. Chem . 279 (18): 19051– 63. doi : 10.1074/jbc.M400284200 . PMID 14960569.
^ Borg JP, Straight SW, Kaech SM, de Taddéo-Borg M, Kroon DE, Karnak D, Turner RS, Kim SK, Margolis B (ноябрь 1998 г.). «Идентификация эволюционно консервативного гетеротримерного белкового комплекса, участвующего в нацеливании белков». J. Biol. Chem . 273 (48): 31633– 6. doi : 10.1074/jbc.273.48.31633 . PMID 9822620.
^ Leonoudakis D, Conti LR, Anderson S, Radeke CM, McGuire LM, Adams ME, Froehner SC, Yates JR, Vandenberg CA (май 2004 г.). «Белковый транспорт и якорные комплексы, выявленные с помощью протеомного анализа белков, связанных с внутренним выпрямительным калиевым каналом (Kir2.x)». J. Biol. Chem . 279 (21): 22331– 46. doi : 10.1074/jbc.M400285200 . PMID 15024025.

Дальнейшее чтение

Руссе Р., Фабр С., Дебуа С., Бантиньи Ф., Жалино П. (1998). «C-конец онкопротеина HTLV-1 Tax опосредует взаимодействие с доменом PDZ клеточных белков». Онкоген . 16 (5): 643–54 . doi : 10.1038/sj.onc.1201567 . PMID 9482110.
Butz S, Okamoto M, Südhof TC (1998). «Трехкомпонентный белковый комплекс с потенциалом связывания экзоцитоза синаптических везикул с клеточной адгезией в мозге». Cell . 94 (6): 773– 82. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81736-5 . PMID 9753324. S2CID 12465062.
Borg JP, Straight SW, Kaech SM, de Taddéo-Borg M, Kroon DE, Karnak D, Turner RS, Kim SK, Margolis B (1998). «Идентификация эволюционно консервативного гетеротримерного белкового комплекса, участвующего в нацеливании белков». J. Biol. Chem . 273 (48): 31633– 6. doi : 10.1074/jbc.273.48.31633 . PMID 9822620.
Borg JP, Lõpez-Figueroa MO, de Taddèo-Borg M, Kroon DE, Turner RS, Watson SJ, Margolis B (1999). «Молекулярный анализ комплекса X11-mLin-2/CASK в мозге». J. Neurosci . 19 (4): 1307– 16. doi : 10.1523/JNEUROSCI.19-04-01307.1999 . PMC 6786035 . PMID 9952408.
Perego C, Vanoni C, Villa A, Longhi R, Kaech SM, Fröhli E, Hajnal A, Kim SK, Pietrini G (1999). «PDZ-опосредованные взаимодействия сохраняют эпителиальный транспортер ГАМК на базолатеральной поверхности поляризованных эпителиальных клеток». EMBO J . 18 (9): 2384– 93. doi :10.1093/emboj/18.9.2384. PMC 1171321 . PMID 10228153.
Камберов Е., Макарова О., Ро М., Лю А., Карнак Д., Стрейт С., Марголис Б. (2000). «Молекулярное клонирование и характеристика Pals, белков, связанных с mlin-7». J. Biol. Chem . 275 (15): 11425– 31. doi : 10.1074/jbc.275.15.11425 . PMID 10753959.
Tseng TC, Marfatia SM, Bryant PJ, Pack S, Zhuang Z, O'Brien JE, Lin L, Hanada T, Chishti AH (2001). "VAM-1: новый член семейства MAGUK связывается с человеческим Veli-1 через консервативный домен". Biochim. Biophys. Acta . 1518 (3): 249– 59. doi :10.1016/s0167-4781(01)00191-9. PMID 11311936.
Harris BZ, Venkatasubrahmanyam S, Lim WA (2002). "Скоординированное сворачивание и ассоциация домена LIN-2, -7 (L27). Обязательная гетеродимеризация, участвующая в сборке сигнальных комплексов и комплексов клеточной полярности". J. Biol. Chem . 277 (38): 34902– 8. doi : 10.1074/jbc.M205856200 . PMID 12110687.
Хори К, Конно Д, Маруока Х, Собуэ К (2003). «MALS является связывающим партнером IRSp53 в межклеточных контактах». FEBS Lett . 554 ( 1– 2): 30– 4. doi : 10.1016/S0014-5793(03)01074-3 . PMID 14596909. S2CID 30329043.
Leonoudakis D, Conti LR, Radeke CM, McGuire LM, Vandenberg CA (2004). «Мультипротеиновый транспортный комплекс, состоящий из SAP97, CASK, Veli и Mint1, связан с внутренними выпрямляющими калиевыми каналами Kir2». J. Biol. Chem . 279 (18): 19051– 63. doi : 10.1074/jbc.M400284200 . PMID 14960569.
Leonoudakis D, Conti LR, Anderson S, Radeke CM, McGuire LM, Adams ME, Froehner SC, Yates JR, Vandenberg CA (2004). «Белковый транспорт и якорные комплексы, выявленные с помощью протеомного анализа белков, связанных с внутренним выпрямительным калиевым каналом (Kir2.x)». J. Biol. Chem . 279 (21): 22331– 46. doi : 10.1074/jbc.M400285200 . PMID 15024025.
Olsen O, Wade JB, Morin N, Bredt DS, Welling PA (2005). «Дифференциальная локализация белков PDZ млекопитающих Lin-7 (MALS/Veli) в почках». Am. J. Physiol. Renal Physiol . 288 (2): F345–52. doi :10.1152/ajprenal.00235.2004. PMID 15494546. S2CID 36221552.
Dode L, Andersen JP, Raeymaekers L, Missiaen L, Vilsen B, Wuytack F (2006). "Функциональное сравнение между секреторным путем Ca2+/Mn2+-АТФазы (SPCA) 1 и изоформами саркоплазматического ретикулума Ca2+-АТФазы (SERCA) 1 с помощью стационарного и транзиторного кинетического анализа". J. Biol. Chem . 280 (47): 39124– 34. doi : 10.1074/jbc.M506181200 . PMID 16192278.

Эта статья о гене на хромосоме 12 человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000111052 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000019906 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10341223-5] Джо К, Дерин Р., Ли М., Бредт Д.С. (июнь 1999 г.). «Характеристика MALS/Velis-1, -2 и -3: семейство гомологов млекопитающих LIN-7, обогащенных в синапсах мозга в связи с постсинаптической плотностью-95/постсинаптическим комплексом рецептора NMDA». J Neurosci . 19 (11): 4189– 99. doi : 10.1523/JNEUROSCI.19-11-04189.1999 . PMC 6782594 . PMID 10341223.

[pmid17237226-6] Bohl J, Brimer N, Lyons C, Vande Pol SB (март 2007 г.). «Белок семейства звездной пыли MPP7 образует трехкомпонентный комплекс с LIN7 и DLG1, который регулирует стабильность и локализацию DLG1 в клеточных соединениях». J Biol Chem . 282 (13): 9392– 400. doi : 10.1074/jbc.M610002200 . PMID 17237226.

[entrez-7] "Ген Entrez: LIN7A lin-7 гомолог A (C. elegans)".

[pmid14960569-8] Leonoudakis D, Conti LR, Radeke CM, McGuire LM, Vandenberg CA (апрель 2004 г.). «Мультипротеиновый транспортный комплекс, состоящий из SAP97, CASK, Veli и Mint1, связан с внутренними выпрямляющими калиевыми каналами Kir2». J. Biol. Chem . 279 (18): 19051– 63. doi : 10.1074/jbc.M400284200 . PMID 14960569.

[pmid9822620-9] Borg JP, Straight SW, Kaech SM, de Taddéo-Borg M, Kroon DE, Karnak D, Turner RS, Kim SK, Margolis B (ноябрь 1998 г.). «Идентификация эволюционно консервативного гетеротримерного белкового комплекса, участвующего в нацеливании белков». J. Biol. Chem . 273 (48): 31633– 6. doi : 10.1074/jbc.273.48.31633 . PMID 9822620.

[pmid15024025-10] Leonoudakis D, Conti LR, Anderson S, Radeke CM, McGuire LM, Adams ME, Froehner SC, Yates JR, Vandenberg CA (май 2004 г.). «Белковый транспорт и якорные комплексы, выявленные с помощью протеомного анализа белков, связанных с внутренним выпрямительным калиевым каналом (Kir2.x)». J. Biol. Chem . 279 (21): 22331– 46. doi : 10.1074/jbc.M400285200 . PMID 15024025.