ЛИМС2

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
ЛИМС2
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыLIMS2 , PINCH-2, PINCH2, LGMD2W, домен цинкового пальца LIM, содержащий 2, MDRCMTT
Внешние идентификаторыОМИМ : 607908; МГИ : 2385067; гомологен : 41214; GeneCards : LIMS2; OMA :LIMS2 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_001136037
NM_001161403
NM_001161404
NM_001256542
NM_017980

NM_144862
NM_001365015
NM_001379137
NM_001379138

RefSeq (белок)

NP_001129509
NP_001154875
NP_001154876
NP_001243471
NP_060450

NP_659111
NP_001351944
NP_001366066
NP_001366067

Местоположение (UCSC)Хр 2: 127,64 – 127,68 МбХр 18: 32.06 – 32.09 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Домен цинкового пальца LIM, содержащий 2, представляет собой белок , который у людей кодируется геном LIMS2 . ​​[5]

Функция

Этот ген кодирует член небольшого семейства фокальных адгезионных белков, который взаимодействует с ILK (интегрин-связанная киназа), белком, который осуществляет белок-белковые взаимодействия с внеклеточным матриксом. Кодируемый белок имеет пять доменов LIM, каждый домен образует два цинковых пальца, которые обеспечивают взаимодействия, регулирующие форму и миграцию клеток. Псевдоген этого гена расположен на хромосоме 4. Для этого гена были обнаружены множественные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы. [предоставлено RefSeq, ноябрь 2011 г.].

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000072163 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000024395 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ "Ген Entrez: домен цинкового пальца LIM, содержащий 2" . Получено 06.11.2017 .

Дальнейшее чтение

  • Zhang Y, Chen K, Guo L, Wu C (2002). «Характеристика PINCH-2, нового белка фокальной адгезии, который регулирует взаимодействие PINCH-1-ILK, распространение клеток и миграцию». J. Biol. Chem . 277 (41): 38328– 38. doi : 10.1074/jbc.M205576200 . PMID  12167643.
  • Kim SK, Jang HR, Kim JH, Noh SM, Song KS, Kim MR, Kim SY, Yeom YI, Kim NS, Yoo HS, Kim YS (2006). «Эпигенетическое подавление LIMS2 при раке желудка и его ингибирующий эффект на миграцию клеток». Biochem. Biophys. Res. Commun . 349 (3): 1032– 40. doi :10.1016/j.bbrc.2006.08.128. PMID  16959213.
  • Davila S, Froeling FE, Tan A, Bonnard C, Boland GJ, Snippe H, Hibberd ML, Seielstad M (2010). «Новые генетические ассоциации, обнаруженные в исследовании реакции хозяина на вакцину против гепатита B». Genes Immun . 11 (3): 232– 8. doi : 10.1038/gene.2010.1 . PMID  20237496.
  • Yuan Y, Dong HP, Nymoen DA, Nesland JM, Wu C, Davidson B (2011). "Экспрессия PINCH-2 при раке, включающем серозные выпоты, с использованием количественной ПЦР". Cytopathology . 22 (1): 22– 9. doi :10.1111/j.1365-2303.2010.00757.x. PMC  3225403 . PMID  20500520.
  • Park CH, Rha SY, Ahn JB, Shin SJ, Kwon WS, Kim TS, An S, Kim NK, Yang WI, Chung HC (2015). «PINCH-2 представляет функциональную вариацию числа копий и подавляет миграцию клеток рака толстой кишки с помощью паракринной активности». Int. J. Cancer . 136 (10): 2273– 83. doi : 10.1002/ijc.29273 . PMID  25346044. S2CID  2850271.
  • Chardon JW, Smith AC, Woulfe J, Pena E, Rakhra K, Dennie C, Beaulieu C, Huang L, Schwartzentruber J, Hawkins C, Harms MB, Dojeiji S, Zhang M, Majewski J, Bulman DE, Boycott KM, Dyment DA (2015). «Мутации LIMS2 связаны с новой мышечной дистрофией, тяжелой кардиомиопатией и треугольными языками». Clin. Genet . 88 (6): 558– 64. doi :10.1111/cge.12561. PMID  25589244. S2CID  23714774.


В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .

Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=LIMS2&oldid=1142687495"