белок, связанный с рецептором ЛПНП
Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

LRPAP1
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыLRPAP1 , A2MRAP, A2RAP, HBP44, MRAP, MYP23, RAP, альфа-2-MRAP, белок, связанный с рецептором ЛПНП, белок, связанный с рецептором ЛПНП 1
Внешние идентификаторыОМИМ : 104225; МГИ : 96829; гомологен : 37612; GeneCards : LRPAP1; OMA :LRPAP1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

4043

16976

Ансамбль

ENSG00000163956

ENSMUSG00000029103

UniProt

Р30533

Р55302

РефСек (мРНК)

NM_002337

NM_013587

RefSeq (белок)

NP_002328

NP_038615

Местоположение (UCSC)Хр 4: 3,5 – 3,53 МбХр 5: 35.25 – 35.26 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши
Семейство белков
Альфа-2-MRAP_N
Модель Хэддока комплекса между двойным модулем lrp, cr56, и первым доменом рецептор-ассоциированного белка, rap-d1.
Идентификаторы
СимволАльфа-2-MRAP_N
ПфамПФ06400
ИнтерПроIPR009066
СКОП21lre / SCOPe / SUPFAM
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры
Семейство белков
Альфа-2-MRAP_C
структура решения домена 3 рапа
Идентификаторы
СимволАльфа-2-MRAP_C
ПфамПФ06401
ИнтерПроIPR010483
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры

Белок 1, связанный с рецептором липопротеинов низкой плотности, также известный как LRPAP1 или RAP, представляет собой белок- шаперон , который у людей кодируется геном LRPAP1 . [ 5] [6]

Функция

LRPAP1 участвует в транспортировке некоторых членов семейства рецепторов ЛПНП , включая LRP1 и LRP2 . [7] Это гликопротеин , который связывается с рецептором альфа-2-макроглобулина, а также с другими членами семейства рецепторов липопротеинов низкой плотности . Он действует, ингибируя связывание всех известных лигандов для этих рецепторов, и может предотвращать агрегацию и деградацию рецепторов в эндоплазматическом ретикулуме, тем самым действуя как молекулярный шаперон . [8] Он может находиться под регуляторным контролем кальмодулина, поскольку он способен связывать кальмодулин и фосфорилироваться кальмодулин-зависимой киназой II.

Взаимодействия

Было показано, что белок, связанный с рецептором ЛПНП, взаимодействует с LRP2 . [9] [10]

Белки, метаболизирующие липиды, могут повышать восприимчивость к деменции, что приводит к различиям в генетическом составе. [11] Метод полиморфизма длины фрагмента рестрикции ПЦР используется для генотипирования вставки/делеции интрона 5 LRPAP1 . [11] Исследования показали, что генотип DD и аллель *D гена LRPAP показали повышенную частоту дегенеративных деменций по сравнению с контрольной группой, и что аллель LRPAP1-D значительно увеличивает уязвимость к дегенеративным деменциям. [11] При генотипировании полиморфизм LRPAP1 наблюдается из-за вставки 37 пар оснований в интроне 5. [11] Кроме того, аллель вставки, который больше аллеля делеции, позволяет обнаруживать различия с помощью гель-электрофореза. [12] Подавление домена связывания рецептора LRP LDLR происходит из-за сверхэкспрессии LRPAP (белковый продукт гена LRPAP). [13] LRP обеспечивает защиту ЛПНП с помощью LRPAP, и его подавление может быть подвергнуто повышению ЛПНП и нейрональной токсичности, связанной с Ab, поскольку LRP поддерживает связывание лиганда и интернализацию лигандов LRP, таких как обогащенный апо-E холестерин ЛПНП и белок Ab. [11] Вставка/делеция является интронным полиморфизмом гена LRPAP, влияющим на генотип DD и аллель D для синтеза белка LRPAP, что может быть механизмом, опосредованным lrp, способствующим деменции. [11] Опасения по поводу развития чувствительности к деменции обусловлены несколькими общими генетическими платформами, и генотип DD или аллель D гена LRPAP могут быть одной из них. [11] Таким образом, вставка/делеция 37 п.н., которая изучалась как интронный полиморфизм, могла иметь непреднамеренное стремление к белку липидного рецептора путем регуляции экспрессии LRPAP, или она могла находиться в неравновесном сцеплении в дополнение к другому биологически значимому полиморфизму в LRPAP1 или соседнем гене в хромосоме 4. [14] Результаты согласуются с более ранним исследованием, в котором авторы наделили частоту аллеля делеции явно высокой у пациентов с болезнью Альцгеймера с поздним началом по сравнению с недементированными пожилыми людьми контрольной группы. [14]

Менделевские формы миопии были выявлены в четырех кровнородственных семьях и являются вероятными причинными мутациями, реализующими экзом/аутозигому, исследованными для распознавания гомозиготных укороченных вариантов в LRPAP1. [15] Влияя на активность TGF-β , шаперон LRP1 кодируется LRPAP1. В частности, выраженный дефицит LRP1 и повышенная регуляция TGF-β в клетках пораженных людей, известные данные согласуются с важностью TGF-β в ремоделировании склеры миопии и повышенной частотой у людей с миопией, имеющих синдром Марфана , который имеет характеристики повышенной регуляции сигнализации TGF-β. [16] Анализ отсутствия нормального белка был проведен с помощью иммуноблота для пораженных людей, имеющих мутации LRPAP1, выявляя мутации в LRPAP1, вероятность мутаций потери функции. [15] Кодирование (белка 1, связанного с рецептором липопротеинов низкой плотности) LRPAP является широко экспрессируемым геном и белком из 357 аминокислот, считающимся шапероном, связывающим и защищающим белки LRP1 и LRP2 , связанные с рецептором липопротеинов . [17] [18] Модель, предложенная в исследовании, в котором LRPAP1 приводит к дефициту LRP1 , который отвечает за нарушение регуляции TGF-β и может вызывать аномальное ремоделирование ECM при развитии глаза. [15] Наблюдение за увеличением осевой длины было одной из характерных особенностей синдрома Марфана, также приводящей к TGF-β, что подтвердило эту модель. [19] [20] Таким образом, люди с миопией, реагирующие на терапевтическую стратегию, начатую до ремоделирования ECM, могут рассматриваться как подход для людей с миопией, связанной с LRPAP1. [15]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000163956 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000029103 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Strickland DK, Ashcom JD, Williams S, Battey F, Behre E, McTigue K, Battey JF, Argraves WS (июль 1991 г.). «Первичная структура белка, ассоциированного с рецептором альфа-2-макроглобулина. Человеческий гомолог антигена нефрита Хеймана». Журнал биологической химии . 266 (20): 13364– 9. doi : 10.1016/S0021-9258(18)98848-4 . PMID  1712782.
  6. ^ Korenberg JR, Argraves KM, Chen XN, Tran H, Strickland DK, Argraves WS (июль 1994 г.). «Хромосомная локализация человеческих генов для семейства рецепторов ЛПНП гликопротеина 330 (LRP2) и связанного с ним белка RAP (LRPAP1)». Genomics . 22 (1): 88– 93. doi :10.1006/geno.1994.1348. PMID  7959795.
  7. ^ «Ген Энтреза: белок 1, связанный с рецептором липопротеинов низкой плотности LRPAP1».
  8. ^ Nielsen PR, Ellgaard L, Etzerodt M, Thogersen HC, Poulsen FM (июль 1997 г.). «Структура раствора N-концевого домена белка, ассоциированного с рецептором альфа2-макроглобулина». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (14): 7521– 5. Bibcode : 1997PNAS...94.7521N. doi : 10.1073 /pnas.94.14.7521 . PMC 23854. PMID  9207124. 
  9. ^ Lou X, McQuistan T, Orlando RA, Farquhar MG (апрель 2002 г.). «GAIP, GIPC и Galphai3 концентрируются в эндоцитарных компартментах клеток проксимальных канальцев: предполагаемая роль в регуляции функции мегалина». Журнал Американского общества нефрологии . 13 (4): 918–27 . doi : 10.1681/ASN.V134918 . PMID  11912251.
  10. ^ Orlando RA, Farquhar MG (апрель 1994 г.). «Функциональные домены рецептор-ассоциированного белка (RAP)». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (8): 3161– 5. Bibcode : 1994PNAS...91.3161O. doi : 10.1073/pnas.91.8.3161 . PMC 43535. PMID  7512726 . 
  11. ^ abcdefg Pandey P, Pradhan S, Mittal B (2008). «LRP-ассоциированный ген белка (LRPAP1) и восприимчивость к дегенеративной деменции». Genes, Brain and Behavior . 7 (8): 943–950 . doi : 10.1111/j.1601-183X.2008.00436.x . PMID  18721259. S2CID  19207648.
  12. ^ Pandey P, Pradhan S, Mittal B (2008). «LRP-ассоциированный ген белка (LRPAP1) и восприимчивость к дегенеративной деменции». Genes, Brain and Behavior . 7 (8): 943–50 . doi : 10.1111/j.1601-183X.2008.00436.x . PMID  18721259. S2CID  19207648.
  13. ^ Willnow TE, Sheng Z, Ishibashi S, Herz J (1994). «Ингибирование захвата остатков хиломикронов в печени путем переноса гена антагониста рецептора». Science . 264 (5164): 1471– 4. Bibcode :1994Sci...264.1471W. doi :10.1126/science.7515194. PMID  7515194.
  14. ^ ab Sánchez L, Alvarez V, González P, González I, Alvarez R, Coto E (2001). «Изменение в гене белка, ассоциированного с LRP (LRPAP1), связано с болезнью Альцгеймера с поздним началом». American Journal of Medical Genetics . 105 (1): 76– 8. doi :10.1002/1096-8628(20010108)105:1<76::aid-ajmg1066>3.3.co;2-i. PMID  11425005.
  15. ^ abcd Aldahmesh MA, Khan AO, Alkuraya H, Adly N, Anazi S, Al-Saleh AA, Mohamed JY, Hijazi H, Prabakaran S, Tacke M, Al-Khrashi A, Hashem M, Reinheckel T, Assiri A, Alkuraya FS (2013-08-08). «Мутации в LRPAP1 связаны с тяжелой миопией у людей». Am J Hum Genet . 93 (2): 313– 20. doi :10.1016/j.ajhg.2013.06.002. PMC 3738831. PMID  23830514 . 
  16. ^ Aldahmesh MA, Khan AO, Alkuraya H, Adly N, Anazi S, Al-Saleh AA, Mohamed JY, Hijazi H, Prabakaran S, Tacke M, Al-Khrashi A, Hashem M, Reinheckel T, Assiri A, Alkuraya FS (2013). «Мутации в LRPAP1 связаны с тяжелой миопией у людей». American Journal of Human Genetics . 93 (2): 313– 20. doi :10.1016/j.ajhg.2013.06.002. PMC 3738831 . PMID  23830514. 
  17. ^ Willnow TE, Armstrong SA, Hammer RE, Herz J (1995). «Функциональная экспрессия белка, связанного с рецептором липопротеина низкой плотности, контролируется белком, связанным с рецептором in vivo». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (10): 4537– 41. Bibcode : 1995PNAS...92.4537W. doi : 10.1073/pnas.92.10.4537 . PMC 41979. PMID  7538675 . 
  18. ^ Willnow TE, Rohlmann A, Horton J, Otani H, Braun JR, Hammer RE, Herz J (1996). "RAP, специализированный шаперон, предотвращает вызванное лигандом удержание ER и деградацию эндоцитарных рецепторов, связанных с рецепторами ЛПНП". The EMBO Journal . 15 (11): 2632– 9. doi :10.1002/j.1460-2075.1996.tb00623.x. PMC 450198. PMID  8654360. 
  19. ^ Лоис Б.Л., Дитц Х.К., Браверман А.К., Каллеварт Б.Л., Де Бакер Дж., Деверо Р.Б., Хилхорст-Хофсти Ю., Жондо Г., Фавр Л., Милевич Д.М., Пьеритц Р.Э., Спонселлер П.Д., Вордсворт П., Де Паепе А.М. (2010). «Пересмотренная Гентская нозология синдрома Марфана». Журнал медицинской генетики . 47 (7): 476–85 . doi :10.1136/jmg.2009.072785. hdl : 1854/LU-1013955 . PMID  20591885. S2CID  13895128.
  20. ^ Brooke BS, Habashi JP, Judge DP, Patel N, Loeys B, Dietz HC (2008). «Блокада ангиотензина II и расширение корня аорты при синдроме Марфана». The New England Journal of Medicine . 358 (26): 2787– 95. doi :10.1056/NEJMoa0706585. PMC 2692965. PMID  18579813 . 

Дальнейшее чтение

  • Carter CJ (2007). «Конвергенция генов, вовлеченных в болезнь Альцгеймера, на челноке холестерина в мозге: APP, холестерин, липопротеины и атеросклероз». Neurochemistry International . 50 (1): 12– 38. doi :10.1016/j.neuint.2006.07.007. PMID  16973241. S2CID  33569371.
  • Williams SE, Ashcom JD, Argraves WS, Strickland DK (май 1992). «Новый механизм контроля активности рецептора альфа-2-макроглобулина/протеина, связанного с рецептором липопротеина низкой плотности. Множественные регуляторные сайты для протеина, связанного с рецептором 39-кДа». Журнал биологической химии . 267 (13): 9035– 40. doi : 10.1016/S0021-9258(19)50384-2 . PMID  1374383.
  • Kounnas MZ, Argraves WS, Strickland DK (октябрь 1992 г.). «Белок, ассоциированный с рецептором 39 кДа, взаимодействует с двумя членами семейства рецепторов липопротеинов низкой плотности, рецептором альфа-2-макроглобулина и гликопротеином 330». Журнал биологической химии . 267 (29): 21162– 6. doi : 10.1016/S0021-9258(19)36811-5 . PMID  1400426.
  • Strickland DK, Ashcom JD, Williams S, Battey F, Behre E, McTigue K, Battey JF, Argraves WS (июль 1991 г.). «Первичная структура белка, ассоциированного с рецептором альфа-2-макроглобулина. Человеческий гомолог антигена нефрита Хеймана». Журнал биологической химии . 266 (20): 13364– 9. doi : 10.1016/S0021-9258(18)98848-4 . PMID  1712782.
  • Herz J, Goldstein JL, Strickland DK, Ho YK, Brown MS (ноябрь 1991 г.). «39-кДа белок модулирует связывание лигандов с белком, связанным с рецептором липопротеинов низкой плотности/альфа-2-макроглобулиновым рецептором». Журнал биологической химии . 266 (31): 21232– 8. doi : 10.1016/S0021-9258(18)54845-6 . PMID  1718973.
  • Furukawa T, Ozawa M, Huang RP, Muramatsu T (август 1990 г.). «Гепаринсвязывающий белок, экспрессия которого увеличивается во время дифференциации клеток эмбриональной карциномы в клетки париетальной эндодермы: клонирование кДНК и анализ последовательности». Журнал биохимии . 108 (2): 297–302 . CiteSeerX  10.1.1.1025.9536 . doi :10.1093/oxfordjournals.jbchem.a123197. PMID  2229028.
  • Herz J, Hamann U, Rogne S, Myklebost O, Gausepohl H, Stanley KK (декабрь 1988 г.). «Расположение на поверхности и высокое сродство к кальцию 500-кДа мембранного белка печени, тесно связанного с рецептором ЛПНП, предполагают физиологическую роль в качестве рецептора липопротеина». The EMBO Journal . 7 (13): 4119– 27. doi :10.1002/j.1460-2075.1988.tb03306.x. PMC  455121 . PMID  3266596.
  • Zheng G, Bachinsky DR, Stamenkovic I, Strickland DK, Brown D, Andres G, McCluskey RT (апрель 1994 г.). «Распределение по органам у крыс двух членов семейства генов рецепторов липопротеинов низкой плотности, gp330 и LRP/альфа 2MR, и рецептор-ассоциированный белок (RAP)». Журнал гистохимии и цитохимии . 42 (4): 531– 42. doi : 10.1177/42.4.7510321 . PMID  7510321.
  • Orlando RA, Farquhar MG (апрель 1994 г.). «Функциональные домены рецептор-ассоциированного белка (RAP)». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (8): 3161– 5. Bibcode : 1994PNAS...91.3161O. doi : 10.1073/pnas.91.8.3161 . PMC  43535. PMID  7512726 .
  • Jou YS, Goold RD, Myers RM (ноябрь 1994 г.). «Локализация гена белка 1, ассоциированного с рецептором альфа-2-макроглобулина (LRPAP1), и других фрагментов генов на хромосоме человека 4p16.3 путем прямого отбора кДНК». Genomics . 24 (2): 410– 3. doi : 10.1006/geno.1994.1643 . PMID  7535288.
  • Argraves KM, Battey FD, MacCalman CD, McCrae KR, Gåfvels M, Kozarsky KF, Chappell DA, Strauss JF, Strickland DK (ноябрь 1995 г.). «Рецептор липопротеинов очень низкой плотности опосредует клеточный катаболизм липопротеинлипазы и комплексов ингибитора активатора урокиназы и плазминогена I типа». Журнал биологической химии . 270 (44): 26550– 7. doi : 10.1074/jbc.270.44.26550 . PMID  7592875.
  • Bu G, Geuze HJ, Strous GJ, Schwartz AL (май 1995). "39 kDa рецептор-ассоциированный белок является резидентным белком ER и молекулярным шапероном для белка, связанного с рецептором ЛПНП". The EMBO Journal . 14 (10): 2269– 80. doi :10.1002/j.1460-2075.1995.tb07221.x. PMC  398334 . PMID  7774585.
  • Van Leuven F, Hilliker C, Serneels L, Umans L, Overbergh L, De Strooper B, Fryns JP, Van den Berghe H (январь 1995 г.). «Клонирование, характеристика и хромосомная локализация в 4p16 человеческого гена (LRPAP1), кодирующего белок, ассоциированный с рецептором альфа-2 макроглобулина, и структурное сравнение с мышиным геном, кодирующим белок, связывающий гепарин массой 44 кДа». Геномика . 25 (2): 492– 500. doi :10.1016/0888-7543(95)80050-V. PMID  7789983.
  • Medh JD, Fry GL, Bowen SL, Pladet MW, Strickland DK, Chappell DA (январь 1995 г.). «Белок, ассоциированный с рецептором 39 кДа, модулирует катаболизм липопротеинов путем связывания с рецепторами ЛПНП». Журнал биологической химии . 270 (2): 536– 40. doi : 10.1074/jbc.270.2.536 . PMID  7822276.
  • Korenberg JR, Argraves KM, Chen XN, Tran H, Strickland DK, Argraves WS (июль 1994 г.). «Хромосомная локализация человеческих генов для члена семейства рецепторов ЛПНП гликопротеина 330 (LRP2) и связанного с ним белка RAP (LRPAP1)». Genomics . 22 (1): 88– 93. doi :10.1006/geno.1994.1348. PMID  7959795.
  • Маруяма К, Сугано С (январь 1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
  • Willnow TE, Rohlmann A, Horton J, Otani H, Braun JR, Hammer RE, Herz J (июнь 1996 г.). "RAP, специализированный шаперон, предотвращает вызванное лигандом удержание ER и деградацию эндоцитарных рецепторов, связанных с рецепторами ЛПНП". The EMBO Journal . 15 (11): 2632– 9. doi :10.1002/j.1460-2075.1996.tb00623.x. PMC  450198. PMID  8654360 .
  • Якобсен Л., Мэдсен П., Моэструп С.К., Лунд А.Х., Томмеруп Н., Никьяер А., Соттруп-Йенсен Л., Глиманн Дж., Петерсен К.М. (декабрь 1996 г.). «Молекулярная характеристика нового человеческого рецептора гибридного типа, который связывает белок, связанный с рецептором альфа2-макроглобулина». Журнал биологической химии . 271 (49): 31379– 83. doi : 10.1074/jbc.271.49.31379 . ПМИД  8940146.
  • Bu G, Rennke S, Geuze HJ (январь 1997 г.). «Белки ERD2 опосредуют удержание ER сигнала HNEL белка, ассоциированного с рецептором LRP (RAP)». Journal of Cell Science . 110. 110 (1): 65–73 . doi :10.1242/jcs.110.1.65. PMID  9010785.
  • Petersen CM, Nielsen MS, Nykjaer A, Jacobsen L, Tommerup N, Rasmussen HH, Roigaard H, Gliemann J, Madsen P, Moestrup SK (февраль 1997 г.). «Молекулярная идентификация нового кандидата на сортировочный рецептор, очищенного из человеческого мозга с помощью аффинной хроматографии рецептор-ассоциированного белка». Журнал биологической химии . 272 ​​(6): 3599– 605. doi : 10.1074/jbc.272.6.3599 . PMID  9013611.
  • Nielsen PR, Ellgaard L, Etzerodt M, Thogersen HC, Poulsen FM (июль 1997 г.). «Структура раствора N-концевого домена белка, ассоциированного с рецептором альфа2-макроглобулина». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (14): 7521– 5. Bibcode : 1997PNAS...94.7521N. doi : 10.1073/pnas.94.14.7521 . PMC  23854. PMID  9207124 .
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR010483
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=ЛПНП-рецептор-связанный-белок-ассоциированный_белок&oldid=1217075404"