KCND2

KCND2
Идентификаторы
Псевдонимы	KCND2 , KV4.2, RK5, подсемейство D потенциалзависимых калиевых каналов, член 2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 605410; МГИ : 102663; гомологен : 40828; Генные карты : KCND2; OMA :KCND2 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 7 (человек)
Конец	120,750,337 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 6 (мышь)
Конец	21,729,804 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	червь мозжечка; ; парафлоккулус мозжечка; ; латеральная группа ядер таламуса; ; Понс; ; стромальная клетка эндометрия; ; правое полушарие мозжечка; ; Район Бродмана 23; ; префронтальная кора; ; первичная зрительная кора; ; ганглионарное возвышение;
	Верх выражен в
	доля мозжечка; ; хабенула; ; червь мозжечка; ; палец на ноге; ; медиальное коленчатое ядро; ; медиальное дорсальное ядро; ; третий палец ноги; ; обонятельный бугорок; ; прилежащее ядро; ; латеральное коленчатое ядро;
	Больше данных по справочным выражениям
	н/д
Генная онтология
Молекулярная функция	активность калиевых каналов; связывание ионов металлов; активность потенциалзависимых ионных каналов; активность ионного канала; связывание белков; Активность калиевых каналов типа А (транзиторная, выходящая наружу); активность потенциалзависимых калиевых каналов; активность потенциалзависимых ионных каналов, участвующих в регуляции постсинаптического мембранного потенциала;
Клеточный компонент	неотъемлемый компонент мембраны; перикарион; постсинаптическая мембрана; проекция клетки; мембрана; плот плазматической мембраны; внутренний компонент плазматической мембраны; комплекс потенциалзависимых калиевых каналов; плазматическая мембрана; дендритный шипик; синапс; неотъемлемый компонент плазматической мембраны; мембрана тела нейронной клетки; клеточный переход; сома; дендрит; глутаматергический синапс; ГАМК-ергический синапс; неотъемлемый компонент постсинаптической мембраны; неотъемлемый компонент постсинаптической специализации мембраны; постсинаптическая плотность;
Биологический процесс	химическая синаптическая передача; регуляция трансмембранного транспорта ионов; транспорт ионов; транспорт ионов калия; трансмембранный транспорт; Трансмембранный транспорт ионов калия; потенциал действия; сенсорное восприятие боли; гомоолигомеризация белка; клеточный ответ на гипоксию; нейронный потенциал действия; локомоторный ритм; регуляция постсинаптического мембранного потенциала; сердечная проводимость;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	3751
	16508
	ENSG00000184408
	ENSMUSG00000060882
	Q9NZV8
	Q9Z0V2
	NM_012281
	NM_019697
	NP_036413
	NP_062671
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Член 2 подсемейства потенциалзависимых калиевых каналов D — это белок , который у людей кодируется геном KCND2 . ^[5]^[6]^[7] Он вносит вклад в сердечный транзиторный выходящий калиевый ток (I _to1 ), основной ток, вносящий вклад в реполяризационную фазу 1 сердечного потенциала действия . ^[8]

Описание

Потенциал-зависимые калиевые каналы (Kv) представляют собой наиболее сложный класс потенциал-зависимых ионных каналов как с функциональной, так и со структурной точки зрения. Их разнообразные функции включают регулирование высвобождения нейротрансмиттеров, частоты сердечных сокращений, секреции инсулина, нейронной возбудимости, транспорта эпителиальных электролитов, сокращения гладких мышц и объема клеток. Четыре гена калиевых каналов, связанных с последовательностью - shaker, shaw, shab и shal - были идентифицированы у Drosophila, и было показано, что каждый из них имеет человеческий гомолог(ы). Этот ген кодирует член подсемейства калиевых каналов, потенциал-зависимых, shal-связанных, члены которого образуют активируемые напряжением калиевые ионные каналы A-типа и играют важную роль в фазе реполяризации потенциала действия. Этот член опосредует быстро инактивирующий, выходящий калиевый ток A-типа, который не находится под контролем N-конца, как в каналах Shaker. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что KCND2 взаимодействует с FLNC . ^[9]

Смотрите также

Потенциал-управляемый калиевый канал

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000184408 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000060882 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Zhu XR, Wulf A, Schwarz M, Isbrandt D, Pongs O (декабрь 1999 г.). «Характеристика человеческого Kv4.2, опосредующего быстро инактивирующий транзиторный потенциал-чувствительный ток K+». Receptors Channels . 6 (5): 387–400 . PMID 10551270.
^ Gutman GA, Chandy KG, Grissmer S, Lazdunski M, McKinnon D, Pardo LA, Robertson GA, Rudy B, Sanguinetti MC, Stuhmer W, Wang X (декабрь 2005 г.). «Международный союз фармакологии. LIII. Номенклатура и молекулярные связи потенциалзависимых калиевых каналов». Pharmacol Rev. 57 ( 4): 473– 508. doi :10.1124/pr.57.4.10. PMID 16382104. S2CID 219195192.
^ ab "Ген Entrez: потенциалзависимый калиевый канал KCND2, подсемейство, родственное Shal, член 2".
^ Oudit GY, Kassiri Z, Sah R, Ramirez RJ, Zobel C, Backx PH (май 2001 г.). «Молекулярная физиология сердечного транзиторного внешнего калиевого тока (I(to)) в нормальном и больном миокарде». J. Mol. Cell. Cardiol . 33 (5): 851– 872. doi :10.1006/jmcc.2001.1376. PMID 11343410. S2CID 829154.
^ Petrecca, K; Miller DM; Shrier A (декабрь 2000 г.). «Локализация и повышенная плотность тока калиевого канала Kv4.2 путем взаимодействия с актин-связывающим белком филамином». J. Neurosci . 20 (23): 8736– 44. doi :10.1523/JNEUROSCI.20-23-08736.2000. PMC 6773047 . PMID 11102480.

Дальнейшее чтение

Kong W, Po S, Yamagishi T и др. (1999). «Выделение и характеристика человеческого гена, кодирующего Ito: дальнейшее разнообразие путем альтернативного сплайсинга мРНК». Am. J. Physiol . 275 (6 Pt 2): H1963–70. doi :10.1152/ajpheart.1998.275.6.H1963. PMID 9843794.
Кикуно Р., Нагасе Т., Ишикава К. и др. (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XIV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». DNA Res . 6 (3): 197–205 . doi : 10.1093/dnares/6.3.197 . PMID 10470851.
Куршнер С, Юзаки М (1999). «Нейрональный интерлейкин-16 (NIL-16): белок домена PDZ с двойной функцией». J. Neurosci . 19 (18): 7770– 80. doi :10.1523/JNEUROSCI.19-18-07770.1999. PMC 6782450 . PMID 10479680.
An WF, Bowlby MR, Betty M и др. (2000). «Модуляция калиевых каналов типа А семейством кальциевых сенсоров». Nature . 403 (6769): 553– 556. Bibcode :2000Natur.403..553A. doi :10.1038/35000592. PMID 10676964. S2CID 4419472.
Isbrandt D, Leicher T, Waldschütz R и др. (2000). «Структура генов и профили экспрессии трех человеческих калиевых каналов KCND (Kv4), опосредующих токи типа A I(TO) и I(SA)». Genomics . 64 (2): 144– 154. doi :10.1006/geno.2000.6117. PMID 10729221. S2CID 1429910.
Postma AV, Bezzina CR, de Vries JF и др. (2000). «Геномная организация и хромосомная локализация двух членов семейства ионных каналов KCND, KCND2 и KCND3». Hum. Genet . 106 (6): 614– 619. doi :10.1007/s004390050033. PMID 10942109.
Petrecca K, Miller DM, Shrier A (2001). «Локализация и повышенная плотность тока калиевого канала Kv4.2 путем взаимодействия с актин-связывающим белком филамином». J. Neurosci . 20 (23): 8736– 44. doi : 10.1523/JNEUROSCI.20-23-08736.2000 . PMC 6773047 . PMID 11102480.
Bähring R, Dannenberg J, Peters HC и др. (2001). "Консервативный N-концевой домен Kv4, критически важный для эффектов белка 2.2, взаимодействующего с каналом Kv, на экспрессию и гейтирование канала". J. Biol. Chem . 276 (26): 23888– 23894. doi : 10.1074/jbc.M101320200 . PMID 11287421.
Nakamura TY, Pountney DJ, Ozaita A и др. (2001). «Роль frequenin, белка, связывающего Ca2+, как регулятора токов K+ Kv4». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 98 (22): 12808– 12813. Bibcode : 2001PNAS...9812808N. doi : 10.1073/pnas.221168498 . PMC 60135. PMID 11606724 .
Morohashi Y, Hatano N, Ohya S и др. (2002). «Молекулярное клонирование и характеристика CALP/KChIP4, нового белка EF-hand, взаимодействующего с пресенилином 2 и субъединицей потенциалзависимого калиевого канала Kv4». J. Biol. Chem . 277 (17): 14965– 14975. doi : 10.1074/jbc.M200897200 . PMID 11847232.
Eldstrom J, Doerksen KW, Steele DF, Fedida D (2002). "N-концевой домен связывания PDZ в калиевых каналах Kv1". FEBS Lett . 531 (3): 529– 537. doi :10.1016/S0014-5793(02)03572-X. PMID 12435606. S2CID 40689829.
Schrader LA, Anderson AE, Mayne A и др. (2002). «Модуляция PKA кодируемых Kv4.2 калиевых каналов типа A требует образования супрамолекулярного комплекса». J. Neurosci . 22 (23): 10123– 33. doi :10.1523/JNEUROSCI.22-23-10123.2002. PMC 6758737 . PMID 12451113.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 16903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Shin BK, Wang H, Yim AM и др. (2003). «Глобальное профилирование протеома клеточной поверхности раковых клеток обнаруживает обилие белков с функцией шаперона». J. Biol. Chem . 278 (9): 7607– 7616. doi : 10.1074/jbc.M210455200 . PMID 12493773.
Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR и др. (2003). «Человеческая хромосома 7: последовательность ДНК и биология». Science . 300 (5620): 767– 772. Bibcode :2003Sci...300..767S. doi :10.1126/science.1083423. PMC 2882961 . PMID 12690205.
Hillier LW, Fulton RS, Fulton LA и др. (2003). «Последовательность ДНК человеческой хромосомы 7». Nature . 424 (6945): 157– 164. Bibcode :2003Natur.424..157H. doi : 10.1038/nature01782 . PMID 12853948.
Wong W, Schlichter LC (2004). "Дифференциальное привлечение Kv1.4 и Kv4.2 к липидным плотам с помощью PSD-95". J. Biol. Chem . 279 (1): 444– 452. doi : 10.1074/jbc.M304675200 . PMID 14559911.
Kim LA, Furst J, Butler MH и др. (2004). «Каналы Ито представляют собой октомерные комплексы с четырьмя субъединицами каждого белка 2, взаимодействующего с Kv4.2 и K+-каналом». J. Biol. Chem . 279 (7): 5549– 5554. doi : 10.1074/jbc.M311332200 . PMID 14623880.

Внешние ссылки

Kv4.2+Potassium+Channel в рубриках медицинских предметов Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
KCND2+белок,+человек в рубриках медицинских предметов Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000184408 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000060882 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10551270-5] Zhu XR, Wulf A, Schwarz M, Isbrandt D, Pongs O (декабрь 1999 г.). «Характеристика человеческого Kv4.2, опосредующего быстро инактивирующий транзиторный потенциал-чувствительный ток K+». Receptors Channels . 6 (5): 387–400 . PMID 10551270.

[pmid16382104-6] Gutman GA, Chandy KG, Grissmer S, Lazdunski M, McKinnon D, Pardo LA, Robertson GA, Rudy B, Sanguinetti MC, Stuhmer W, Wang X (декабрь 2005 г.). «Международный союз фармакологии. LIII. Номенклатура и молекулярные связи потенциалзависимых калиевых каналов». Pharmacol Rev. 57 ( 4): 473– 508. doi :10.1124/pr.57.4.10. PMID 16382104. S2CID 219195192.

[entrez-7] "Ген Entrez: потенциалзависимый калиевый канал KCND2, подсемейство, родственное Shal, член 2".

[oudit-8] Oudit GY, Kassiri Z, Sah R, Ramirez RJ, Zobel C, Backx PH (май 2001 г.). «Молекулярная физиология сердечного транзиторного внешнего калиевого тока (I(to)) в нормальном и больном миокарде». J. Mol. Cell. Cardiol . 33 (5): 851– 872. doi :10.1006/jmcc.2001.1376. PMID 11343410. S2CID 829154.

[pmid11102480-9] Petrecca, K; Miller DM; Shrier A (декабрь 2000 г.). «Локализация и повышенная плотность тока калиевого канала Kv4.2 путем взаимодействия с актин-связывающим белком филамином». J. Neurosci . 20 (23): 8736– 44. doi :10.1523/JNEUROSCI.20-23-08736.2000. PMC 6773047 . PMID 11102480.