Криптония
| Криптония | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Супертип: | |
| Тип: | Криптония Кастель и др. 2013 |
| Сорт: | «Криптония» |
| Заказ: | "Криптониялес" |
| Семья: | "Криптониевые" |
| Генера | |
| |
Kryptonia — бактериальный тип со статусом кандидата . Является членом группы FCB . [1]
Филум был впервые предложен в 2016 году после восстановления геномов в ходе масштабной работы по добыче метагеномных и одноклеточных геномных наборов данных для нового бактериального разнообразия. [1] Обширный анализ 5,2 ТБ метагеномных данных со всего мира предполагает, что представители Kryptonia встречаются исключительно в высокотемпературных геотермальных источниках с нейтральным pH, таких как бассейн Цзиньцзе (провинция Юньнань, Китай), источник Дьюар-Крик (Британская Колумбия, Канада) и Грейт-Бойлинг-Спринг (Невада, США). [1] Из-за несовпадений праймеров представители этого типа были в значительной степени недооценены в исследованиях состава сообщества, основанных на секвенировании 16S рРНК .
Анализ первых геномов, полученных из этой группы (из четырех разных родов), показывает, что представители Kryptonia являются гетеротрофами с предполагаемой способностью к дыханию железом. [1] Предполагается, что они не способны самостоятельно производить некоторые ключевые метаболические соединения (например, биотин (также известный как витамин B7 или витамин H) и некоторые аминокислоты ), и, таким образом, могут метаболически зависеть от других микробов в своей среде, хотя природа такой связи неизвестна. [1]
Название «Криптония» происходит от греческого слова «krupton» , что означает «скрытый» или «секретный». Это намек на тип, который до сих пор не поддавался обнаружению из-за смещений праймера рРНК SSU .
Таксономия
Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих постоянное место в номенклатуре (LPSN) [2] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI). [3]
| Филогения «Криптонии» [4] [5] [6] | |||||||||||||||||||||
|
- Класс " Криптония "
- Заказать " Криптониялес "
- Семейство " Криптониевые "
- Род « Ca. Chrysopegocella» Eloe-Fadrosh et al. 2016 исправлен. Орен и др. 2020 [" Ка. Хрисопегис" (так в оригинале)]
- « Ca. Chrysopegocella kryptomonas» Eloe-Fadrosh et al. 2016 исправлен. Орен и др. 2020 год
- Род « Ca. Kryptobacter» Eloe-Fadrosh et al. 2016 год
- " Ca. Kryptobacter tengchongensis" Элоэ-Фадрош и др. 2016
- Род « Ca. Kryptonium » Eloe-Fadrosh et al. 2016 год
- « Ca. Kryptonium thompsoni» Элоэ-Фадрош и др. 2016 год
- Род « Ca. Thermokryptus» Eloe-Fadrosh et al. 2016 год
- « Ca. Thermokryptus mobilis» Eloe-Fadrosh et al. 2016 год
- Род « Ca. Chrysopegocella» Eloe-Fadrosh et al. 2016 исправлен. Орен и др. 2020 [" Ка. Хрисопегис" (так в оригинале)]
- Семейство " Криптониевые "
- Заказать " Криптониялес "
Смотрите также
Ссылки
- ^ abcde Элое-Фадрош, Эмили А.; Паез-Эспино, Дэвид; Джаретт, Джессика; Данфилд, Питер Ф.; Хедлунд, Брайан П.; Декас, Энн Э.; Грасби, Стивен Э.; Брэди, Эллисон Л.; Донг, Хайлян; Бриггс, Брэндон Р.; Ли, Вэнь-Джун (27.01.2016). "Глобальное метагеномное исследование выявило новый бактериальный кандидатный тип в геотермальных источниках". Nature Communications . 7 (1): 10476. Bibcode :2016NatCo...710476E. doi :10.1038/ncomms10476. ISSN 2041-1723. PMC 4737851 . PMID 26814032.
- ^ Euzéby JP, Parte AC. "Kryptonia". Список названий прокариот со стоянием в номенклатуре (LPSN) . Получено 7 июня 2021 г.
- ^ Sayers; et al. "Kryptonia". База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Получено 2021-03-20 .
- ^ "GTDB release 07-RS207". База данных таксономии генома . Получено 20 июня 2022 г.
- ^ "ar53_r207.sp_label". База данных таксономии генома . Получено 20 июня 2022 г.
- ^ "История таксона". База данных таксономии генома . Получено 20 июня 2022 г.
