КЦНИП1

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
КЦНИП1
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыKCNIP1 , KCHIP1, VABP, белок 1, взаимодействующий с потенциалзависимым калиевым каналом
Внешние идентификаторыОМИМ : 604660; МГИ : 1917607; гомологен : 22824; Генные карты : KCNIP1; OMA :KCNIP1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001034837
NM_001034838
NM_001278339
NM_001278340
NM_014592

NM_001190885
NM_001190886
NM_001290690
NM_027398
NM_001363115

RefSeq (белок)

NP_001030009
NP_001030010
NP_001265268
NP_001265269
NP_055407

NP_001177814
NP_001177815
NP_001277619
NP_081674
NP_001350044

Местоположение (UCSC)Хр 5: 170,35 – 170,74 МбХр 11: 33,58 – 33,94 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Белок 1, взаимодействующий с каналом K v , также известный как KChIP1, представляет собой белок , который у людей кодируется геном KCNIP1 . [ 5] [6]

Функция

Этот ген кодирует члена семейства белков, взаимодействующих с потенциалзависимыми калиевыми ( K v ) каналами (KCNIPs, также часто называемых «KChIP»), которые относятся к ветви рековерина суперсемейства EF-hand . [7] Члены семейства KCNIP являются небольшими белками, связывающими кальций. Все они имеют домены, подобные EF-hand, и отличаются друг от друга N-концом . Они являются неотъемлемыми компонентами субъединиц нативных комплексов каналов K v 4. Они могут регулировать токи А-типа и, следовательно, нейрональную возбудимость в ответ на изменения внутриклеточного кальция. Альтернативный сплайсинг приводит к множественным вариантам транскрипта, кодирующим различные изоформы. [6]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000182132 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000053519 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ An WF, Bowlby MR, Betty M, Cao J, Ling HP, Mendoza G, Hinson JW, Mattsson KI, Strassle BW, Trimmer JS, Rhodes KJ (февраль 2000 г.). «Модуляция калиевых каналов типа А семейством кальциевых сенсоров». Nature . 403 (6769): 553– 556. Bibcode :2000Natur.403..553A. doi :10.1038/35000592. PMID  10676964. S2CID  4419472.
  6. ^ ab "Ген Entrez: белок 1, взаимодействующий с Kv-каналом KCNIP1".
  7. ^ Burgoyne RD (2007). «Нейрональные кальциевые сенсорные белки: создание разнообразия в нейрональной сигнализации Ca2+». Nat. Rev. Neurosci . 8 (3): 182– 193. doi :10.1038/nrn2093. PMC 1887812 . PMID  17311005. 

Дальнейшее чтение

  • Bähring R, Dannenberg J, Peters HC и др. (2001). "Консервативный N-концевой домен Kv4, критически важный для эффектов белка 2.2, взаимодействующего с каналом Kv, на экспрессию и гейтирование канала". J. Biol. Chem . 276 (26): 23888– 23894. doi : 10.1074/jbc.M101320200 . PMID  11287421.
  • Nakamura TY, Nandi S, Pountney DJ и др. (2001). «Различные эффекты белка, связывающего Ca(2+), KChIP1, на двух членов подсемейства Kv4, Kv4.1 и Kv4.2». FEBS Lett . 499 (3): 205– 209. Bibcode : 2001FEBSL.499..205N. doi : 10.1016/S0014-5793(01)02560-1 . PMID  11423117. S2CID  23908034.
  • Куценко АС, Гизатуллин РЗ, Аль-Амин АН и др. (2002). «Фланкирующие последовательности NotI: инструмент для обнаружения генов и проверки генома человека». Nucleic Acids Res . 30 (14): 3163– 3170. doi :10.1093/nar/gkf428. PMC  135748. PMID  12136098 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 16903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Shibata R, Misonou H, Campomanes CR и др. (2003). «Фундаментальная роль KChIP в определении молекулярных свойств и трафика калиевых каналов Kv4.2». J. Biol. Chem . 278 (38): 36445– 36454. doi : 10.1074/jbc.M306142200 . PMID  12829703.
  • Van Hoorick D, Raes A, Keysers W и др. (2004). «Дифференциальная модуляция кинетики Kv4 сплайс-вариантами KCHIP1». Mol. Cell. Neurosci . 24 (2): 357– 366. doi :10.1016/S1044-7431(03)00174-X. PMID  14572458. S2CID  40647616.
  • Scannevin RH, Wang K, Jow F и др. (2004). «Два N-концевых домена каналов Kv4 K(+) регулируют связывание с KChIP1 и его модуляцию». Neuron . 41 (4): 587– 598. doi : 10.1016/S0896-6273(04)00049-2 . PMID  14980207. S2CID  17380435.
  • Lin YL, Lin SR, Wu TT, Chang LS (2004). «Доказательства межмолекулярного взаимодействия между белками KChIP и кардиотоксинами тайваньской кобры». Biochem. Biophys. Res. Commun . 319 (3): 720– 724. doi :10.1016/j.bbrc.2004.05.064. PMID  15184042.
  • Lin YL, Chen CY, Cheng CP, Chang LS (2004). «Белково-белковые взаимодействия белков KChIP и Kv4.2». Biochem. Biophys. Res. Commun . 321 (3): 606– 610. doi :10.1016/j.bbrc.2004.07.006. PMID  15358149.
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 2127. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID  15489334 .
  • Pruunsild P, Timmusk T (2005). «Структура, альтернативный сплайсинг и экспрессия семейства генов KCNIP человека и мыши». Genomics . 86 (5): 581– 593. doi :10.1016/j.ygeno.2005.07.001. PMID  16112838.
  • Pioletti M, Findeisen F, Hura GL, Minor DL ​​(2007). «Трехмерная структура комплекса KChIP1-Kv4.3 T1 обнаруживает крестообразный октамер». Nat. Struct. Mol. Biol . 13 ( 11): 987– 995. doi :10.1038/nsmb1164. PMC  3018330. PMID  17057713.{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  • Hasdemir B, Fitzgerald DJ, Prior IA, Tepikin AV, Burgoyne RD (2005). «Движение каналов Kv4 K+, опосредованное KChIP1, осуществляется через новый везикулярный путь после ЭР». J. Cell Biol . 171 (3): 459– 469. doi :10.1083/jcb.200506005. PMC  2171252. PMID  16260497 .
  • Venn N, Haynes LP, Burgoyne RD (2008). «Специфические эффекты KChIP3/calsenilin/DREAM, но не KChIPs1, 2 и 4, на сигнализацию кальция и регулируемую секрецию в клетках PC12». Biochem. J . 413 (1): 71– 80. doi :10.1042/BJ20080441. PMC  2474559 . PMID  18393943.

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .


Получено с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=KCNIP1&oldid=1234939616"