Джон Клэрди

Джон Кларди (родился 16 мая 1943 года в Вашингтоне, округ Колумбия , США) в настоящее время является профессором биологической химии и молекулярной фармакологии имени Хсиена У и Дэйзи Йен У в Гарвардской медицинской школе. ^[1] Его исследования сосредоточены на изоляции и структурной характеристике натуральных продуктов, и в настоящее время он изучает роль биологически активных малых молекул в посредничестве симбиотических взаимодействий и заболеваний. ^[2]

Клэрди вырос в Арлингтоне, штат Вирджиния , США, и был старшим из четырех детей. Он учился в Йельском университете , где получил степень бакалавра в 1964 году и был избран в общество Phi Beta Kappa . Хотя его всегда увлекала биология, во время учебы в колледже он больше заинтересовался химией. Он провел бакалаврские исследования в области органического синтеза под руководством Р. Стивена Берри , уделяя особое внимание бензину. ^[3] После окончания Йельского университета он перешел в Гарвардский университет , где в 1969 году получил степень доктора философии по химии. Затем он занял должность преподавателя на химическом факультете в Университете штата Айова , где он был связан с лабораторией Эймса. В 1978 году он перешел на химический факультет в Корнеллском университете , где оставался до 2002 года, когда он перешел на факультет биологической химии и молекулярной фармакологии в Гарвардской медицинской школе. В 2004 году он начал работу над докторской диссертацией. Программа по химической биологии со Стюартом Шрайбером и Грегом Вердином. ^[4] Он также создал и продолжает преподавать популярный курс под названием «Молекулы жизни» для студентов Гарварда, не специализирующихся в области естественных наук.

Во время обучения в докторантуре Клэрди встретил свою жену Андреа Флек, выпускницу колледжа Свортмор , которая является писательницей. Среди ее работ — детская книга, две книги о северной части штата Нью-Йорк и пьесы, которые ставились по всей стране. У них двое сыновей.

Ранние исследования Кларди были сосредоточены на выяснении структуры природных продуктов, в первую очередь, с помощью рентгеновской кристаллографии . На раннем этапе в Университете штата Айова Кларди установил важные совместные работы с Биллом Феникалом, Джоном Фолкнером и Полом Шойером, ^[5], что привело к выяснению структуры многочисленных морских природных продуктов, таких как противораковый агент бриостатин , ^[6] инсектицидный и противогрибковый джаспамид, диазонамид А и В, ^[7] и многие другие. Некоторые из его наиболее заметных ранних работ были сосредоточены на нейротоксинах, связанных с «красным приливом», что привело к определению трехмерных структур сакситоксина , ^[8] группы гониаутоксинов и циклического полиэфира бреветоксина В. ^[9] После перехода в Корнеллский университет исследования Кларди расширились и стали включать огромное разнообразие неморских организмов, включая, помимо прочего, грибы, Actinomycetota и C. elegans . Его давний интерес к эндофитным грибам привел к открытию селективно цитотоксичной хиноновой торреановой кислоты , структурно разнообразных гуанакастепенов , противогрибкового агента криптоцина и многих других.

Недавно Кларди сосредоточился на симбиотических ассоциациях между бактериями и другими организмами как богатых источниках новых малых молекул. ^[10] В сотрудничестве с Кэмероном Карри Кларди исследовал ассоциации между актиномицетами и насекомыми, такими как южный сосновый короед, муравьи и термиты, что привело к открытию противогрибковых агентов, включая дентигерумицин ^{[11] [12]} и микангимицин. ^{[13] [14]} Изучение химического обмена в сложных экологических взаимодействиях остается центральным направлением лаборатории Кларди. ^[15]

Кларди в сотрудничестве со Стюартом Шрайбером и коллегами получили кристаллическую структуру для комплексов FK506/ FKBP 12 и рапамицин /FKBP12. ^[16] Вскоре после этого Шрайбер и Кларди продолжили определять структуру комплекса FK506/рапамицин/FRAP — новаторское исследование, которое выявило способность проницаемой для клеток малой молекулы способствовать димеризации белка. ^[17] Vertex, начинающая фармацевтическая компания, была основана для разработки нетоксичной версии FK506. ^[18] В сотрудничестве с Уолтером Лилом Кларди и коллеги получили рентгеновскую кристаллическую структуру для летучего феромона насекомых бомбикола с его связывающим партнером, расположенным на усиках самок шелкопряда. ^[19] Помимо дальнейшего углубления понимания этого высокоспецифичного взаимодействия малой молекулы с белком, это исследование ознаменовало первую трехмерную структуру белка, связывающего одорант. ^[20]

Клэрди также известен своей работой по выяснению природных продуктов, производимых некультивируемыми бактериями, и считается, наряду с Джо Хандельсманом и Робертом М. Гудманом , пионером в области метагеномики . Совместно с Шоном Брэди он разработал метод вставки ДНК непосредственно из ДНК окружающей среды (eDNA), такой как почва, в библиотеки космид, поиска кластеров биосинтетических генов и идентификации продуктов этих генов. ^[21] Используя этот метод, они выяснили структуры многочисленных антибиотиков, ранее недостижимых традиционными лабораторными методами, такими как природные продукты, полученные из длинноцепочечных N-ацилтирозинов. ^[22]