Джон Х. Томас был генеральным министром и президентом Объединенной церкви Христа (UCC) , основной протестантской христианской конфессии. Избранный в 1999 году, он служил одним из пяти должностных лиц UCC, которые составляют Коллегию должностных лиц, которая курирует национальные министерства. Будучи генеральным министром и президентом, Томас был главным представителем Объединенной церкви Христа, официально представляя UCC в экуменических и межконфессиональных отношениях. Срок его полномочий закончился в октябре 2009 года.
Чикагская теологическая семинария назначила Томаса старшим советником президента и приглашенным профессором по церковному служению с 1 января 2010 года.
До того, как занять пост генерального министра и президента UCC, преподобный Томас был пастором Первой объединенной церкви Христа в Истоне, штат Пенсильвания, с 1982 по 5 января 1992 года, где его уважали и любили.