Фазовая геномика

Фазовая геномика
Тип компании	Стартап-компания
Промышленность	Биотехнология
Основан	2015
Основатели	Иван Лячко, Шон Салливан
Штаб-квартира	Сиэтл , Вашингтон, США
Ключевые люди	Иван Лячко ( генеральный директор , президент), Шон Салливан ( технический директор )
Веб-сайт	phasegenomics.com

Американская компания по геномному секвенированию

Phase Genomics — американская биотехнологическая компания, базирующаяся в Сиэтле , штат Вашингтон. Компания разрабатывает наборы для лигирования близости и технологию секвенирования Hi-C, используемую для анализа хромосом . Phase Genomics продает наборы для лигирования близости , научные услуги и вычислительный анализ.

История

Компания была основана Иваном Лячко и Шоном Салливаном в 2015 году. Первоначально она размещалась в биотехнологическом инкубаторе CoMotion в Вашингтонском университете, а затем переехала в отдельное здание. Она разрабатывает наборы для лигирования близости и технологию секвенирования Hi-C , используемую для анализа хромосом. Компания продает наборы для лигирования близости , научные услуги и вычислительный анализ. ^[1]

Исследовать

Phase Genomics разработала набор для подготовки библиотеки для метода секвенирования Hi-C, ранее разработанного исследователями Джобом Деккером и Эриком Ландером . Наборы используются для изучения архитектуры геномов. ^[2] В 2018 году Phase Genomics получила грант SBIR в размере 1,5 млн долларов США от Национального института аллергии и инфекционных заболеваний (NIAID) на исследование устойчивости к противомикробным препаратам с использованием технологии Hi-C. В январе 2020 года компания получила дополнительные 1,5 млн долларов США от NIAID на финансирование фазы 2 SBIR. ^[3] В 2019 году Phase Genomics получила 200 000 долларов США от Фонда Билла и Мелинды Гейтс на улучшение вычислительных методов извлечения геномных данных в образцах микробиома . ^[3]^[4] Позднее в 2019 году компания получила 325 000 долларов США от Министерства энергетики США на исследование биотоплива из водорослей с использованием технологии судебного преследования по принципу близости для сборки метагенома . ^[4] В 2020 году Phase Genomics получила 2 гранта на общую сумму 3,9 млн долларов от Национального института исследований генома человека и Национального института детского здоровья и развития человека имени Юнис Кеннеди Шрайвер . Трехлетние гранты финансируют исследования хромосомных аномалий, вызывающих рак, бесплодие и репродуктивные проблемы. ^[1]

В июне 2021 года компания выпустила платформу для обнаружения новых вирусов в образцах микробиома . ^[5]^[6]

Ссылки

^ ab Stiffler, Lisa (30 сентября 2020 г.). «Phase Genomics получает гранты на сумму 3,9 млн долларов на улучшение тестирования на хромосомные аномалии». GeekWire . Получено 31 января 2021 г. .
^ LeMieux, Julianna (15 ноября 2018 г.). «Precision Medicine Looks beyond DNA Sequences». Новости генной инженерии и биотехнологии . 38 (20): 1, 22, 24– 25. doi :10.1089/gen.38.20.02. ISSN 1935-472X. S2CID 239781336.
^ ab "Phase Genomics выигрывает 1,5 млн долларов за отслеживание AMR на основе лигирования близости". GenomeWeb . 7 января 2020 г. Получено 31 января 2021 г.
^ ab Kotrba, Ron (22 октября 2019 г.). «Phase Genomics получила грант DOE на исследование биотоплива из водорослей». Biodiesel Magazine . Получено 31 января 2021 г.
^ Gounot, Jean-Sebastien; Chia, Minghao; Bertrand, Denis; Saw, Woei-Yuh; Ravikrishnan, Aarthi; Low, Adrian; Ding, Yichen; Ng, Amanda Hui Qi; Tan, Linda Wei Lin; Teo, Yik-Ying; Seedorf, Henning; Nagarajan, Niranjan (13 октября 2022 г.). «Геномо-центрический анализ коротких и длинных метагеномов выявляет нехарактерное разнообразие микробиомов у жителей Юго-Восточной Азии». Nature Communications . 13 (1): 6044. Bibcode :2022NatCo..13.6044G. doi :10.1038/s41467-022-33782-z. ISSN 2041-1723. PMC 9561172. PMID 36229545 .
^ «Phase Genomics выпускает платформу для обнаружения новых вирусов в образцах микробиома». www.businesswire.com . 15 июня 2021 г. . Получено 7 декабря 2022 г. .

Внешние ссылки

Официальный сайт

[:0-1] Stiffler, Lisa (30 сентября 2020 г.). «Phase Genomics получает гранты на сумму 3,9 млн долларов на улучшение тестирования на хромосомные аномалии». GeekWire . Получено 31 января 2021 г. .

[2] LeMieux, Julianna (15 ноября 2018 г.). «Precision Medicine Looks beyond DNA Sequences». Новости генной инженерии и биотехнологии . 38 (20): 1, 22, 24– 25. doi :10.1089/gen.38.20.02. ISSN 1935-472X. S2CID 239781336.

[:1-3] "Phase Genomics выигрывает 1,5 млн долларов за отслеживание AMR на основе лигирования близости". GenomeWeb . 7 января 2020 г. Получено 31 января 2021 г.

[:2-4] Kotrba, Ron (22 октября 2019 г.). «Phase Genomics получила грант DOE на исследование биотоплива из водорослей». Biodiesel Magazine . Получено 31 января 2021 г.

[5] Gounot, Jean-Sebastien; Chia, Minghao; Bertrand, Denis; Saw, Woei-Yuh; Ravikrishnan, Aarthi; Low, Adrian; Ding, Yichen; Ng, Amanda Hui Qi; Tan, Linda Wei Lin; Teo, Yik-Ying; Seedorf, Henning; Nagarajan, Niranjan (13 октября 2022 г.). «Геномо-центрический анализ коротких и длинных метагеномов выявляет нехарактерное разнообразие микробиомов у жителей Юго-Восточной Азии». Nature Communications . 13 (1): 6044. Bibcode :2022NatCo..13.6044G. doi :10.1038/s41467-022-33782-z. ISSN 2041-1723. PMC 9561172. PMID 36229545 .

[6] «Phase Genomics выпускает платформу для обнаружения новых вирусов в образцах микробиома». www.businesswire.com . 15 июня 2021 г. . Получено 7 декабря 2022 г. .