Обратный клад с отсутствием повторов
Группа цветковых растений

Обратный клад с отсутствием повторов
Галега лекарственная
Научная классификация Редактировать эту классификацию
Королевство:Плантае
Клад :Трахеофиты
Клад :Покрытосеменные
Клад :Эвдикоты
Клад :Росиды
Заказ:Фабалес
Семья:Бобовые
Подсемейство:Мотыльковые
Клад :Мезо-Мотыльковые
Клад :Небелковая клада, накапливающая аминокислоты
Клад :Хологалегина
Клад :Инвертированная клада без повторов
(Wojciechowski et al . 2000, [1] 2004 [2] ) Wojciechowski 2013 [3]
Племена [1] [5]
Синонимы
  • Galegeae sensu lato sensu Полхилл, 1981 г.
  • клада, лишенная IR
  • ИРЛК
  • Клада травянистых растений умеренного пояса
  • ТГК

Клада с отсутствием инвертированных повторов ( IRLC ) — монофилетическая клада подсемейства цветковых растений Faboideae (или Papilionaceae). Faboideae включает большинство сельскохозяйственных бобовых . Название этой клады является неформальным и не предполагает наличия какого-либо определенного таксономического ранга , как у названий, разрешенных ICBN или ICPN . [ 3] Клада характеризуется потерей одного из двух инвертированных повторов размером 25 кб в пластидном геноме, которые встречаются у большинства наземных растений. [6] Она последовательно разрешается в молекулярных филогениях . [1] [2] [5] [6] [7] [8] [9] [10] [11] [12] [13] Предполагается, что клада отделилась от других линий бобовых 39,0 ± 2,4 миллиона лет назад (в эоцене ). [14] Он включает в себя несколько крупных родов умеренного климата, таких как Astragalus , Hedysarum , Medicago , Oxytropis , Swainsona и Trifolium .

Описание

Эта клада состоит из пяти традиционных триб ( Cicereae , Fabeae , Galegeae , Hedysareae и Trifolieae ) и нескольких родов, которые традиционно относились к трибе Millettieae : Afgekia , Callerya , Endosamara , Sarcodum , Wisteria и, возможно, Antheroporum . [3] Первые пять из этих родов были перенесены в трибу Wisterieae , так что после пересмотра триба Millettieae выпадает из клады IRLC. [4] Клада определяется как:

«Самая обширная коронная клада, демонстрирующая структурную мутацию в пластидном геноме (потеря одной копии инвертированной области повтора размером ~25 кб), гомологичную мутации, обнаруженной у Galega officinalis , Glycyrrhiza lepidota и Vicia faba , где эти таксоны являются существующими видами, включенными в коронную кладу, определяемую этим названием». [3]

Использует

В эту кладу входят съедобные растения, такие как горох, чечевица, нут, солодка, люцерна и другие.

Ссылки

  1. ^ abc Wojciechowski MF, Sanderson MJ, Steele KP, Liston A (2000). «Молекулярная филогения «умеренных травянистых племен» бобовых растений семейства мотыльковых: подход супердерева». В Herendeen PS, Bruneau A (ред.). Advances in Legume Systematics, Часть 9. Кью, Великобритания: Королевские ботанические сады. С. 277–298. ISBN 184246017X. Архивировано из оригинала (PDF) 2014-01-16 . Получено 2014-01-16 .
  2. ^ ab Wojciechowski MF, Lavin M, Sanderson MJ (2004). «Филогения бобовых (Leguminosae), основанная на анализе пластидного гена matK, разрешает множество хорошо поддерживаемых субкладов внутри семейства». Am J Bot . 91 (11): 1846–1862. doi : 10.3732/ajb.91.11.1846 . PMID  21652332.
  3. ^ abcd Войцеховский М.Ф. (2013). «На пути к новой классификации Leguminosae: наименование клад с использованием нелиннеевской филогенетической номенклатуры». S Afr J Бот . 89 : 85–93. дои : 10.1016/j.sajb.2013.06.017 .
  4. ^ ab Compton, James A.; Schrire, Brian D.; Könyves3, Kálmán; Forest, Félix; Malakasi, Panagiota; Sawai Mattapha & Sirichamorn, Yotsawate (2019). «Группа Callerya переопределена, а триба Wisterieae (Fabaceae) исправлена ​​на основе морфологии и данных из последовательностей ядерной и хлоропластной ДНК». PhytoKeys (125): 1–112. doi : 10.3897/phytokeys.125.34877 . PMC 6610001 . PMID  31303810. {{cite journal}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )
  5. ^ ab Cardoso D, Pennington RT, de Queiroz LP, Boatwright JS, Van Wyk BE, Wojciechowski MF, Lavin M (2013). «Реконструкция глубоко разветвленных связей бобовых растений с мотыльками». S Afr J Bot . 89 : 58–75. doi : 10.1016/j.sajb.2013.05.001 . hdl : 10566/3193 .
  6. ^ ab Lavin M, Doyle JJ, Palmer JD (1990). "Эволюционное значение потери инвертированного повтора хлоропластной ДНК в подсемействе бобовых Papilionoideae" (PDF) . Эволюция . 44 (2): 390–402. doi :10.2307/2409416. hdl :2027.42/137404. JSTOR  2409416. PMID  28564377.
  7. ^ Листон А. (1995). «Использование полимеразной цепной реакции для исследования потери инвертированного повтора в геноме хлоропласта бобовых». В Crisp MD, Doyle JJ (ред.). Advances in Legume Systematics, Part 7: Phylogeny . Kew, UK: Royal Botanic Gardens. pp. 31–40. ISBN 0947643796. Архивировано из оригинала 2014-01-17 . Получено 2014-01-16 .
  8. ^ Käss E, Wink M (1996). «Молекулярная эволюция Leguminosae: филогения трех подсемейств на основе rbcL -последовательностей». Biochem Syst Ecol . 24 (5): 365–378. Bibcode : 1996BioSE..24..365K. doi : 10.1016/0305-1978(96)00032-4.
  9. ^ Sanderson MJ, Wojciechowski MF (1996). «Темпы диверсификации в умеренной кладе бобовых: существует ли «так много видов» Astragalus (Fabaceae)?». Am J Bot . 83 (11): 1488–1502. doi :10.2307/2446103. JSTOR  2446103.
  10. ^ Дойл Дж.Дж., Дойл Дж.Л., Балленджер Дж.А., Диксон Э.Э., Кадзита Т., Охаши Х. (1997). «Филогения гена хлоропластов rbcL у Leguminosae: таксономические корреляции и понимание эволюции клубеньков». Я Джей Бот . 84 (4): 541–554. дои : 10.2307/2446030 . JSTOR  2446030. PMID  21708606.
  11. ^ Pennington RT, Lavin M, Ireland H, Klitgaard B, Preston J, Hu JM (2001). «Филогенетические отношения базальных бобовых с мотыльками, основанные на последовательностях интрона хлоропласта trnL». Syst Bot . 26 (3): 537–556. doi :10.1043/0363-6445-26.3.537 (неактивен 1 ноября 2024 г.).{{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на ноябрь 2024 г. ( ссылка )
  12. ^ McMahon MM, Sanderson MJ (2006). «Филогенетический суперматричный анализ последовательностей GenBank из 2228 бобовых растений семейства мотыльковых». Syst Biol . 55 (5): 818–836. doi : 10.1080/10635150600999150 . PMID  17060202.
  13. ^ Cardoso D, de Queiroz LP, Pennington RT, de Lima HC, Fonty É, Wojciechowski MF, Lavin M (2012). «Пересмотр филогении бобовых растений с мотыльками: новые идеи из всесторонне изученных линий раннего ветвления». Am J Bot . 99 (12): 1991–2013. doi :10.3732/ajb.1200380. PMID  23221500.
  14. ^ Лавин М., Херендин П.С., Войцеховски М.Ф. (2005). «Анализ эволюционных скоростей бобовых указывает на быструю диверсификацию родословных в третичный период». Syst Biol . 54 (4): 575–94. doi : 10.1080/10635150590947131 . PMID  16085576.
  • IRLC на Древе Жизни Архивировано 2013-11-12 на Wayback Machine
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Inverted_repeat-lacking_clade&oldid=1254916853"