Международный индекс протеинов

Международный индекс белков ( IPI ) — это несуществующая база данных белков , созданная в 2001 году Европейским институтом биоинформатики (EBI) и закрытая в 2011 году. Ее целью было предоставить сообществу протеомистов ресурс, позволяющий

• регистрационные номера из различных баз данных биоинформатики , которые будут сопоставлены
• полный набор белков для вида, т.е. эталонный набор

В своей последней версии IPI содержал полные справочные наборы для шести видов животных: Homo sapiens (человек), Mus musculus (мышь), Rattus norvegicus (крыса), Bos taurus (крупный рогатый скот), Gallus gallus (курица) и Danio rerio (зебра-рыба); и одного вида растений: Arabidopsis thaliana (кресс-салат Таля). Первыми были разработаны наборы данных по человеку, мышам и крысам, объединяющие информацию, взятую из баз данных Swiss-Prot , TrEMBL , Ensembl и RefSeq . ^[1]

В 2001 году, когда был запущен IPI, базы данных, каталогизирующие человеческие гены, сильно различались и имели мало связей между собой. С тех пор было получено гораздо больше данных, дающих более полную картину, и базы данных объединились для синхронизации данных. В настоящее время многие модельные организмы имеют референтный набор генов/белков, которые каталогизированы в Ensembl / UniProt соответственно, а также в других базах данных, специфичных для видов. Из-за этой избыточности IPI был закрыт в 2011 году. EBI рекомендовала пользователям своих услуг использовать номера доступа UniProtKB в качестве идентификаторов белков.

• Архив релизов IPI @ EBI