ИРФ2

ИРФ2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1IRF, 1IRG, 2IRF
Идентификаторы
Псевдонимы	IRF2 , IRF-2, фактор регуляции интерферона 2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 147576; МГИ : 96591; Гомологен : 1659; Генные карты : IRF2; OMA :IRF2 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 4 (человек)
Конец	184,474,558 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 8 (мышь)
Конец	47,300,493 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	моноцит; ; кровь; ; Ахиллово сухожилие; ; гранулоцит; ; обонятельная зона слизистой оболочки носа; ; приложение; ; селезенка; ; лимфатический узел; ; прямая кишка; ; кора правого надпочечника;
	Верх выражен в
	гранулоцит; ; кровь; ; левая кишка; ; селезенка; ; левая доля печени; ; брыжеечные лимфатические узлы; ; мышца бедра; ; тимус; ; двенадцатиперстная кишка; ; хвост эмбриона;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; ДНК-связывающая активность активатора транскрипции, специфичная для РНК-полимеразы II; связывание ДНК; РНК-полимераза II транскрипционная регуляторная область связывание ДНК-специфической последовательности; связывание белков; ДНК-связывающий фактор транскрипции активность, РНК-полимераза II-специфическая;
Клеточный компонент	ядро; фокальная адгезия; нуклеоплазма; цитозоль;
Биологический процесс	сигнальный путь, опосредованный интерфероном-гамма; пролиферация популяции клеток; свертывание крови; регуляция транскрипции, ДНК-шаблонная; отрицательная регуляция транскрипции РНК-полимеразой II; сигнальный путь интерферона I типа; транскрипция, ДНК-шаблон; положительная регуляция транскрипции РНК-полимеразой II; транскрипция РНК-полимеразой II; процесс иммунной системы;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	3660
	16363
	ENSG00000168310
	ENSMUSG00000031627
	Р14316
	Р23906
	NM_002199
	NM_008391
	NP_002190
	NP_032417
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Фактор регуляции интерферона 2 — это белок , который у человека кодируется геном IRF2 . [ ^5]

Функция

IRF2 кодирует интерферон-регулирующий фактор 2, член семейства интерферон-регулирующих транскрипционных факторов (IRF). IRF2 конкурентно ингибирует IRF1 -опосредованную транскрипционную активацию интерферонов альфа и бета, и, предположительно, других генов, которые используют IRF1 для активации транскрипции. Однако IRF2 также функционирует как транскрипционный активатор гистона H4 . ^[6]

Смотрите также

Взаимодействия

Было показано, что IRF2 взаимодействует с BRD7 , ^[7] EP300 ^[8] и PCAF . ^[8]^[9]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000168310 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000031627 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Harada H, Fujita T, Miyamoto M, Kimura Y, Maruyama M, Furia A, Miyata T, Taniguchi T (сентябрь 1989 г.). «Структурно схожие, но функционально различные факторы IRF-1 и IRF-2 связываются с теми же регуляторными элементами IFN и IFN-индуцируемых генов». Cell . 58 (4): 729– 39. doi :10.1016/0092-8674(89)90107-4. PMID 2475256. S2CID 2033941.
^ "Ген Энтреза: фактор регуляции интерферона IRF2 2".
^ Staal A, Enserink JM, Stein JL, Stein GS, van Wijnen AJ (ноябрь 2000 г.). «Молекулярная характеристика celtix-1, белка бромодомена, взаимодействующего с фактором транскрипции интерферон-регуляторным фактором 2». J. Cell. Physiol . 185 (2): 269– 79. doi :10.1002/1097-4652(200011)185:2<269::AID-JCP12>3.0.CO;2-L. PMID 11025449. S2CID 22932901.
^ ab Masumi A, Ozato K (июнь 2001 г.). «Коактиватор p300 ацетилирует регуляторный фактор интерферона-2 в клетках U937 после обработки форболовым эфиром». J. Biol. Chem . 276 (24): 20973– 80. doi : 10.1074/jbc.M101707200 . PMID 11304541.
^ Masumi A, Wang IM, Lefebvre B, Yang XJ, Nakatani Y, Ozato K (март 1999). "Ацетилаза гистонов PCAF является индуцируемым форболовым эфиром коактиватором семейства IRF, который обеспечивает повышенную чувствительность к интерферону". Mol. Cell. Biol . 19 (3): 1810– 20. doi :10.1128/MCB.19.3.1810. PMC 83974. PMID 10022868 .

Дальнейшее чтение

Harada H, Taniguchi T, Tanaka N (1999). «Роль факторов регуляции интерферона в системе интерферона и контроле роста клеток». Biochimie . 80 ( 8– 9): 641– 50. doi :10.1016/S0300-9084(99)80017-0. PMID 9865486.
Pitha PM, Au WC, Lowther W, Juang YT, Schafer SL, Burysek L, Hiscott J, Moore PA (1999). "Роль факторов регуляции интерферона (IRF) в вирус-опосредованной сигнализации и регуляции роста клеток". Biochimie . 80 ( 8– 9): 651– 8. doi : 10.1016/S0300-9084(99)80018-2 . PMID 9865487.
Itoh S, Harada H, Fujita T, Mimura T, Taniguchi T (1989). "Последовательность кДНК, кодирующая человеческий IRF-2". Nucleic Acids Res . 17 (20): 8372. doi :10.1093/nar/17.20.8372. PMC 334978. PMID 2813069 .
Harada H, Takahashi E, Itoh S, Harada K, Hori TA, Taniguchi T (1994). "Структура и регуляция генов человеческого фактора регуляции интерферона 1 (IRF-1) и IRF-2: значение для сети генов в системе интерферона". Mol. Cell. Biol . 14 (2): 1500– 9. doi :10.1128/MCB.14.2.1500. PMC 358505. PMID 7507207 .
Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, Fuldner RA, Bult CJ, Lee NH, Kirkness EF, Weinstock KG, Gocayne JD, White O (1995). «Первоначальная оценка разнообразия генов человека и моделей экспрессии на основе 83 миллионов нуклеотидов последовательности кДНК» (PDF) . Nature . 377 (6547 Suppl): 3– 174. PMID 7566098.
Sharf R, Azriel A, Lejbkowicz F, Winograd SS, Ehrlich R, Levi BZ (1995). "Анализ функционального домена белка, связывающего консенсусную последовательность интерферона (ICSBP), и его связь с факторами регуляции интерферона". J. Biol. Chem . 270 (22): 13063– 9. doi : 10.1074/jbc.270.22.13063 . PMID 7768900.
Cha Y, Deisseroth AB (1994). "Ген регуляторного фактора интерферона 2 человека. Интронно-экзонная организация и функциональный анализ 5'-фланкирующей области". J. Biol. Chem . 269 (7): 5279– 87. doi : 10.1016/S0021-9258(17)37685-8 . PMID 8106512.
Harada H, Kitagawa M, Tanaka N, Yamamoto H, Harada K, Ishihara M, Taniguchi T (1993). "Антионкогенный и онкогенный потенциалы регуляторных факторов интерферона-1 и -2". Science . 259 (5097): 971– 4. Bibcode :1993Sci...259..971H. doi :10.1126/science.8438157. PMID 8438157. S2CID 41036818.
Drew PD, Franzoso G, Carlson LM, Biddison WE, Siebenlist U, Ozato K (1996). "Фактор-регулятор интерферона-2 физически взаимодействует с NF-kappa B in vitro и ингибирует индукцию NF-kappa B главного класса гистосовместимости I и экспрессию гена бета-2-микроглобулина в трансфицированных клетках нейробластомы человека". J. Neuroimmunol . 63 (2): 157– 62. doi :10.1016/0165-5728(95)00140-9. PMID 8550813. S2CID 53166594.
Birnbaum MJ, van Zundert B, Vaughan PS, Whitmarsh AJ, van Wijnen AJ, Davis RJ, Stein GS, Stein JL (1997). "Фосфорилирование онкогенного фактора транскрипции интерферонового регуляторного фактора 2 (IRF2) in vitro и in vivo". J. Cell. Biochem . 66 (2): 175– 83. doi :10.1002/(SICI)1097-4644(19970801)66:2<175::AID-JCB5>3.0.CO;2-N. PMID 9213219. S2CID 34485265.
Masumi A, Wang IM, Lefebvre B, Yang XJ, Nakatani Y, Ozato K (1999). "Ацетилаза гистонов PCAF является индуцируемым форболовым эфиром коактиватором семейства IRF, который обеспечивает повышенную чувствительность к интерферону". Mol. Cell. Biol . 19 (3): 1810– 20. doi :10.1128/MCB.19.3.1810. PMC 83974. PMID 10022868 .
Li W, Nagineni CN, Hooks JJ, Chepelinsky AB, Egwuagu CE (1999). «Передача сигналов интерферона-гамма в клетках пигментного эпителия сетчатки человека, опосредованная факторами транскрипции STAT1, ICSBP и IRF-1». Invest. Ophthalmol. Vis. Sci . 40 (5): 976–82 . PMID 10102295.
Whitney LW, Becker KG, Tresser NJ, Caballero-Ramos CI, Munson PJ, Prabhu VV, Trent JM, McFarland HF, Biddison WE (1999). "Анализ экспрессии генов в очагах рассеянного склероза с использованием микрочипов кДНК". Ann. Neurol . 46 (3): 425– 8. doi :10.1002/1531-8249(199909)46:3<425::AID-ANA22>3.0.CO;2-O. PMID 10482277. S2CID 85574347.
Mild GC, Schmahl GE, Shayan P, Niemeyer CM (2000). «Экспрессия регуляторного фактора интерферона 1 и 2 в гемопоэтических клетках детей с ювенильным миеломоноцитарным лейкозом». Leuk. Lymphoma . 35 ( 5–6 ): 507–11 . doi :10.1080/10428199909169615. PMID 10609788.
Staal A, Enserink JM, Stein JL, Stein GS, van Wijnen AJ (2000). «Молекулярная характеристика celtix-1, бромодоменного белка, взаимодействующего с фактором транскрипции интерферона регуляторного фактора 2». J. Cell. Physiol . 185 (2): 269– 79. doi :10.1002/1097-4652(200011)185:2<269::AID-JCP12>3.0.CO;2-L. PMID 11025449. S2CID 22932901.
Ларреа Э., Альберди А., Кастельруис Ю., Бойя П., Чивейра М.П., Прието Дж. (2001). «Экспрессия подтипов интерферона-альфа в периферических мононуклеарных клетках пациентов с хроническим гепатитом С: роль интерферона-альфа-5». J. Вирусный гепатит . 8 (2): 103–10 . doi :10.1046/j.1365-2893.2001.00273.x. PMID 11264730. S2CID 55595193.
Масуми А., Озато К. (2001). «Коактиватор p300 ацетилирует регуляторный фактор интерферона-2 в клетках U937 после обработки форболовым эфиром». J. Biol. Chem . 276 (24): 20973– 80. doi : 10.1074/jbc.M101707200 . PMID 11304541.

Внешние ссылки

Медиа, связанные с фактором регуляции интерферона-2, IRF-2 на Wikimedia Commons
IRF2+белок,+человек в рубриках медицинских предметов Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 4 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000168310 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000031627 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid2475256-5] Harada H, Fujita T, Miyamoto M, Kimura Y, Maruyama M, Furia A, Miyata T, Taniguchi T (сентябрь 1989 г.). «Структурно схожие, но функционально различные факторы IRF-1 и IRF-2 связываются с теми же регуляторными элементами IFN и IFN-индуцируемых генов». Cell . 58 (4): 729– 39. doi :10.1016/0092-8674(89)90107-4. PMID 2475256. S2CID 2033941.

[6] "Ген Энтреза: фактор регуляции интерферона IRF2 2".

[pmid11025449-7] Staal A, Enserink JM, Stein JL, Stein GS, van Wijnen AJ (ноябрь 2000 г.). «Молекулярная характеристика celtix-1, белка бромодомена, взаимодействующего с фактором транскрипции интерферон-регуляторным фактором 2». J. Cell. Physiol . 185 (2): 269– 79. doi :10.1002/1097-4652(200011)185:2<269::AID-JCP12>3.0.CO;2-L. PMID 11025449. S2CID 22932901.

[pmid11304541-8] Masumi A, Ozato K (июнь 2001 г.). «Коактиватор p300 ацетилирует регуляторный фактор интерферона-2 в клетках U937 после обработки форболовым эфиром». J. Biol. Chem . 276 (24): 20973– 80. doi : 10.1074/jbc.M101707200 . PMID 11304541.

[pmid10022868-9] Masumi A, Wang IM, Lefebvre B, Yang XJ, Nakatani Y, Ozato K (март 1999). "Ацетилаза гистонов PCAF является индуцируемым форболовым эфиром коактиватором семейства IRF, который обеспечивает повышенную чувствительность к интерферону". Mol. Cell. Biol . 19 (3): 1810– 20. doi :10.1128/MCB.19.3.1810. PMC 83974. PMID 10022868 .