Inparanoid — это алгоритм , который находит ортологичные гены и паралогичные гены, которые возникли — скорее всего, путем дупликации — после некоторого события видообразования . Такие гены, кодирующие белок , называются in-paralogs , в отличие от out-paralogs (которые возникли до разделения вида). [1]
Inparanoid (с разной заглавной буквой) может относиться к программе, использующей алгоритм INPARANOID, или к производной базе данных ортологичных кластеров генов. [2]
^ Ремм, Майдо; Кристиан Э. В. Шторм; Эрик Л. Л. Зоннхаммер (2001). «Автоматическая кластеризация ортологов и паралогов из парных сравнений видов». Журнал молекулярной биологии . 314 (5): 1041–1052. CiteSeerX 10.1.1.328.6724 . doi :10.1006/jmbi.2000.5197. PMID 11743721.
^ О'Брайен, К. П.; Ремм, М.; Зоннхаммер, ЭЛЛ (2005). «Inparanoid: комплексная база данных эукариотических ортологов». Nucleic Acids Research . 33 (Database Issue): D476–80. doi :10.1093/nar/gki107. PMC 540061. PMID 15608241 .
Внешние ссылки
InПараноидальный
Эта статья по биоинформатике — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.