Имидазолглицерол-фосфатдегидратаза
| имидазолглицерол-фосфатдегидратаза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 4.2.1.19 | ||||||||
| Номер CAS | 9024-35-5 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| ИнтЭнз | IntEnz вид | ||||||||
| БРЕНДА | запись BRENDA | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme вид | ||||||||
| КЕГГ | запись KEGG | ||||||||
| МетаЦик | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| Имидазолглицерол-фосфатдегидратаза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура имидазолглицеролфосфатдегидратазы | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | ИГПД | ||||||||
| Пфам | ПФ00475 | ||||||||
| Клан ПФАМ | CL0329 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000807 | ||||||||
| ПРОСИТ | PDOC00738 | ||||||||
| СКОП2 | 1rhy / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Фермент имидазолглицеролфосфатдегидратаза ( КФ 4.2.1.19 ) катализирует химическую реакцию
- D -эритро-1-(имидазол-4-ил)глицерол 3-фосфат 3-(имидазол-4-ил)-2-оксопропилфосфат + H 2 O
Этот фермент принадлежит к семейству лиаз , а именно гидролиаз, которые расщепляют связи углерод-кислород. Систематическое название этого класса ферментов — D - эритро -1-(имидазол-4-ил)глицерол-3-фосфатгидролиаза [3-(имидазол-4-ил)-2-оксопропил-фосфат-образующая] . Другие общеупотребительные названия включают дегидратазу IGP и D - эритро -1-(имидазол-4-ил)глицерол-3-фосфатгидролиаза . Этот фермент участвует в метаболизме гистидина , поскольку он задействован в 6-м этапе биосинтеза гистидина как части девятиэтапного циклического пути.
Существуют две изоформы IGPD: IGPD1 и IGPD2. Различные изоформы высококонсервативны, и между ними различаются только 8 аминокислот. Однако эти тонкие различия влияют на их активность, но пока неизвестно, как именно.
В большинстве организмов IGPD является монофункциональным белком с молекулярной массой около 22–29 кДа . В некоторых бактериях, таких как Escherichia coli , это C-концевой домен бифункционального белка, включающего домен гистидинол-фосфатазы . [1] В E. coli это белок, кодируемый геном hisB . [2]
Ингибирование
Некоторые соединения, которые ингибируют IGPD, использовались в качестве гербицидов , поскольку у животных нет этого белка. Одним из таких ингибиторов является 3-амино-1,2,4-триазол (3-AT), который также использовался в качестве конкурентного ингибитора продукта гена дрожжей HIS3 (еще один IGPD), например, в дрожжевой двугибридной системе . [3] [4]
Структурные исследования
По состоянию на конец 2007 года для этого класса ферментов были определены 3 структуры с кодами доступа PDB 1RHY, 2AE8 и 2F1D. [5]
Ссылки
- ^ Carlomagno MS, Chiariotti L, Alifano P, Nappo AG, Bruni CB (октябрь 1988 г.). «Структура и функция гистидиновых оперонов Salmonella typhimurium и Escherichia coli K-12». J. Mol. Biol . 203 (3): 585– 606. doi :10.1016/0022-2836(88)90194-5. PMID 3062174.
- ^ Brilli, M.; Fani, R. (2004). «Молекулярная эволюция генов hisB». Журнал молекулярной эволюции . 58 (2): 225– 237. Bibcode : 2004JMolE..58..225B. doi : 10.1007/s00239-003-2547-x. PMID 15042344. S2CID 1684458.
- ^ Бреннан, МБ; Штруль, К. (1980-01-25). «Механизмы повышения экспрессии гена дрожжей в Escherichia coli». Журнал молекулярной биологии . 136 (3): 333– 338. doi :10.1016/0022-2836(80)90377-0. ISSN 0022-2836. PMID 6990004.
- ^ Кэгни, Г.; Уэтц, П.; Филдс, С. (2000). «Высокопроизводительный скрининг белок-белковых взаимодействий с использованием двухгибридного анализа». Применение химерных генов и гибридных белков — Часть C: белок-белковые взаимодействия и геномика . Методы в энзимологии. Том 328. С. 3–14 . doi :10.1016/s0076-6879(00)28386-9. ISBN 9780121822293. ISSN 0076-6879. PMID 11075334.
- ^ Glynn SE, Baker PJ, Sedelnikova SE, Davies CL, Eadsforth TC, Levy CW, Rodgers HF, Blackburn GM, Hawkes TR, Viner R, Rice DW (2005). "Структура и механизм имидазолглицеролфосфатдегидратазы". Структура . 13 (12): 1809– 17. doi : 10.1016/j.str.2005.08.012 . PMID 16338409.
Дальнейшее чтение
- AMES BN (1957). "Биосинтез гистидина; D-эритро-имидазолглицеролфосфатдегидраза". J. Biol. Chem . 228 (1): 131– 43. doi : 10.1016/S0021-9258(18)70696-0 . PMID 13475302.
