INK4 — это семейство ингибиторов циклинзависимой киназы (CKI). Члены этого семейства ( p16 INK4a , p15 INK4b , p18 INK4c , p19 INK4d ) являются ингибиторами CDK4 (отсюда их название — ингибиторы CD K4 ) и CDK6 . Другое семейство CKI, белки CIP/KIP, способны ингибировать все CDK . Усиленная экспрессия белков INK4 может привести к остановке G1, способствуя перераспределению белков Cip/Kip и блокируя активность циклина E-CDK2. В циклических клетках происходит реассортация белков Cip/Kip между CDK4/5 и CDK2 по мере того, как клетки проходят через G1. [1] Их функция, ингибирующая CDK4/6, заключается в блокировании прогрессирования клеточного цикла за пределами точки рестрикции G1 . [2] Кроме того, белки INK4 играют роль в клеточном старении , апоптозе и восстановлении ДНК . [3]
Белки INK4 являются супрессорами опухолей , а мутации, приводящие к потере функции, приводят к канцерогенезу . [4]
Белки INK4 очень похожи по структуре и функциям, с аминокислотным сходством до 85%. [1] Они содержат множественные анкириновые повторы . [3]
Локус INK4a/ARF/INK4b кодирует три гена (p15INK4b, ARF и p16INK4a) в 35-килобазном участке человеческого генома. P15INK4b имеет другую рамку считывания, которая физически отделена от p16INK4a и ARF. P16INK4a и ARF имеют разные первые экзоны, которые сплайсированы с одним и тем же вторым и третьим экзоном. Хотя эти второй и третий экзоны являются общими для p16INK4a и ARF, белки кодируются в разных рамках считывания, что означает, что p16INK4a и ARF не являются изоформами и не имеют какой-либо гомологии аминокислот. [1]
Полиморфизмы гомолога p15INK4b/p16INK4a, как было обнаружено, сегрегируют с восприимчивостью к меланоме у Xiphophorus, указывая на то, что белки INK4 участвуют в подавлении опухолей на протяжении более 350 миллионов лет. Более того, более старая система на основе INK4 получила дальнейшее развитие благодаря недавнему добавлению противоракового ответа на основе ARF. [1]
Белки INK4 являются ингибиторами клеточного цикла. Когда они связываются с CDK4 и CDK6, они вызывают аллостерическое изменение, которое приводит к образованию комплексов CDK-INK4, а не комплексов CDK-циклин. Это приводит к ингибированию фосфорилирования ретинобластомы (Rb) ниже по течению. Поэтому экспрессия p15INK4b или p16INK4A сохраняет белки семейства Rb гипофосфорилированными. Это позволяет гипофосфорилированному Rb подавлять транскрипцию генов S-фазы, вызывая остановку клеточного цикла в фазе G1. [5]
P16 образован из четырех мотивов анкириновых повторов (AR), которые демонстрируют конформацию спираль-поворот-спираль, за исключением того, что первая спираль во втором AR состоит из четырех остатков. [6] Регулирование P16 включает эпигенетический контроль и множественные факторы транскрипции. PRC1, PRC2, YY1 и Id1 играют роль в подавлении экспрессии p16INK4A, а факторы транскрипции CTCF, Sp1 и ETs активируют транскрипцию p16INK4A. [7] В экспериментах по нокауту было обнаружено, что мыши, у которых отсутствовал только p16INK4a, были более склонны к спонтанным ракам. Было обнаружено, что мыши, у которых отсутствовали как p16INK4a, так и ARF, были еще более склонны к опухолям, чем мыши, у которых отсутствовал только p16INK4a. [1]
P15 также образован из четырех мотивов анкиринового повтора (AR). Экспрессия P15INK4b индуцируется TGF-b, что указывает на его роль в качестве потенциального нисходящего эффектора остановки роста, опосредованной TGF-b. [8]
Было показано, что P18INK4c играет важную роль в модуляции TCR-опосредованной пролиферации Т-клеток. Потеря p18INK4c в Т-клетках снизила потребность в костимуляции CD28 для эффективной пролиферации Т-клеток. Другие члены семейства INK4 не повлияли на этот процесс. Кроме того, было показано, что p18INK4c преимущественно ингибирует CDK6, но не активность CDK4 в активированных Т-клетках, что предполагает, что p18INK4c может устанавливать ингибирующий порог в покоящихся Т-клетках. [9]
Клетки, содержащие онкогенные мутации in vivo, часто реагировали активацией локуса INK4A/ARF/INK4B, который кодирует белки-супрессоры опухолей INK4. Необычное геномное расположение локуса INK4a/ARF/INK4b является слабым местом в нашей противораковой защите. Это связано с тем, что три важнейших регулятора RB и p53 (регулируемых ARF) уязвимы для одной единственной небольшой делеции. Это наблюдение приводит к двум возможным противоположным выводам: либо образование опухоли не оказывает никакого давления эволюционного отбора, поскольку перекрывающийся INK4a/ARF/INK4b не подвергается отбору, либо онкогенез оказывает такое сильное давление, что целая группа генов была отобрана в локусе INK4a/ARF/INK4b для предотвращения рака. Реакция локуса INK4a/ARF/INK4b эффективно предотвращает рак, который может возникнуть в результате постоянных онкогенных мутаций, возникающих у долгоживущих млекопитающих.
Когда локус INK4a/ARF/INK4b был сверхэкспрессирован, мыши продемонстрировали 3-кратное снижение частоты спонтанных раковых заболеваний. Эти данные также указывают на то, что локус INK4a/ARF/INK4b у мышей играет роль в подавлении опухолей. [1]
Семейство INK4 вовлечено в процесс старения. Экспрессия p16INK4a увеличивается с возрастом во многих тканях грызунов и людей. [1] Также было показано, что животные с дефицитом INK4a/ARF увеличивают связанное с возрастом снижение чувствительности Т-клеток к CD3 и CD28, что является отличительной чертой старения. Кроме того, нейральные стволовые клетки животных с дефицитом Bmi-1 демонстрируют повышенную экспрессию INK4a/ARF и нарушенный регенеративный потенциал. Однако фенотип может быть восстановлен дефицитом p16INK4a, что подразумевает, что хотя p16INK4a потенциально может использоваться в качестве биомаркера физиологического, а не хронологического возраста, он также является эффектором старения. Механизм, с помощью которого он это делает, заключается в ограничении способности к самообновлению разрозненных тканей, таких как лимфоидные органы, костный мозг и головной мозг. [10]
Первоначально считалось, что каждый член семейства INK4 структурно избыточный и одинаково мощный. Однако позже было обнаружено, что члены семейства INK4 по-разному экспрессируются во время развития мыши. Разнообразие в паттерне экспрессии указывает на то, что семейство генов INK4 может иметь специфичные для клеточной линии или ткани функции. [11] Доказательства показали, что экспрессия INK4a/ARF увеличивается на ранней стадии опухолегенеза, но точные стимулы, имеющие отношение к раку, которые вызывают экспрессию локуса, неизвестны. Экспрессия p15INK4b не коррелирует с p16INK4a во многих нормальных тканях грызунов. Индукция и репрессия p15INK4b, однако, были отмечены в ответ на несколько сигнальных событий, таких как активация RAS, которые также вызывают экспрессию INK4/ARF. Активация RAS может привести к увеличению экспрессии INK4/ARF потенциально через опосредованную ERK активацию Ets1/2 для индукции p16INK4. Также были идентифицированы несколько репрессоров экспрессии INK4a/ARF/INK4b. Было показано, что белки T-box и группа поликомб подавляют p16INK4a, p15INK4b и ARF. [1]