ИМГТ

ИМГТ
Содержание
ОписаниеНуклеиновые последовательности, аминокислоты, аннотации и инструменты, связанные с адаптивной иммунной системой.
ОрганизмыПозвоночные
Дата выпуска1989 ; 36 лет назад ( 1989 )
Доступ
Веб-сайтИМГТ

IMGT или международная информационная система ImMunoGeneTics представляет собой набор баз данных и ресурсов для иммуноинформатики , в частности последовательностей генов V, D, J и C , а также предоставляет другие инструменты и данные, связанные с адаптивной иммунной системой . [1] IMGT/LIGM-DB, первая и по-прежнему самая большая база данных, размещенная как часть IMGT, содержит референтные нуклеотидные последовательности для 360 видов Т-клеточных рецепторов и молекул иммуноглобулинов по состоянию на 2023 год. [2] Эти гены кодируют белки, которые являются основой адаптивного иммунитета, что обеспечивает высокоспецифичное распознавание и память о патогенах.

История

Логотип IMGT

IMGT была основана в июне 1989 года Мари-Пол Лефран, иммунологом, работающей в Университете Монпелье . Проект был представлен на 10-м семинаре по картированию генома человека и привел к признанию регионов V, D, J и C генами. [3] Первым созданным ресурсом был IMGT/LIGM-DB, справочник по нуклеотидным последовательностям рецептора Т-клеток и иммуноглобулина человека, а позднее и позвоночных. IMGT была создана под эгидой Laboratoire d'ImmunoGénétique Moléculaire в Университете Монпелье, а также Французского национального центра научных исследований (CNRS).

Поскольку и рецепторы Т-клеток, и молекулы иммуноглобулинов строятся посредством процесса рекомбинации нуклеотидных последовательностей, аннотация областей строительных блоков и их роль уникальны в пределах генома. Для стандартизации терминологии и ссылок в 1992 году был создан IMGT-NC, признанный Международным союзом иммунологических обществ в качестве номенклатурного подкомитета. [4] Другие инструменты включают IMGT/Collier-de-Perles, метод двумерного представления аминокислотных последовательностей рецепторов, и IMGT/mAb-DB, базу данных моноклональных антител . В настоящее время поддерживаемая HLA Informatics Group , основная ссылка для человеческого HLA, база данных IPD-IMGT/HLA, частично возникла вместе с IMGT. [5] Она была объединена с базой данных иммунополиморфизма в 2003 году для формирования текущей ссылки.

С 2015 года IMGT возглавляет София Коссида. [6]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Лефранк, Мари-Поль (2014). «Гены рецепторов иммуноглобулинов и Т-клеток: IMGT® и рождение и рост иммуноинформатики». Frontiers in Immunology . 5 (22): 22. doi : 10.3389 /fimmu.2014.00022 . PMC  3913909. PMID  24600447.
  2. ^ "IMGT". Архивировано из оригинала 3 января 2023 г. Получено 12 января 2023 г.
  3. ^ Лефранк, Мари-Поль; Лефранк, Жерар (2019). «IMGT® и 30 лет иммуноинформатического понимания структуры и функции доменов антител V и C». Антитела . 8 (2): 29. doi : 10.3390/antib8020029 . PMC 6640715 . PMID  31544835. 
  4. ^ Подкомитет по номенклатуре ВОЗ-МСИС по обозначению ТКР (1993). «Номенклатура сегментов генов Т-клеточных рецепторов (ТКР) иммунной системы». Бюллетень Всемирной организации здравоохранения . 71 (1): 113–115 .
  5. ^ Робинсон, Джеймс; Баркер, Доминик Дж; ​​Георгиу, Ксения; Купер, Майкл А; Фличек, Пол; Марш, Стивен GE (2020). "База данных IPD-IMGT/HLA". Nucleic Acids Research . 48 (D1): D948 – D955 . doi :10.1093/nar/gkz950. PMC 7145640. PMID 31667505  .  
  6. ^ "IMGT About Us". Архивировано из оригинала 20 сентября 2022 г. Получено 12 января 2023 г.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=IMGT&oldid=1220854600"