домен IMD
| Домен гомологии IRSp53/MIM | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура домена rcb irsp53 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | ИМД | ||||||||
| Пфам | ПФ08397 | ||||||||
| Клан ПФАМ | CL0145 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR013606 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии домен IMD ( I RSp53 и M IM (отсутствует в метастазах ) гомология D omain) представляет собой BAR-подобный домен из приблизительно 250 аминокислот , обнаруженный на N-конце субстрата тирозинкиназы рецептора инсулина p53 (IRSp53/ BAIAP2 ) и в эволюционно связанном семействе IRSp53/MIM ( MTSS1 ). В IRSp53, повсеместном регуляторе актинового цитоскелета , домен IMD действует как консервативный домен связывания F-актина, участвующий в формировании филоподий . Индуцирующая филоподий активность IMD регулируется Cdc42 и Rac1 (Rho-семейство GTPases) и не зависит от SH3 . [1] [2] [3] Семейство IRSp53/MIM представляет собой новое семейство связывающих белков F-актина , которое включает беспозвоночных родственников:
- MIM позвоночных (отсутствует при метастазах) (MTSS1), актин -связывающий каркасный белок , который может участвовать в метастазировании рака .
- Позвоночный ABBA-1 (MTSS1L), белок, связанный с MIM .
- Специфический для мозга позвоночных ингибитор ангиогенеза 1-ассоциированный белок 2 (BAI1-ассоциированный белок 2) или субстрат тирозинкиназы рецептора инсулина p53 (IRSp53), многофункциональный адаптерный белок , который связывает Rac1 с белком 2, гомологичным верпролину семейства синдрома Вискотта-Олдрича (WAVE2/ WASF2 ), чтобы вызвать ламеллиподию или Cdc42 с Mena , чтобы вызвать филоподию . [4]
- Специфический для мозга позвоночных ингибитор ангиогенеза 1, ассоциированный с белком 2, подобные белкам 1 и 2 (белки 1 и 2, ассоциированные с белком 2 BAI1, BAIAP2L1 и BAIAP2L2).
- Drosophila melanogaster (плодовая мушка) CG32082-PA.
- Белок Caenorhabditis elegans M04F3.5.
Семейство позвоночных IRSp53/MIM делится на две основные группы: подсемейство IRSp53 и подсемейство MIM/ABBA. Предполагаемые гомологи беспозвоночных располагаются между ними. Члены подсемейства IRSp53 содержат домен SH3 , а белки подсемейства MIM/ABBA содержат домен WH2 (WASP-гомология 2) . Подсемейство позвоночных, содержащее SH3, далее делится на три группы в зависимости от наличия или отсутствия мотива WWB и половины CRIB . Домен IMD может связываться с актиновыми филаментами и объединять их в пучки, связываться с мембранами и взаимодействовать с малой ГТФазой Rac . [1] [5]
Домен IMD сворачивается в спираль из трех удлиненных альфа-спиралей и более короткой С-концевой спирали. Спираль 4 плотно прилегает к трем другим спиралям и, таким образом, представляет собой неотъемлемую часть домена. Складка домена IMD очень похожа на складку домена BAR (Bin-Amphiphysin-RVS), функционального модуля, служащего как датчиком , так и индуктором кривизны мембраны . [3] Домен IMD также известен как домен I-BAR из-за его обратной кривизны поверхности связывания мембраны по сравнению с таковой домена BAR. Домен WH2 выполняет функцию подложки. [6]
Ссылки
- ^ ab Yamagishi A, Masuda M, Ohki T, Onishi H, Mochizuki N (апрель 2004 г.). «Новый домен связывания актина/формирования филоподий, сохраняющийся в субстрате тирозинкиназы рецептора инсулина p53 и отсутствующий в белке метастазов». J. Biol. Chem . 279 (15): 14929– 36. doi : 10.1074/jbc.M309408200 . PMID 14752106.
- ^ Millard TH, Dawson J, Machesky LM (май 2007 г.). «Характеристика IRTKS, нового регулятора актина семейства IRSp53/MIM с различными свойствами связывания нитей». J. Cell Sci . 120 (Pt 9): 1663–72 . doi :10.1242/jcs.001776. PMID 17430976. S2CID 39973979.
- ^ ab Millard TH, Bompard G, Heung MY, Dafforn TR, Scott DJ, Machesky LM, Fütterer K (январь 2005 г.). «Структурная основа формирования филоподий, индуцированная доменом гомологии IRSp53/MIM человеческого IRSp53». EMBO J . 24 (2): 240– 50. doi :10.1038/sj.emboj.7600535. PMC 545821 . PMID 15635447.
- ^ Koh JT, Kook H, Kee HJ, Seo YW, Jeong BC, Lee JH, Kim MY, Yoon KC, Jung S, Kim KK (март 2004 г.). «Внеклеточный фрагмент ингибитора ангиогенеза 1, специфичного для мозга, подавляет пролиферацию эндотелиальных клеток, блокируя интегрин alphavbeta5». Exp. Cell Res . 294 (1): 172– 84. doi :10.1016/j.yexcr.2003.11.008. PMID 14980512.
- ^ Machesky LM, Johnston SA (июнь 2007 г.). «MIM: многофункциональный белок каркаса». J. Mol. Med . 85 (6): 569– 76. doi :10.1007/s00109-007-0207-0. PMID 17497115. S2CID 32096007.
- ^ Lee SH, Kerff F, Chereau D, Ferron F, Klug A, Dominguez R (февраль 2007 г.). "Структурная основа функции связывания актина в отсутствующих метастазах". Structure . 15 (2): 145–55 . doi :10.1016/j.str.2006.12.005. PMC 1853380 . PMID 17292833.
