Гамма-интерферон-индуцируемый белок Ifi-16 (Ifi-16), также известный как интерферон-индуцируемый активатор транскрипции миелоидной дифференцировки, представляет собой белок , который у человека кодируется геном IFI16 . [ 5] [6] [7]
Функция
Этот ген кодирует члена семейства цитокинов HIN-200 (гемопоэтические интерферон-индуцируемые ядерные антигены с 200 аминокислотными повторами) . Кодируемый белок содержит домены, участвующие в связывании ДНК, регуляции транскрипции и белок-белковых взаимодействиях. Белок локализуется в нуклеоплазме и ядрышках и взаимодействует с p53 . [8] Он модулирует функцию p53 и подавляет рост клеток в сигнальном пути Ras/Raf . [7] Было показано, что IFI16 играет роль в распознавании внутриклеточной ДНК [9] - отличительной черте вирусно инфицированных клеток - и также был связан с гибелью инфицированных ВИЧ хелперных CD4 T-клеток путем пироптоза , высоковоспалительной формы запрограммированной смерти клеток. [10] [11] Недавно было показано, как IFI16, будучи высвобождаемым внеклеточно, может вызывать воспаление при связывании TLR4 , действуя как DAMP . [12]
Ссылки
^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000163565 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000073491 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Trapani JA, Browne KA, Dawson MJ, Ramsay RG, Eddy RL, Show TB и др. (октябрь 1992 г.). «Новый ген, конститутивно экспрессируемый в лимфоидных клетках человека, индуцируется гамма-интерфероном в миелоидных клетках». Immunogenetics . 36 (6): 369– 376. doi :10.1007/bf00218044. PMID 1526658. S2CID 1196925.
^ Trapani JA, Dawson M, Apostolidis VA, Browne KA (декабрь 1994 г.). «Геномная организация IFI16, гена, индуцируемого интерфероном, экспрессия которого связана с дифференцировкой миелоидных клеток человека: корреляция предсказанных доменов белка с организацией экзона». Иммуногенетика . 40 (6): 415– 424. doi :10.1007/bf00177824. PMID 7959953. S2CID 2602156.
^ ab "Ген Энтреза: интерферон IFI16, гамма-индуцируемый белок 16".
^ Ouchi M, Ouchi T (январь 2008 г.). «Роль IFI16 в повреждении ДНК и контрольной точке». Frontiers in Bioscience . 13 (13): 236– 239. doi : 10.2741/2673 . PMID 17981541.
^ Unterholzner L, Keating SE, Baran M, Horan KA, Jensen SB, Sharma S, et al. (Ноябрь 2010 г.). «IFI16 — это врожденный иммунный сенсор для внутриклеточной ДНК». Nature Immunology . 11 (11): 997– 1004. doi :10.1038/ni.1932. PMC 3142795. PMID 20890285 .
^ Monroe KM, Yang Z, Johnson JR, Geng X, Doitsh G, Krogan NJ и др. (январь 2014 г.). «ДНК-сенсор IFI16 необходим для гибели лимфоидных CD4 T-клеток, абортивно инфицированных ВИЧ». Science . 343 (6169): 428– 432. Bibcode :2014Sci...343..428M. doi :10.1126/science.1243640. PMC 3976200 . PMID 24356113.
^ Doitsh G, Galloway NL, Geng X, Yang Z, Monroe KM, Zepeda O и др. (январь 2014 г.). «Смерть клеток от пироптоза приводит к истощению Т-клеток CD4 при инфекции ВИЧ-1». Nature . 505 (7484): 509– 514. Bibcode :2014Natur.505..509D. doi :10.1038/nature12940. PMC 4047036 . PMID 24356306.
^ Iannucci A, Caneparo V, Raviola S, Debernardi I, Colangelo D и др. (2020) Воспаление, опосредованное Toll-подобным рецептором 4, вызванное внеклеточным IFI16, усиливается связыванием липополисахарида. PLOS Pathogens 16(9): e1008811. https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1008811
Дальнейшее чтение
Dawson MJ, Trapani JA (январь 1995). «Ген IFI 16 кодирует ядерный белок, экспрессия которого индуцируется интерферонами в клеточных линиях миелоидного лейкоза человека». Журнал клеточной биохимии . 57 (1): 39– 51. doi :10.1002/jcb.240570106. PMID 7536752. S2CID 3007802.
Dawson MJ, Trapani JA, Briggs RC, Nicholl JK, Sutherland GR, Baker E (1995). «Тесно связанные гены, кодирующие миелоидный ядерный дифференцировочный антиген (MNDA) и IFI16, демонстрируют контрастную гемопоэтическую экспрессию». Иммуногенетика . 41 (1): 40– 43. doi :10.1007/BF00188431. PMID 7806273. S2CID 12788123.
Johnstone RW, Kerry JA, Trapani JA (июль 1998). «Человеческий интерферон-индуцируемый белок, IFI 16, является репрессором транскрипции». Журнал биологической химии . 273 (27): 17172– 17177. doi : 10.1074/jbc.273.27.17172 . PMID 9642285.
Johnstone RW, Kershaw MH, Trapani JA (август 1998 г.). «Изотипические варианты интерферон-индуцируемого транскрипционного репрессора IFI 16 возникают в результате дифференциального сплайсинга мРНК». Биохимия . 37 (34): 11924– 11931. doi :10.1021/bi981069a. PMID 9718316.
Dawson MJ, Elwood NJ, Johnstone RW, Trapani JA (октябрь 1998 г.). «Индуцируемый IFN нуклеопротеин IFI 16 экспрессируется в клетках моноцитарной линии, но быстро и заметно подавляется в других популяциях предшественников миелоидных клеток». Journal of Leukocyte Biology . 64 (4): 546– 554. doi :10.1002/jlb.64.4.546. PMID 9766636. S2CID 40241172.
Briggs LJ, Johnstone RW, Elliot RM, Xiao CY, Dawson M, Trapani JA и др. (январь 2001 г.). "Новые свойства последовательности ядерной локализации протеинкиназы CK2, регулируемой сайтом интерферон-индуцированного ядерного фактора IFI 16". The Biochemical Journal . 353 (Pt 1): 69– 77. doi :10.1042/0264-6021:3530069. PMC 1221544 . PMID 11115400.
Johnstone RW, Wei W, Greenway A, Trapani JA (декабрь 2000 г.). «Функциональное взаимодействие между p53 и индуцируемым интерфероном нуклеопротеином IFI 16». Oncogene . 19 (52): 6033– 6042. doi :10.1038/sj.onc.1204005. PMID 11146555. S2CID 13273815.
Gariglio M, Azzimonti B, Pagano M, Palestro G, De Andrea M, Valente G и др. (июль 2002 г.). «Анализ иммуногистохимической экспрессии гена IFI16, индуцируемого человеческим интерфероном, члена семейства HIN200, не ограниченного гемопоэтическими клетками». Journal of Interferon & Cytokine Research . 22 (7): 815– 821. doi : 10.1089/107999002320271413. hdl : 2318/39497 . PMID 12184920.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS и др. (декабрь 2002 г.). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (26): 16899– 16903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Измайлова Э., Бертли Ф.М., Хуан К., Макори Н., Миллер К.Дж., Янг Р.А. и др. (февраль 2003 г.). "HIV-1 Tat перепрограммирует незрелые дендритные клетки для экспрессии хемоаттрактантов для активированных Т-клеток и макрофагов". Nature Medicine . 9 (2): 191– 197. doi :10.1038/nm822. PMID 12539042. S2CID 26145639.
Clarke CJ, Apostolidis V, Hii LL, Gough DJ, Trapani JA, Johnstone RW (май 2003 г.). «Критическая роль фактора транскрипции AP-1 для конститутивной и интерферон-индуцированной экспрессии IFI 16». Journal of Cellular Biochemistry . 89 (1): 80–93 . doi :10.1002/jcb.10475. PMID 12682910. S2CID 32678644.
Xin H, Curry J, Johnstone RW, Nickoloff BJ, Choubey D (июль 2003 г.). «Роль IFI 16, члена семейства интерферон-индуцируемых белков p200, в старении эпителиальных клеток простаты». Oncogene . 22 (31): 4831– 4840. doi :10.1038/sj.onc.1206754. PMID 12894224. S2CID 21949316.
Kwak JC, Ongusaha PP, Ouchi T, Lee SW (октябрь 2003 г.). «IFI16 как отрицательный регулятор в регуляции p53 и p21(Waf1)». Журнал биологической химии . 278 (42): 40899– 40904. doi : 10.1074/jbc.M308012200 . PMID 12925527.
Aglipay JA, Lee SW, Okada S, Fujiuchi N, Ohtsuka T, Kwak JC и др. (декабрь 2003 г.). «Член семейства Pyrin, IFI16, является новым белком, связанным с BRCA1, участвующим в пути апоптоза, опосредованном p53». Oncogene . 22 (55): 8931– 8938. doi : 10.1038/sj.onc.1207057 . PMID 14654789.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, Otsuki T, Sugiyama T, Irie R и др. (Январь 2004 г.). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nature Genetics . 36 (1): 40– 45. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
Raffaella R, Gioia D, De Andrea M, Cappello P, Giovarelli M, Marconi P и др. (февраль 2004 г.). «Индуцируемый интерфероном ген IFI16 ингибирует морфогенез трубок и пролиферацию первичных, но не HPV16 E6/E7-иммортализованных человеческих эндотелиальных клеток». Experimental Cell Research . 293 (2): 331– 345. doi :10.1016/j.yexcr.2003.10.014. hdl : 2318/42932 . PMID 14729471.
Fujiuchi N, Aglipay JA, Ohtsuka T, Maehara N, Sahin F, Su GH и др. (Май 2004 г.). «Необходимость IFI16 для максимальной активации p53, индуцированной ионизирующим излучением». Журнал биологической химии . 279 (19): 20339– 20344. doi : 10.1074/jbc.M400344200 . PMID 14990579.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, et al. (Август 2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130– 12135. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446. PMID 15302935 .
