Hypsibius dujardini

Hypsibius dujardini
Научная классификация
Домен:	Эукариоты
Королевство:	Анималия
Тип:	Тихоходки
Сорт:	Eutardigrada
Заказ:	Парачела
Семья:	Гипсибииды
Род:	Гипсибиус
Разновидность:	H. дюжардини
Биномиальное имя
	Hypsibius dujardini; ( Дойер , 1840)
Синонимы
	Macrobiotus dujardini Doyère, 1840 г.;

Виды тихоходок

Hypsibius dujardini sensu lato — комплекс видов тихоходок в классе Eutardigrada . Член этого комплекса, Hypsibius exemplaris , широко используется для различных исследовательских проектов, относящихся к эволюционной биологии и астробиологии . Вид был описан Луи Мишелем Франсуа Дойером в 1840 году (как Macrobiotus dujardini ).^[1]

H. exemplaris был дифференцирован от H. dujardini sensu stricto в 2018 году. Более ранние исследования обозначали этот лабораторный вид с северо-запада Англии как H. dujardini . H. dujardini ss встречается во Франции и имеет отличия в последовательности 18S рРНК и морфологических деталях. ^[1]

Место обитания

Вид Hypsibius dujardini — тихоходка, которая предпочитает пресноводные озера, реки и ручьи. Поскольку они считаются космополитами, их географический ареал огромен. Их можно встретить в таких регионах, как тропики и полюса. ^[2]

Секвенирование генома

Геном Hypsibius exemplaris был секвенирован. ^[3]^[4] Hypsibius exemplaris имеет компактный геном и время генерации около двух недель. Его можно культивировать неограниченно долго и криоконсервировать. ^[5]

Защита ДНК

Hypsibius exemplaris содержит ортолог ядерного белка, называемого Dsup, для подавления повреждений. ^[6] Dsup связывается с нуклеосомами и защищает хроматиновую ДНК от гидроксильных радикалов , которые могут образовываться под действием ионизирующего излучения или перекиси водорода . ^[6]

Ссылки

^ аб Гонсиорек, Петр; Стек, Дэниел; Морек, Витольд; Михальчик, Лукаш (2018). «Интегративное переописание Hypsibius dujardini (Doyère, 1840), номинального таксона Hypsibioidea (Tardigrada: Eutardigrada)». Зоотакса . 4415 (1): 45–75 . doi : 10.11646/zootaxa.4415.1.2 . ПМИД 30313631.
^ МакФаттер, М.; Мейер, Х.; Хинтон, Дж. (2007). «Неарктические пресноводные тихоходки: обзор». Журнал лимнологии . 66 (1): 84. CiteSeerX 10.1.1.851.3263 . doi :10.4081/jlimnol.2007.s1.84.
^ Koutsovoulos, Georgios; Kumar, Sujai; Laetsch, Dominik R.; Stevens, Lewis; Daub, Jennifer; Conlon, Claire; Maroon, Habib; Thomas, Fran; Aboobaker, Aziz A.; Blaxter, Mark (2016). «Нет доказательств обширного горизонтального переноса генов в геноме тихоходки Hypsibius dujardini». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (18): 5053– 5058. Bibcode : 2016PNAS..113.5053K. doi : 10.1073/pnas.1600338113 . ISSN 0027-8424. PMC 4983863. PMID 27035985 .
^ Ёсида, Юки; Куцовулос, Георгиос; Лаетч, Доминик Р.; Стивенс, Льюис; Кумар, Суджай; Хорикава, Дайки Д.; Исино, Кёко; Комине, Сиори; Куниеда, Такекадзу; Томита, Масару; Блакстер, Марк; Аракава, Казухару; Тайлер-Смит, Крис (27 июля 2017 г.). «Сравнительная геномика тихоходок Hypsibius dujardini и Ramazzottius varieornatus». ПЛОС Биология . 15 (7): e2002266. дои : 10.1371/journal.pbio.2002266 . ПМЦ 5531438 . ПМИД 28749982.
^ Габриэль, В. и др. (2007). «Тихоход Hypsibius dujardini , новая модель для изучения эволюции развития». Developmental Biology . 312 (2): 545–559 . doi :10.1016/j.ydbio.2007.09.055. PMID 17996863.
^ ab Chavez C, Cruz-Becerra G, Fei J, Kassavetis GA, Kadonaga JT (октябрь 2019 г.). «Белок-супрессор повреждений тихоходок связывается с нуклеосомами и защищает ДНК от гидроксильных радикалов». eLife . 8 : e47682. doi : 10.7554/eLife.47682 . PMC 6773438 . PMID 31571581.

Внешние ссылки

Информационный бюллетень о тихоходках
Тихоходки - Фотографии и фильмы
Эдинбургский проект «Тихоходки»
Тихоходки (английский/немецкий)
Hypsibius dujardini и эволюция развития

[GąsiorekStec2018-1] аб Гонсиорек, Петр; Стек, Дэниел; Морек, Витольд; Михальчик, Лукаш (2018). «Интегративное переописание Hypsibius dujardini (Doyère, 1840), номинального таксона Hypsibioidea (Tardigrada: Eutardigrada)». Зоотакса . 4415 (1): 45–75 . doi : 10.11646/zootaxa.4415.1.2 . ПМИД 30313631.

[2] МакФаттер, М.; Мейер, Х.; Хинтон, Дж. (2007). «Неарктические пресноводные тихоходки: обзор». Журнал лимнологии . 66 (1): 84. CiteSeerX 10.1.1.851.3263 . doi :10.4081/jlimnol.2007.s1.84.

[KoutsovoulosKumar2016-3] Koutsovoulos, Georgios; Kumar, Sujai; Laetsch, Dominik R.; Stevens, Lewis; Daub, Jennifer; Conlon, Claire; Maroon, Habib; Thomas, Fran; Aboobaker, Aziz A.; Blaxter, Mark (2016). «Нет доказательств обширного горизонтального переноса генов в геноме тихоходки Hypsibius dujardini». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (18): 5053– 5058. Bibcode : 2016PNAS..113.5053K. doi : 10.1073/pnas.1600338113 . ISSN 0027-8424. PMC 4983863. PMID 27035985 .

[4] Ёсида, Юки; Куцовулос, Георгиос; Лаетч, Доминик Р.; Стивенс, Льюис; Кумар, Суджай; Хорикава, Дайки Д.; Исино, Кёко; Комине, Сиори; Куниеда, Такекадзу; Томита, Масару; Блакстер, Марк; Аракава, Казухару; Тайлер-Смит, Крис (27 июля 2017 г.). «Сравнительная геномика тихоходок Hypsibius dujardini и Ramazzottius varieornatus». ПЛОС Биология . 15 (7): e2002266. дои : 10.1371/journal.pbio.2002266 . ПМЦ 5531438 . ПМИД 28749982.

[5] Габриэль, В. и др. (2007). «Тихоход Hypsibius dujardini , новая модель для изучения эволюции развития». Developmental Biology . 312 (2): 545–559 . doi :10.1016/j.ydbio.2007.09.055. PMID 17996863.

[Chavez2019-6] Chavez C, Cruz-Becerra G, Fei J, Kassavetis GA, Kadonaga JT (октябрь 2019 г.). «Белок-супрессор повреждений тихоходок связывается с нуклеосомами и защищает ДНК от гидроксильных радикалов». eLife . 8 : e47682. doi : 10.7554/eLife.47682 . PMC 6773438 . PMID 31571581.