Реактивация клетки-хозяина

Термин «реактивация клеток-хозяев» или HCR впервые был использован для описания выживания бактериофагов, облученных УФ- излучением, которые были трансфицированы в клетки, предварительно обработанные УФ-излучением. ^[1] Сначала считалось, что это явление является результатом гомологичной рекомбинации между бактериями и фагами, но позже было признано ферментативным восстановлением. ^[2]^[3]^[4] Позднее были разработаны модификации анализа с использованием векторов плазмидной ДНК временной экспрессии на иммортализованных фибробластах , ^{[5] а позднее и на}лимфоцитах человека . ^[6]

Анализ HCR , также известный как анализ реактивации плазмиды, косвенно контролирует клеточную систему транскрипционного восстановления, которая активируется ингибированным транскрипцией повреждением, нанесенным УФ-излучением плазмиде . Учитывая, что повреждение ДНК , вызванное УФ-излучением , используется в качестве мутагена , клетка использует путь NER эксцизионной репарации нуклеотидов , который активируется искажением спирали ДНК. ^[1]

Анализ реактивации клеток-хозяев или HCR — это метод, используемый для измерения способности клетки к восстановлению ДНК при определенном изменении ДНК. В анализе HCR измеряется способность неповрежденной клетки восстанавливать экзогенную ДНК ^[7] . Клетка-хозяин трансфицируется поврежденной плазмидой , содержащей ген-репортер , обычно люциферазу , которая была дезактивирована из-за повреждения. Способность клетки восстанавливать повреждение в плазмиде после ее введения в клетку позволяет реактивировать ген-репортер. Более ранние версии этого анализа были основаны на гене хлорамфениколацетилтрансферазы (CAT) ^[5] , но версия анализа, использующая люциферазу в качестве гена-репортера, в 100 раз более чувствительна. ^[1]

Смотрите также

Ссылки

^ abc Johnson JM, Latimer JJ (2005). "Анализ репарации ДНК с использованием реактивации клеток-хозяев на основе трансфекции". Molecular Toxicology Protocols . Methods Mol. Biol. Vol. 291. pp. 321– 35. doi :10.1385/1-59259-840-4:321. ISBN 1-59259-840-4. PMC 4860737 . PMID 15502233.
^ Rupert CS, Harm W (1966). «Реактивация после фотобиологического повреждения». Adv. Radiat. Biol . Advances in Radiation Biology. 2 : 1– 81. doi :10.1016/B978-1-4832-3121-1.50006-2. ISBN 9781483231211. ISSN 0065-3292.
^ Смит К. С., Мартиньони К. Д. (декабрь 1976 г.). «Защита клеток Escherichia coli от летальных эффектов ультрафиолетового и рентгеновского облучения путем предварительного рентгеновского облучения: генетическое и физиологическое исследование». Photochem. Photobiol . 24 (6): 515–23 . doi :10.1111/j.1751-1097.1976.tb06868.x. PMID 798210. S2CID 37612164.
^ Jones DT, Robb FT, Woods DR (декабрь 1980 г.). «Влияние кислорода на выживаемость Bacteroides fragilis после дальнего ультрафиолетового облучения». J. Bacteriol . 144 (3): 1179– 81. doi :10.1128/JB.144.3.1179-1181.1980. PMC 294787. PMID 7440505 .
^ ab Protić-Sabljić M, Kraemer KH (октябрь 1985 г.). «Один димер пиримидина инактивирует экспрессию трансфицированного гена в клетках пигментной ксеродермы». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 82 (19): 6622– 6. Bibcode :1985PNAS...82.6622P. doi : 10.1073/pnas.82.19.6622 . PMC 391262 . PMID 2995975.
^ Атас ВФ, Хедаяти МА, Матаноски ГМ, Фармер ЭР, Гроссман Л (ноябрь 1991 г.). «Разработка и проверка на практике анализа восстановления ДНК в циркулирующих лимфоцитах человека». Cancer Res . 51 (21): 5786–93 . PMID 1933849.
^ Маккриди, С. (2014). Иммуноферментный анализ для измерения репарации ДНК. В P. Keohavong & SG Grant (ред.), Molecular Toxicology Protocols (т. 1105, стр. 551–564). Humana Press. doi : 10.1007/978-1-62703-739-6_38

[pmid15502233-1] Johnson JM, Latimer JJ (2005). "Анализ репарации ДНК с использованием реактивации клеток-хозяев на основе трансфекции". Molecular Toxicology Protocols . Methods Mol. Biol. Vol. 291. pp. 321– 35. doi :10.1385/1-59259-840-4:321. ISBN 1-59259-840-4. PMC 4860737 . PMID 15502233.

[RupertHarm1966-2] Rupert CS, Harm W (1966). «Реактивация после фотобиологического повреждения». Adv. Radiat. Biol . Advances in Radiation Biology. 2 : 1– 81. doi :10.1016/B978-1-4832-3121-1.50006-2. ISBN 9781483231211. ISSN 0065-3292.

[pmid798210-3] Смит К. С., Мартиньони К. Д. (декабрь 1976 г.). «Защита клеток Escherichia coli от летальных эффектов ультрафиолетового и рентгеновского облучения путем предварительного рентгеновского облучения: генетическое и физиологическое исследование». Photochem. Photobiol . 24 (6): 515–23 . doi :10.1111/j.1751-1097.1976.tb06868.x. PMID 798210. S2CID 37612164.

[pmid7440505-4] Jones DT, Robb FT, Woods DR (декабрь 1980 г.). «Влияние кислорода на выживаемость Bacteroides fragilis после дальнего ультрафиолетового облучения». J. Bacteriol . 144 (3): 1179– 81. doi :10.1128/JB.144.3.1179-1181.1980. PMC 294787. PMID 7440505 .

[pmid2995975-5] Protić-Sabljić M, Kraemer KH (октябрь 1985 г.). «Один димер пиримидина инактивирует экспрессию трансфицированного гена в клетках пигментной ксеродермы». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 82 (19): 6622– 6. Bibcode :1985PNAS...82.6622P. doi : 10.1073/pnas.82.19.6622 . PMC 391262 . PMID 2995975.

[pmid1933849-6] Атас ВФ, Хедаяти МА, Матаноски ГМ, Фармер ЭР, Гроссман Л (ноябрь 1991 г.). «Разработка и проверка на практике анализа восстановления ДНК в циркулирующих лимфоцитах человека». Cancer Res . 51 (21): 5786–93 . PMID 1933849.

[7] Маккриди, С. (2014). Иммуноферментный анализ для измерения репарации ДНК. В P. Keohavong & SG Grant (ред.), Molecular Toxicology Protocols (т. 1105, стр. 551–564). Humana Press. doi : 10.1007/978-1-62703-739-6_38