Геном лошади
Геном лошади был впервые секвенирован в 2006 году. Проект «Геном лошади» картировал 2,7 миллиарда пар оснований ДНК [1] и опубликовал полную карту в 2009 году [2]. Геном лошади больше генома собаки , но меньше генома человека или генома коровы [2] . Он включает 31 пару аутосом и одну пару половых хромосом [3] .
Поскольку лошади разделяют более 90 наследственных заболеваний, аналогичных тем, что встречаются у людей, секвенирование генома лошади имеет потенциальные приложения как для здоровья лошадей, так и для здоровья человека. [2] Кроме того, почти половина хромосом в геноме лошади показывают консервативную синтению с человеческой хромосомой, гораздо больше, чем между собаками и людьми. [2] Это высокая степень консервативной синтении, и она может помочь исследователям использовать идеи одного вида, чтобы пролить свет на другой. Картирование генома лошади может также помочь в разработке массивов экспрессии для улучшения лечения хромоты лошадей , заболеваний легких, репродукции и иммунологии. [1] Исследования также предоставили новые идеи о развитии центромер . [2]
Проект стоимостью 15 миллионов долларов был профинансирован Национальным институтом исследований генома человека (NHGRI) Национальных институтов здравоохранения (NIH). [4] Дополнительное финансирование поступило от Фонда Дороти Рассел Хавемейер, Фонда Фольксвагена , Фонда животных Морриса и Программы научных исследований национальных интересов . [2]
Исследователи проекта включали Керстин Линдблад-Тох из Института Эли и Эдит Л. Броуд Массачусетского технологического института и Гарвардского университета , Оттмар Дистль и Тоссо Либ из Университета ветеринарной медицины в Ганновере , Германия, а также Хельмут Блокер из Центра Гельмгольца по исследованию инфекций в Брауншвейге , Германия, и Дуг Антчак из Корнелльского университета . [4]
Первой лошадью, геном которой был полностью секвенирован в 2006–2007 годах, была чистокровная верховая кобыла по кличке Твайлайт, подаренная Корнелльским университетом. Другие породы, использованные для внесения вклада в первоначальную карту генетической изменчивости лошадей, включали ахалтекинскую , андалузскую , арабскую , исландскую , американскую четвертьхвостую , стандартбредную , [4] бельгийскую , ганноверскую , хоккайдскую и фьордскую лошадь . [2] Это позволило создать каталог из одного миллиона однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) для сравнения генетической изменчивости внутри и между различными породами. [2]
В 2012 году в Техасском университете A&M была полностью секвенирована вторая лошадь , 18-летняя кобыла породы квотерхорс по кличке Шугар. Геном Шугар, секвенированный с помощью новых методов, имел 3 миллиона генетических вариантов от генома Твайлайт, в частности, в генах, управляющих сенсорным восприятием, передачей сигнала и иммунитетом. Исследователи находятся в процессе секвенирования генома еще семи лошадей. Одной из заявленных целей дополнительного секвенирования является лучшее понимание генетической основы заболеваний и конкретных признаков, отличающих отдельных лошадей и породы, чтобы лучше прогнозировать и управлять лечением лошадей. [5]
Одним из результатов картирования генома лошади стало обнаружение мутации, которая создает комплекс пятен леопарда (Lp), наблюдаемый у таких пород, как аппалуза . [2] Лошади, гомозиготные по гену Lp , также подвержены риску врожденной стационарной ночной слепоты (CSNB). [6] Исследования 2008 и 2010 годов показали, что как CSNB, так и комплекс пятен леопарда связаны с TRPM1 . [7] [8] Поскольку это расстройство также поражает людей, исследователь и ведущий автор из Института Брода заявил: «Это демонстрирует полезность лошадей для картирования генов болезней». [2]
В 2012 году исследователи из Копенгагенского университета использовали секвенирование следующего поколения для секвенирования четырех современных одомашненных лошадей разных пород, лошади Пржевальского и осла , сравнив их с ДНК трех ископаемых лошадей, возраст которых составляет от 13 000 до 50 000 лет. [9] Поскольку лошадь была одомашнена только около 4000–3500 лет до н. э., [10] было заявлено, что это исследование «определит отправную точку для отбора лошадей и исходный генетический материал, который был доступен нашим предкам». [9]
Смотрите также
Ссылки
- ^ ab "Секвенированный геном лошади расширяет понимание болезней лошадей и человека". Колледж ветеринарной медицины Корнеллского университета. 21 августа 2012 г. Получено 1 апреля 2013 г.
- ^ abcdefghij Wade, C.; Giulotto, E.; Sigurdsson, S.; et al. (5 ноября 2009 г.). «Геном домашней лошади секвенирован». Science . 326 (5954). ScienceDaily, LLC: 865– 867. Bibcode :2009Sci...326..865W. doi :10.1126/science.1178158. PMC 3785132 . PMID 19892987 . Получено 1 апреля 2013 г. .
- ^ "Equus caballus (ID 145) - Геном - NCBI". Национальный центр биотехнологической информации. 30 января 2013 г. Получено 1 апреля 2013 г.
- ^ abc "Выпуск 2007: Собран геном лошади". Национальный институт исследований генома человека . Получено 1 апреля 2013 г.
- ^ "Quarter Horse Genome Sequenced". The Horse, интернет-издание . Blood Horse Publications. 17 февраля 2012 г. Получено 1 апреля 2013 г.
- ^ "Ночная слепота в Аппалузе (CSNB)". Проект Аппалуза. 15 ноября 2013 г. Получено 1 сентября 2017 г.
- ↑ Оке, Стейси (31 августа 2008 г.). «Проливая свет на ночную слепоту у аппалуз» . Лошадь . Получено 7 февраля 2009 г.
- ^ Bellone, R.; Archer, S.; Wade, CM; et al. (декабрь 2010 г.). "Анализ ассоциации кандидатов SNP в TRPM1 с леопардовой комплексной пятнистостью (LP) и врожденной стационарной ночной слепотой (CSNB) у лошадей". Animal Genetics . 41 (s2): 207. doi :10.1111/j.1365-2052.2010.02119.x. S2CID 84404747.
- ^ ab "Успешный семинар по геному лошади 2012 года". The Horse, онлайн-издание . Blood Horse Publications. 15 февраля 2012 г. Получено 3 апреля 2013 г.
- ^ Энтони, Дэвид В. (2007). Лошадь, колесо и язык: как всадники бронзового века из евразийских степей сформировали современный мир . Принстон, Нью-Джерси: Princeton University Press. ISBN 978-0-691-05887-0.
