Флуоресцентный краситель, используемый для окрашивания ДНК
Красители Hoechst являются частью семейства синих флуоресцентных красителей, используемых для окрашивания ДНК . [1] [2] Эти бис-бензимиды были первоначально разработаны Hoechst AG , которая пронумеровала все свои соединения так, что краситель Hoechst 33342 является 33 342-м соединением, производимым компанией. Существует три родственных красителя Hoechst: Hoechst 33258, Hoechst 33342 и Hoechst 34580. Красители Hoechst 33258 и Hoechst 33342 являются наиболее часто используемыми, и они имеют схожие спектры возбуждения – испускания .
Красители Hoechst растворимы в воде и органических растворителях, таких как диметилформамид или диметилсульфоксид . Концентрации могут достигать 10 мг/мл. Водные растворы стабильны при температуре 2–6 °C в течение как минимум шести месяцев при защите от света. Для длительного хранения растворы замораживают при температуре −20 °C или ниже. [3]
Красители связываются с малой бороздкой двухцепочечной ДНК, отдавая предпочтение последовательностям, богатым аденином и тимином . Хотя красители могут связываться со всеми нуклеиновыми кислотами, двухцепочечные цепи ДНК, богатые АТ, значительно усиливают флуоресценцию. [4] Красители Hoechst проницаемы для клеток и могут связываться с ДНК в живых или фиксированных клетках . Таким образом, эти красители часто называют суправитальными , что означает, что живые клетки выживают при обработке этими соединениями. Клетки, которые экспрессируют специфические белки -транспортеры кассет, связывающих АТФ, также могут активно транспортировать эти красители из своей цитоплазмы . [ необходима цитата ]
Приложения
Концентрация 0,1–12 мкг/мл обычно используется для окрашивания ДНК в бактериях или эукариотических клетках. Клетки окрашиваются в течение 1–30 мин при комнатной температуре или 37 °C, а затем промываются для удаления несвязанного красителя. Зеленая флуоресценция несвязанного красителя Hoechst может наблюдаться на образцах, которые окрашены слишком большим количеством красителя или которые промыты частично. [3] Красители Hoechst часто используются в качестве замены другого красителя нуклеиновых кислот, называемого DAPI .
Основные различия между красителями Hoechst и DAPI:
Красители Hoechst менее токсичны, чем DAPI, что обеспечивает более высокую жизнеспособность окрашенных клеток. [5]
Дополнительная этильная группа в некоторых красителях Hoechst (Hoechst 33342) делает их более проницаемыми для клеток. [6]
Существуют красители для окрашивания ядер, которые позволяют определить жизнеспособность клеток после окрашивания. [ необходима ссылка ]
Hoechst 33342 и 33258 гасятся бромдезоксиуридином ( BrdU ), который обычно используется для обнаружения делящихся клеток. Hoechst 33342 демонстрирует в 10 раз большую проницаемость для клеток, чем H 33258. Клетки могут интегрировать BrdU в недавно синтезированную ДНК в качестве замены тимидина . Когда BrdU интегрируется в ДНК, предполагается, что бром деформирует малую бороздку, так что красители Hoechst не могут достичь своего оптимального места связывания. Связывание красителей Hoechst еще сильнее с ДНК, замещенной BrdU; однако флуоресценция не возникает. Красители Hoechst можно использовать с BrdU для мониторинга прогрессирования клеточного цикла . [7] [8]
Красители Hoechst обычно используются для окрашивания геномной ДНК в следующих случаях:
Проточная цитометрия для подсчета или сортировки клеток. Примером является использование красителей Hoechst для анализа того, сколько клеток популяции находится в какой фазе клеточного цикла [10]
Hoechst efflux также используется для изучения кроветворных и эмбриональных стволовых клеток. Поскольку эти клетки способны эффективно выводить краситель, их можно обнаружить с помощью проточной цитометрии в так называемой боковой популяции . Это делается путем пропускания флуоресценции, испускаемой возбужденным hoechst, через красный и синий фильтры и построения графика hoechst red и blue друг против друга. [ необходима цитата ]
Токсичность и безопасность
Поскольку красители Hoechst связываются с ДНК, они мешают репликации ДНК во время деления клеток . Следовательно, они потенциально мутагенные и канцерогенные , поэтому следует соблюдать осторожность при обращении с ними и их утилизации. Краситель Hoechst используется для сортировки спермы у скота и людей. Его безопасность является предметом споров. [13] [14]
^ Latt, SA; Stetten, G; Juergens, LA; Willard, HF; Scher, CD (июль 1975 г.). «Последние разработки в области обнаружения синтеза дезоксирибонуклеиновой кислоты с помощью флуоресценции 33258 Hoechst». Журнал гистохимии и цитохимии . 23 (7): 493–505. doi : 10.1177/23.7.1095650 . PMID 1095650.
^ Latt, SA; Stetten, G (январь 1976). «Спектральные исследования 33258 Hoechst и родственных бисбензимидазольных красителей, полезных для флуоресцентного обнаружения синтеза дезоксирибонуклеиновой кислоты». Журнал гистохимии и цитохимии . 24 (1): 24–33. doi : 10.1177/24.1.943439 . PMID 943439.
^ Португалия, J; Waring, MJ (28 февраля 1988 г.). «Назначение участков связывания ДНК для 4′,6-диамидин-2-фенилиндола и бисбензимида (Hoechst 33258). Сравнительное исследование футпринтинга». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия генов . 949 (2): 158–68. doi :10.1016/0167-4781(88)90079-6. PMID 2449244.
^ BD Bioscience (2009). Методы анализа иммунной функции (PDF) (2-е изд.). Becton, Dickinson and Company.
^ Буцявичюс, Йонас; Лукинавичюс, Гражвидас; Герасимайте, Рута (18 апреля 2018 г.). «Использование красителей Hoechst для окрашивания ДНК и не только». Хемосенсоры . 6 (2): 18. doi : 10.3390/chemosensors6020018 . hdl : 21.11116/0000-0001-A4FE-8 . ISSN 2227-9040.
^ Kubbies, M; Rabinovitch, PS (январь 1983). "Проточный цитометрический анализ факторов, которые влияют на эффект гашения BrdUrd-Hoechst в культивируемых человеческих фибробластах и лимфоцитах". Цитометрия . 3 (4): 276–81. doi : 10.1002/cyto.990030408 . PMID 6185287.
^ Breusegem, SY; Clegg, RM; Loontiens, FG (1 февраля 2002 г.). «Специфичность последовательности оснований Hoechst 33258 и связывания DAPI с пятью сайтами ДНК (A/T)4 с кинетическими доказательствами более чем одного высокоаффинного комплекса Hoechst 33258-AATT». Журнал молекулярной биологии . 315 (5): 1049–61. doi :10.1006/jmbi.2001.5301. PMID 11827475.
^ Iain Johnson, Michelle TZ Spence, ред. (2011). Справочник по молекулярным зондам: руководство по флуоресцентным зондам и технологиям маркировки (11-е изд.). Invitrogen. ISBN978-0-9829279-1-5.
^ Kubbies, M (1990). «Проточно-цитометрическое распознавание повреждения хроматина, вызванного кластогеном, в лимфоцитах G0/G1 с помощью нестехиометрического связывания флуорохрома Hoechst». Цитометрия . 11 (3): 386–94. doi : 10.1002/cyto.990110309 . PMID 1692786.
^ ab Mocharla, R; Mocharla, H; Hodes, ME (23 декабря 1987 г.). "Новый, чувствительный метод флуорометрического окрашивания для обнаружения ДНК в препаратах РНК". Nucleic Acids Research . 15 (24): 10589. doi :10.1093/nar/15.24.10589. PMC 339970. PMID 2447564 .
^ Sterzel, W; Bedford, P; Eisenbrand, G (июнь 1985). «Автоматизированное определение ДНК с использованием флуорохрома Hoechst 33258». Аналитическая биохимия . 147 (2): 462–7. doi :10.1016/0003-2697(85)90299-4. PMID 2409841.
^ Эшвуд-Смит, М. Дж. (1994). «Безопасность отбора сперматозоидов человека методом проточной цитометрии». Репродукция человека . 9 (5). Oxford University Press : 757–759. doi : 10.1093/oxfordjournals.humrep.a138589. PMID 7929716.
^ Parrilla, I; Vázquez, JM; Cuello, C; Gil, MA; Roca, J; Di Berardino, D; Martínez, EA (2004). «Окрашивание Hoechst 33342 и воздействие ультрафиолетового лазера не вызывают генотоксических эффектов в сперматозоидах хряка, отсортированных по потоку». Reproduction . 128 (5): 615–621. doi : 10.1530/rep.1.00288 . PMID 15509707.
Внешние ссылки
На Викискладе есть медиафайлы по теме Hoechst stains .
Спектральные следы флуоресцентных красителей
Руководство по применению морилок Hoechst
Онлайн-руководство по флуоресцентным зондам и технологиям коммерческой маркировки