Плеоморфный вирус Haloarcula hispanica 1
| Альфаплеолиповирус HHPV1 | |
|---|---|
 | |
| Вирион альфаплеолиповируса | |
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Моноднавирия |
| Королевство: | Трапавирусы |
| Тип: | Салевирикота |
| Сорт: | Хуолимавирицеты |
| Заказ: | Haloruvirales |
| Семья: | Плеолиповирусы |
| Род: | Альфаплеолиповирус |
| Разновидность: | Альфаплеолиповирус HHPV1 |
| Синонимы | |
| |
Альфаплеолиповирус HHPV1 , также известный как плеоморфный вирус Haloarcula hispanica 1 (HHPV-1), является вирусом семейства Pleolipoviridae . Это двухцепочечный ДНК-вирус, который заражает галофильную архею Haloarcula hispanica . [1] Он обладает рядом уникальных особенностей, в отличие от любого ранее описанного вируса. [2] [3]
Вирусология
Вирионы имеют оболочку и плеоморфную форму. Оболочка содержит различные липиды, включая кардиолипины , фосфатидилглицерины , фосфатидилглицерофосфатные метиловые эфиры и фосфатидилглицеросульфаты. В оболочке есть два основных белка — VP3 ( массой 12 килодальтон ) и VP4 (массой 60 килодальтон). [1]
Вирионы покидают хозяина без лизиса, что предполагает механизм почкования . [1]
Геном
Геном представляет собой одну молекулу двухцепочечной ДНК, кольцевую, длиной 8082 пар оснований с содержанием G+C 55,8%. Он имеет восемь открытых рамок считывания (ORF). VP3 и VP4 кодируются ORF3 и ORF4 соответственно. [ необходима цитата ]
ORF1, вероятно, является белком инициации репликации. ORF3 кодирует интегральный мембранный белок с сигнальной последовательностью из 50 аминокислот и двумя трансмембранными областями. Перед С-концевым трансмембранным доменом находится спирально-спиральная область. ORF7 содержит домен NTPase, но его функция не ясна. [ необходима цитата ]
Таксономия
Исследование белков и геномной организации этого вируса предполагает, что он связан с одноцепочечным ДНК-вирусом Halorubrum pleomorphic virus 1 , плазмидой pHK2 и областью внутри археона Haloferax volcanii . Кажется вероятным, что плазмида pHK2 может быть вирусом, способным образовывать кольцевые плазмиды, и что область внутри Haloferax volcanii является профагом . [ требуется ссылка ]
Сходство между этими двухцепочечными элементами ДНК и одноцепочечным вирусом Halorubrum pleomorphic virus 1 в настоящее время уникально. Если эта связь может быть подтверждена для других вирусов, это предполагает, что используемая в настоящее время система классификации Балтимора может нуждаться в пересмотре. [ необходима цитата ]
Ссылки
- ^ abc Roine E, Kukkaro P, Paulin L, Laurinavicius S, Domanska A, Somerharju P, Bamford DH (2010) Новые, тесно связанные галоархейные вирусные элементы с различными типами нуклеиновых кислот. J Virol 84(7):3682–89
- ^ Пиетиля М.К., Атанасова Н.С., Маноле В., Лильджероос Л., Батчер С.Дж., Оксанен Х.М., Бэмфорд Д.Х. (2012). «Архитектура вириона объединяет глобально распространенные плеолиповирусы, заражающие галофильные археи». Журнал вирусологии . 86 (9): 5067–79 . doi :10.1128/JVI.06915-11. ПМК 3347350 . ПМИД 22357279.
- ^ Pietilä MK, Laurinavicius S, Sund J, Roine E, Bamford DH (2010). «Одноцепочечный ДНК-геном нового архейного вируса Halorubrum pleomorphic virus 1 заключен в оболочку, украшенную гликопротеиновыми шипами». J Virol . 84 (2): 788– 798. doi :10.1128/JVI.01347-09. PMC 2798366. PMID 19864380 .
