HOXC6

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
HOXC6
Идентификаторы
ПсевдонимыHOXC6 , CP25, HHO.C8, HOX3, HOX3C, гомеобокс C6
Внешние идентификаторыОМИМ : 142972; МГИ : 96197; гомологен : 19533; Генные карты : HOXC6; OMA :HOXC6 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_153693
NM_004503

NM_010465

RefSeq (белок)

NP_004494
NP_710160

NP_034595

Местоположение (UCSC)Хр 12: 53.99 – 54.03 МбХр 15: 102.91 – 102.92 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Гомеобоксный белок Hox-C6 — это белок , который у людей кодируется геном HOXC6 . [ 5] [6] [7] Экспрессия Hox-C6 наиболее высока в фаллопиевых трубах и яичниках. [8] HoxC6 был высоко экспрессирован во многих типах рака, включая рак простаты, молочной железы и плоскоклеточный рак пищевода. [9]

Функция

Этот ген принадлежит к семейству гомеобоксов, члены которого кодируют высококонсервативное семейство факторов транскрипции, которые играют важную роль в морфогенезе всех многоклеточных организмов. Млекопитающие обладают четырьмя похожими кластерами генов гомеобоксов, HOXA, HOXB, HOXC и HOXD, которые расположены на разных хромосомах и состоят из 9-11 генов, расположенных в тандеме. Этот ген, HOXC6, является одним из нескольких генов HOXC, расположенных в кластере на хромосоме 12. Три гена, HOXC5, HOXC4 и HOXC6, имеют общий 5'-некодирующий экзон. Транскрипты могут включать общий экзон, сплайсированный с геноспецифичными экзонами, или они могут включать только геноспецифичные экзоны. Для HOXC6 были идентифицированы альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы. Вариант транскрипта два включает общий экзон, а вариант транскрипта один включает только геноспецифичные экзоны. [7] HOXC6 играет роль в лимфоме. Изоформа HOXC6, HOXC6-2, является активным канцерогеном для рака желудка. Она стимулирует пролиферацию клеток рака желудка, действуя как онкоген. Снижение экспрессии изоформ этого гена может потенциально привести к снижению пролиферации определенных раковых клеток. С изоформой HOXC6-1 не было статистически значимых эффектов на миграцию, инвазию, апоптоз или пролиферацию, когда она была снижена. [10] Согласно исследованию в Cancer Cell International, подавление гена HOXC6 играет роль в блокировании каскада TGF-β/SMAD. Это затем приводит к ослаблению эпителиально-мезенхимального перехода для карциномы шейки матки. [11]

Нокаутирующая модель

Модель нокаута с использованием малых интерферирующих РНК показала, что нокаут HOXC6 был связан с апоптозом. Кроме того, присутствие HOXC6 было связано с ингибированием апоптоза, вызванного паклитакселом. Таким образом, было показано, что HOXC6 вызывает пролиферативную активность. [12]

Смотрите также


Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000197757 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000001661 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ McAlpine PJ, Shows TB (июль 1990 г.). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика . 7 (3): 460. doi :10.1016/0888-7543(90)90186-X. PMID  1973146.
  6. ^ Скотт МП (ноябрь 1992 г.). «Номенклатура генов гомеобокса позвоночных». Cell . 71 (4): 551– 553. doi :10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID  1358459. S2CID  13370372.
  7. ^ ab "Ген Энтреза: HOXC6 гомеобокс C6".
  8. ^ "Тканевая экспрессия HOXC6 - Резюме - Атлас белков человека". www.proteinatlas.org . Получено 2022-04-11 .
  9. ^ Tang L, Cao Y, Song X, Wang X, Li Y, Yu M и др. (2019-03-14). "HOXC6 способствует миграции, инвазии и пролиферации клеток плоскоклеточного рака пищевода посредством модуляции экспрессии генов, участвующих в злокачественных фенотипах". PeerJ . 7 : e6607. doi : 10.7717/peerj.6607 . PMC 6421064 . PMID  30886783. 
  10. ^ Lin J, He J, He X, Wang L, Xue M, Zhuo W и др. (октябрь 2020 г.). «HoxC6 функционирует как онкоген, а изоформа HoxC6-2 может играть основную роль в канцерогенезе желудка». Digestive Diseases and Sciences . 65 (10): 2896– 2906. doi :10.1007/s10620-019-06013-7. PMID  31900716. S2CID  209541406.
  11. ^ Zhang F, Ren CC, Liu L, Chen YN, Yang L, Zhang XA (декабрь 2018 г.). «Подавление гена HOXC6 ингибирует эпителиально-мезенхимальный переход и жизнеспособность клеток через сигнальный путь TGF-β/smad в клетках карциномы шейки матки». Cancer Cell International . 18 (1): 204. doi : 10.1186/s12935-018-0680-2 . PMC 6290547 . PMID  30559605. 
  12. ^ Moon SM, Kim SA, Yoon JH, Ahn SG (октябрь 2012 г.). «HOXC6 дерегулирован при плоскоклеточной карциноме головы и шеи человека и модулирует экспрессию Bcl-2». Журнал биологической химии . 287 (42): 35678– 35688. doi : 10.1074/jbc.M112.361675 . PMC 3471680. PMID  22896703 . 

Дальнейшее чтение

  • Акампора Д., Д'Эспозито М., Файелла А., Паннесе М., Мильяччо Э., Морелли Ф. и др. (декабрь 1989 г.). «Семейство генов человека HOX». Исследования нуклеиновых кислот . 17 (24): 10385–10402 . doi :10.1093/nar/17.24.10385. ПМК  335308 . ПМИД  2574852.
  • Бончинелли Э., Акампора Д., Паннесе М., Д'Эспозито М., Сомма Р., Гаудино Г. и др. (1990). «Организация генов гомеобокса I класса человека». Геном . 31 (2): 745–756 . doi : 10.1139/g89-133. ПМИД  2576652.
  • Rabin M, Ferguson-Smith A, Hart CP, Ruddle FH (декабрь 1986 г.). «Когнатные гомеобоксные локусы, картированные на гомологичных хромосомах человека и мыши». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 83 (23): 9104– 9108. Bibcode :1986PNAS...83.9104R. doi : 10.1073/pnas.83.23.9104 . PMC  387083 . PMID  2878432.
  • Simeone A, Mavilio F, Acampora D, Giampaolo A, Faiella A, Zappavigna V и др. (Июль 1987 г.). «Два человеческих гомеобоксных гена, c1 и c8: структурный анализ и экспрессия в эмбриональном развитии». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 84 (14): 4914– 4918. Bibcode : 1987PNAS...84.4914S. doi : 10.1073/pnas.84.14.4914 . PMC  305217. PMID  2885844 .
  • Simeone A, Pannese M, Acampora D, D'Esposito M, Boncinelli E (июнь 1988 г.). «По крайней мере три человеческих гомеобокса на хромосоме 12 принадлежат к одной и той же единице транскрипции». Nucleic Acids Research . 16 (12): 5379– 5390. doi :10.1093/nar/16.12.5379. PMC  336773. PMID  2898768 .
  • Corsetti MT, Levi G, Lancia F, Sanseverino L, Ferrini S, Boncinelli E, Corte G (январь 1995 г.). «Ядрышковая локализация трех гомеопротеинов Hox». Журнал клеточной науки . 108 (Часть 1) (1): 187–193 . doi : 10.1242/jcs.108.1.187 . ПМИД  7738096.
  • Apiou F, Flagiello D, Cillo C, Malfoy B, Poupon MF, Dutrillaux B (1996). «Точное картирование кластеров генов HOX человека». Цитогенетика и клеточная генетика . 73 ( 1– 2): 114– 115. doi :10.1159/000134320. PMID  8646877.
  • Chariot A, Castronovo V, Le P, Gillet C, Sobel ME, Gielen J (октябрь 1996 г.). «Клонирование и экспрессия нового транскрипта HOXC6, кодирующего репрессирующий белок». The Biochemical Journal . 319 ( Pt 1) (1): 91– 97. doi :10.1042/bj3190091. PMC  1217739. PMID  8870653 .
  • Kosaki K, Kosaki R, Suzuki T, Yoshihashi H, Takahashi T, Sasaki K и др. (Февраль 2002 г.). «Полная панель анализа мутаций 39 генов HOX человека». Teratology . 65 (2): 50– 62. doi :10.1002/tera.10009. PMID  11857506.
  • Ramachandran S, Liu P, Young AN, Yin-Goen Q, Lim SD, Laycock N и др. (январь 2005 г.). «Потеря экспрессии HOXC6 вызывает апоптоз в клетках рака простаты». Oncogene . 24 (1): 188– 198. doi : 10.1038/sj.onc.1207906 . PMID  15637592.
  • Hori Y, Gu X, Xie X, Kim SK (апрель 2005 г.). «Дифференциация инсулин-продуцирующих клеток из человеческих нейральных клеток-предшественников». PLOS Medicine . 2 (4): e103. doi : 10.1371/journal.pmed.0020103 . PMC  1087208. PMID  15839736 .
  • Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R и др. (январь 2006 г.). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Research . 16 (1): 55– 65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC  1356129. PMID  16344560 .
  • Zhang X, Hamada J, Nishimoto A, Takahashi Y, Murai T, Tada M, Moriuchi T (2007). "HOXC6 и HOXC11 увеличивают транскрипцию гена S100beta в вызванной BrdU in vitro дифференцировке клеток нейробластомы GOTO в шванновские клетки". Журнал клеточной и молекулярной медицины . 11 (2): 299– 306. doi :10.1111/j.1582-4934.2007.00020.x. PMC  3822828. PMID  17488478 .

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=HOXC6&oldid=1194510290"