Гидроксиметилглутарил-КоА-синтаза

Класс ферментов
3-гидрокси-3-метилглутарил-Коэнзим А-синтаза 1 (растворимая)
Идентификаторы
СимволHMGCS1
Альтернативные символыHMGCS
ген NCBI3157
HGNC5007
ОМИМ142940
РефСекNM_002130
UniProtQ01581
Другие данные
Номер ЕС2.3.3.10
ЛокусХр. 5 стр. 14-13
Искать
СтруктурыШвейцарская модель
ДоменыИнтерПро
3-гидрокси-3-метилглутарил-Коэнзим А-синтаза 2 (митохондриальная)
Идентификаторы
СимволHMGCS2
ген NCBI3158
HGNC5008
ОМИМ600234
РефСекNM_005518
UniProtР54868
Другие данные
ЛокусХр. 1 стр. 13-стр. 12
Искать
СтруктурыШвейцарская модель
ДоменыИнтерПро
N-терминал гидроксиметилглутарил-кофермента А-синтазы
3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-синтаза золотистого стафилококка
Идентификаторы
СимволHMG_CoA_synt_N
ПфамПФ01154
Клан ПФАМCL0046
ИнтерПроIPR013528
ПРОСИТPDOC00942
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры
Гидроксиметилглутарил-кофермент А-синтаза С-терминал
3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-синтаза золотистого стафилококка
Идентификаторы
СимволHMG_CoA_synt_C
ПфамПФ08540
Клан ПФАМCL0046
ИнтерПроIPR013746
ПРОСИТPDOC00942
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры

В биохимии гидроксиметилглутарил-КоА-синтаза или ГМГ-КоА-синтаза EC 2.3.3.10 представляет собой фермент, катализирующий реакцию, в которой ацетил-КоА конденсируется с ацетоацетил-КоА с образованием 3 - гидрокси-3 - метилглутарил - КоА (ГМГ-КоА). Эта реакция представляет собой второй этап в мевалонат -зависимом пути биосинтеза изопреноидов . ГМГ-КоА является промежуточным звеном как в синтезе холестерина, так и в кетогенезе . Эта реакция чрезмерно активируется у пациентов с сахарным диабетом 1 типа, если ее не лечить, из-за длительного дефицита инсулина и истощения субстратов для глюконеогенеза и цикла трикарбоновых кислот , в частности оксалоацетата . Это приводит к шунтированию избытка ацетил-КоА в путь синтеза кетонов через ГМГ-КоА, что приводит к развитию диабетического кетоацидоза .

Реакция синтазы HMG-CoA
Реакция синтазы HMG-CoA


ацетил-КоА + H 2 O + ацетоацетил-КоА ( S )-3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА + КоА {\displaystyle \rightleftharpoons}

Тремя субстратами этого фермента являются ацетил-КоА , H2O и ацетоацетил -КоА , тогда как его двумя продуктами являются ( S )-3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА и КоА .

У человека этот белок кодируется геном HMGCS1 на 5-й хромосоме.

Классификация

Этот фермент принадлежит к семейству трансфераз , а именно ацилтрансфераз , которые при переносе преобразуют ацильные группы в алкильные.

Номенклатура

Систематическое название этого класса ферментов — ацетил-КоА:ацетоацетил-КоА-С-ацетилтрансфераза (тиоэфиргидролизующая, карбоксиметилобразующая) . Другие общеупотребительные названия включают ( S )-3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА ацетоацетил-КоА-лиазу , (КоА-ацетилирование) , 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА синтетазу , 3-гидрокси-3-метилглутарил-кофермент А синтетазу , 3-гидрокси-3-метилглутарил-кофермент А синтетазу , 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА синтетазу , 3-гидрокси-3-метилглутарил-кофермент А синтетазу , бета-гидрокси-бета-метилглутарил-КоА синтетазу , ГМГ-КоА синтетазу , ацетоацетил-кофермент А трансацетазу , гидроксиметилглутарил-кофермент А синтетазу и гидроксиметилглутарил-кофермент А-конденсирующий фермент .

Механизм

Синтаза HMG-CoA содержит важный каталитический остаток цистеина , который действует как нуклеофил на первом этапе реакции: ацетилирование фермента ацетил -CoA (его первый субстрат ) с образованием тиоэфира ацетилфермента , высвобождающего восстановленный кофермент А. Последующая нуклеофильная атака на ацетоацетил-CoA (его второй субстрат) приводит к образованию HMG-CoA . [1]

Биологическая роль

Этот фермент участвует в трех метаболических путях : синтезе и распаде кетоновых тел , распаде валина, лейцина и изолейцина и метаболизме бутаноата .

Распространение видов

Синтаза HMG-CoA встречается у эукариот , архей и некоторых бактерий . [2]

Эукариоты

У позвоночных существуют два различных изофермента фермента ( цитозольный и митохондриальный ); у людей цитозольная форма имеет только 60,6% аминокислотной идентичности с митохондриальной формой фермента. HMG-CoA также обнаружен у других эукариот, таких как насекомые , растения и грибы . [3]

Цитозольный

Цитозольная форма является отправной точкой мевалонатного пути, который приводит к образованию холестерина и других стериновых и изопреноидных соединений.

Мевалонатный путь

Митохондриальный

Митохондриальная форма отвечает за биосинтез кетоновых тел . Ген митохондриальной формы фермента имеет три элемента регуляции стерола в 5'-фланкирующей области. [4] Эти элементы отвечают за снижение транскрипции сообщения , ответственного за синтез фермента, когда у животных высокий уровень холестерина в пище : то же самое наблюдается для 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА и рецептора липопротеинов низкой плотности .

Кетогенез

Бактерии

У бактерий предшественники изопреноидов обычно синтезируются по альтернативному, немевалонатному пути, однако ряд грамположительных патогенов используют мевалонатный путь с участием HMG-CoA-синтазы, который параллелен тому, который обнаружен у эукариот . [5] [6]

Структурные исследования

По состоянию на конец 2007 года для этого класса ферментов были определены 4 структуры с кодами доступа PDB 1XPK, 1XPL, 1XPM и 2P8U.

Ссылки

  1. ^ Theisen MJ, Misra I, Saadat D, Campobasso N, Miziorko HM, Harrison DH (ноябрь 2004 г.). "Промежуточный комплекс 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-синтазы, наблюдаемый в "реальном времени"". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (47): 16442–7. doi : 10.1073/pnas.0405809101 . PMC  534525. PMID  15498869 .
  2. ^ Bahnson BJ (ноябрь 2004 г.). «Механизм атомного разрешения 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-синтазы». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (47): 16399–400. Bibcode : 2004PNAS..10116399B. doi : 10.1073 /pnas.0407418101 . PMC 534547. PMID  15546978. 
  3. ^ Bearfield JC, Keeling CI, Young S, Blomquist GJ, Tittiger C (апрель 2006 г.). «Изоляция, эндокринная регуляция и распределение мРНК гена 3-гидрокси-3-метилглутарил кофермента А синтазы (HMG-S) из соснового гравера Ips pini (Coleoptera: Scolytidae)». Молекулярная биология насекомых . 15 (2): 187–95. doi :10.1111/j.1365-2583.2006.00627.x. PMID  16640729. S2CID  46317830.
  4. ^ Goldstein JL, Brown MS (1990) Регуляция мевалонатного пути. Nature 343, 425-430
  5. ^ Steussy CN, Robison AD, Tetrick AM, Knight JT, Rodwell VW, Stauffacher CV, Sutherlin AL (декабрь 2006 г.). «Структурное ограничение активности фермента: случай синтазы HMG-CoA». Биохимия . 45 (48): 14407–14. doi :10.1021/bi061505q. PMID  17128980.
  6. ^ Steussy CN, Vartia AA, Burgner JW, Sutherlin A, Rodwell VW, Stauffacher CV (ноябрь 2005 г.). "Рентгеновские кристаллические структуры синтазы HMG-CoA из Enterococcus faecalis и комплекса с ее вторым субстратом/ингибитором ацетоацетил-CoA". Биохимия . 44 (43): 14256–67. doi :10.1021/bi051487x. PMID  16245942.
  • RUDNEY H (1957). «Биосинтез бета-гидрокси-бета-метилглутаровой кислоты». J. Biol. Chem . 227 (1): 363–77. doi : 10.1016/S0021-9258(18)70822-3 . PMID  13449080.
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR013746
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR013528
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Гидроксиметилглутарил-КоА_синтаза&oldid=1227618512"