3-гидрокси-3-метилглутарил-Коэнзим А-синтаза 1 (растворимая) | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||
Символ | HMGCS1 | ||||||
Альтернативные символы | HMGCS | ||||||
ген NCBI | 3157 | ||||||
HGNC | 5007 | ||||||
ОМИМ | 142940 | ||||||
РефСек | NM_002130 | ||||||
UniProt | Q01581 | ||||||
Другие данные | |||||||
Номер ЕС | 2.3.3.10 | ||||||
Локус | Хр. 5 стр. 14-13 | ||||||
|
3-гидрокси-3-метилглутарил-Коэнзим А-синтаза 2 (митохондриальная) | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||
Символ | HMGCS2 | ||||||
ген NCBI | 3158 | ||||||
HGNC | 5008 | ||||||
ОМИМ | 600234 | ||||||
РефСек | NM_005518 | ||||||
UniProt | Р54868 | ||||||
Другие данные | |||||||
Локус | Хр. 1 стр. 13-стр. 12 | ||||||
|
N-терминал гидроксиметилглутарил-кофермента А-синтазы | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||
Символ | HMG_CoA_synt_N | ||||||||
Пфам | ПФ01154 | ||||||||
Клан ПФАМ | CL0046 | ||||||||
ИнтерПро | IPR013528 | ||||||||
ПРОСИТ | PDOC00942 | ||||||||
|
Гидроксиметилглутарил-кофермент А-синтаза С-терминал | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||
Символ | HMG_CoA_synt_C | ||||||||
Пфам | ПФ08540 | ||||||||
Клан ПФАМ | CL0046 | ||||||||
ИнтерПро | IPR013746 | ||||||||
ПРОСИТ | PDOC00942 | ||||||||
|
В биохимии гидроксиметилглутарил-КоА-синтаза или ГМГ-КоА-синтаза EC 2.3.3.10 представляет собой фермент, катализирующий реакцию, в которой ацетил-КоА конденсируется с ацетоацетил-КоА с образованием 3 - гидрокси-3 - метилглутарил - КоА (ГМГ-КоА). Эта реакция представляет собой второй этап в мевалонат -зависимом пути биосинтеза изопреноидов . ГМГ-КоА является промежуточным звеном как в синтезе холестерина, так и в кетогенезе . Эта реакция чрезмерно активируется у пациентов с сахарным диабетом 1 типа, если ее не лечить, из-за длительного дефицита инсулина и истощения субстратов для глюконеогенеза и цикла трикарбоновых кислот , в частности оксалоацетата . Это приводит к шунтированию избытка ацетил-КоА в путь синтеза кетонов через ГМГ-КоА, что приводит к развитию диабетического кетоацидоза .
Тремя субстратами этого фермента являются ацетил-КоА , H2O и ацетоацетил -КоА , тогда как его двумя продуктами являются ( S )-3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА и КоА .
У человека этот белок кодируется геном HMGCS1 на 5-й хромосоме.
Этот фермент принадлежит к семейству трансфераз , а именно ацилтрансфераз , которые при переносе преобразуют ацильные группы в алкильные.
Систематическое название этого класса ферментов — ацетил-КоА:ацетоацетил-КоА-С-ацетилтрансфераза (тиоэфиргидролизующая, карбоксиметилобразующая) . Другие общеупотребительные названия включают ( S )-3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА ацетоацетил-КоА-лиазу , (КоА-ацетилирование) , 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА синтетазу , 3-гидрокси-3-метилглутарил-кофермент А синтетазу , 3-гидрокси-3-метилглутарил-кофермент А синтетазу , 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА синтетазу , 3-гидрокси-3-метилглутарил-кофермент А синтетазу , бета-гидрокси-бета-метилглутарил-КоА синтетазу , ГМГ-КоА синтетазу , ацетоацетил-кофермент А трансацетазу , гидроксиметилглутарил-кофермент А синтетазу и гидроксиметилглутарил-кофермент А-конденсирующий фермент .
Синтаза HMG-CoA содержит важный каталитический остаток цистеина , который действует как нуклеофил на первом этапе реакции: ацетилирование фермента ацетил -CoA (его первый субстрат ) с образованием тиоэфира ацетилфермента , высвобождающего восстановленный кофермент А. Последующая нуклеофильная атака на ацетоацетил-CoA (его второй субстрат) приводит к образованию HMG-CoA . [1]
Этот фермент участвует в трех метаболических путях : синтезе и распаде кетоновых тел , распаде валина, лейцина и изолейцина и метаболизме бутаноата .
Синтаза HMG-CoA встречается у эукариот , архей и некоторых бактерий . [2]
У позвоночных существуют два различных изофермента фермента ( цитозольный и митохондриальный ); у людей цитозольная форма имеет только 60,6% аминокислотной идентичности с митохондриальной формой фермента. HMG-CoA также обнаружен у других эукариот, таких как насекомые , растения и грибы . [3]
Цитозольная форма является отправной точкой мевалонатного пути, который приводит к образованию холестерина и других стериновых и изопреноидных соединений.
Митохондриальная форма отвечает за биосинтез кетоновых тел . Ген митохондриальной формы фермента имеет три элемента регуляции стерола в 5'-фланкирующей области. [4] Эти элементы отвечают за снижение транскрипции сообщения , ответственного за синтез фермента, когда у животных высокий уровень холестерина в пище : то же самое наблюдается для 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА и рецептора липопротеинов низкой плотности .
У бактерий предшественники изопреноидов обычно синтезируются по альтернативному, немевалонатному пути, однако ряд грамположительных патогенов используют мевалонатный путь с участием HMG-CoA-синтазы, который параллелен тому, который обнаружен у эукариот . [5] [6]
По состоянию на конец 2007 года для этого класса ферментов были определены 4 структуры с кодами доступа PDB 1XPK, 1XPL, 1XPM и 2P8U.