HLA-A1
| HLA-A1 | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ( MHC Класс I , А- клеточный поверхностный антиген) | ||||||||||
 Визуализация 1W72 : α (продукт гена A*01:01) , β 2 -микроглобулин и пептид MAGE-1 . | ||||||||||
| О | ||||||||||
| Белок | трансмембранный рецептор / лиганд | |||||||||
| Структура | αβ гетеродимер | |||||||||
| Субъединицы | HLA-A *01--, β 2 -микроглобулин | |||||||||
| Старые названия | HL-A1 | |||||||||
| Подтипы | ||||||||||
| ||||||||||
| Редкие аллели | ||||||||||
| ||||||||||
| Ссылка на аллели в базе данных IMGT/HLA в EBI | ||||||||||
HLA-A1 (A1) — это серотип человеческого лейкоцитарного антигена в группе серотипов HLA-A «A». Серотип определяется распознаванием антителами подмножества α 1 α-цепей HLA-A. Для A1 цепь альфа «A» кодируется группой аллелей HLA-A *01 , а β-цепь кодируется локусом B2M . [1] В настоящее время в этой группе доминирует A*01:01. A1 и A *01 почти синонимичны по значению. A1 чаще встречается в Европе, чем где-либо еще, он является частью длинного гаплотипа , который, по-видимому, был распространен у древних народов северо-западной Европы. A1 является частым компонентом гаплотипа AH8.1 . Положительный серотип A1 примерно связан с большим количеством воспалительных заболеваний и состояний, которые, как полагают, связаны с вовлечением иммунной системы. Из-за его связи с гаплотипом AH8.1 многие исследования показали связь с A1 или A1,B8 только позже, чтобы показать дрейф ассоциации в сторону аллелей генов региона класса II, DR3 и DQ2.5. Хотя неясно, какую роль играет A1 в инфекционных заболеваниях, некоторая связь с показателями инфицирования ВИЧ остается связанной с регионом A1 гаплотипа.
Серотип
| А*01 | А1 | Образец |
| аллель | % | размер (Н) |
| *01:01 | 99 | 5612 |
| *01:02 | 95 | 129 |
| *01:03 | 78 | 9 |
Во всех случаях, которые были выявлены до сих пор, HLA-A1 был связан с заболеванием посредством ассоциации, но лишь немногие из них определяют, что HLA-A1 имеет преобладающий генетический риск по сравнению с другими аллелями генов вблизи гена A1 в более крупном гаплотипе.
А1 и аутоиммунные заболевания
Серотип A1 был связан с рядом заболеваний, поскольку антигены "HL-A" были впервые описаны . Ассоциации быстро расширились, включив "HL-A8" HLA-B8 , поскольку было обнаружено, что HLA A1 и B8 обычно связаны. После того, как DRw3 был охарактеризован, аутоиммунный риск сместился в сторону региона класса II.
Гаплотип A1-B58 (A1-B17, где B58 является доминирующим) может оставаться связанным с антинейтрофильными цитоплазматическими антителами (ANCA) [3]
А1 при диабете
За исключением диабета 1 типа, большинство доказательств прямой связи A1 с аутоиммунными заболеваниями испарились, когда были охарактеризованы гены DR3 и DQ2. В то время как диабет 1 типа показывает расширенную связь с гаплотипом HLA A1-B8-DR3-DQ2, эта связь, по-видимому, не выходит за рамки локуса HLA-B. [4] Недавнее исследование фенотипа DR3-DQ2/DR4-DQ8 показало, что A1-cw7-B8 на самом деле был ниже, чем ожидалось, по сравнению с другими типами AB, что указывает на то, что связанные с риском гены расположены между B8 и DR3. Однако другое исследование показало, что A*01:01, по-видимому, изменяет риск диабета 1 типа , но не Cw7-B8. [5] Пример диабета 1 типа показывает неотъемлемую сложность использования только анализа сцепления для шифрования риска.
А1 и аллергические заболевания, чувствительность
На ранних этапах изучения HLA была обнаружена связь между HL A1, B8 при аллергических заболеваниях; обнаружено, что они связаны с расширенным регионом HLA A1-B8.
Как ни странно, А1 также был связан с циррозом печени , вызванным метотрексатом . [6] В то время как А1 был отрицательно связан с другими заболеваниями, такими как пневмокониоз у рабочих угольной промышленности и проказа. [7] [8] [9]
А1 и инфекционные заболевания
В ранних исследованиях было обнаружено, что A1 ассоциируется с некоторыми инфекционными заболеваниями или защищает от них. [10] [11] [12] Некоторые заболевания, которые были связаны с A1, на самом деле связаны с расширенным гаплотипом A1-B8, примерами являются вирусный гепатит и ускоренное прогрессирование ВИЧ.
A1 с B8 показали повышенный риск заражения корью , [13] однако, значимость не была последовательной. [14] Более поздняя работа показала связь A*01:01 с более низкими, чем в среднем, реакциями на вакцину против кори . [15] При краснухе A1-B8 чаще обнаруживался у людей, инфицированных в результате материнской передачи. [16] Также было обнаружено, что A1 ассоциируется с циркуморальным герпесом . [10] Также была описана связь между A1 и герпесом на губах . [17] Впоследствии также была показана связь с простым герпесом . [18]
А1 при лимфоме
При лимфоме Ходжкина HLA-A1, [19] но DR3 не был обнаружен выше. [20] Гаплотип A1-B8-DR3-DQ2 имеет известную связь с Т-клеточной лимфомой, связанной с энтеропатией , приблизительно 70% пациентов являются гомозиготами по DQ2 с по крайней мере одной копией DR3-DQ2.
Аллели
| Исследование населения | Частота (в %) [21] |
|---|---|
| Ирландия Юг | 25.0 |
| Англия Ланкастер | 21.5 |
| Уэльс | 21.1 |
| Ирландия Северная | 20.2 |
| Англия Шеффилд | 19.7 |
| Англия Ливерпуль | 19.4 |
| Англия Ньюкасл | 19.3 |
| Испания Баскская Арратия Валь… | 19.2 |
| Англия Лидс | 19.1 |
| Англия Манчестер | 18.9 |
| Австралия Новый Южный Уэльс | 18.7 |
| Австралия Запад | 18.5 |
| Шотландия Оркнейские острова | 17.0 |
| Южная Африка Натал Тамил | 17.0 |
| Бельгия | 15.5 |
| Северная Италия (1) | 15.4 |
| Израильские евреи | 15.2 |
| Франция Юго-Восток | 15.0 |
| немецкий Эссен | 14.4 |
| Россия Архангельск Поморы | 14.0 |
| Надор Металса (берберский) | 13.7 |
| Швеция Стокгольм | 13.6 |
| Испания Баскский Гипускоа Про… | 13.5 |
| Буркина-Фасо Фулани | 13.3 |
| Пакистан Синдхи | 13.3 |
| Сербия | 13.2 |
| Португальский центр | 13.0 |
| Швеция, округ Уппсала | 13.0 |
| Чешская Республика | 12.7 |
| Индия Андхра-Прадеш Голл… | 12.5 |
| Израиль Газа Палестинцы | 12.4 |
| Индия Мумбаи Маратхи | 12.3 |
| Тунис | 12.3 |
| Алжир1 | 12.3 |
| румынский | 12.2 |
| Италия | 12.1 |
| Россия Северо-Запад | 11.9 |
| Кения Нанди | 11.8 |
| Испания Восточная Андалусия | 11.4 |
| Македония (4) | 11.3 |
| Тунис | 11.2 |
| Турция (я) | 10.9 |
| Испания Северная Кантабрия | 10.8 |
| Греция Север | 10.0 |
| Хорватия | 9.7 |
| Италия Южная Кампания | 9.7 |
| Греция (3) | 9.2 |
| Бразилия | 9.1 |
| Финляндия | 8.9 |
| Саудовская Аравия | 8.7 |
| Испания Каталония Жирона | 8.6 |
| Пакистан Карачи Парси | 8.3 |
| Уганда Кампала | 8.3 |
| Монголия Халха | 8.0 |
| Иордания Амман | 7.9 |
| Испания Северный Кабуэрниго | 7.6 |
| Кения Луо | 7.4 |
| Болгария | 7.3 |
| Россия Чувашский | 7.3 |
| Оман | 7.2 |
| Сингапурский Яванский Индонезийский… | 7.0 |
| Грузия Тбилиси курды | 6.7 |
| Франция Корсика | 6.5 |
| Грузия Тбилиси Грузинский… | 5.7 |
| Грузия Сванетия Сваны | 5.6 |
| Китай Цинхай Хуэй | 5.5 |
| Мыс австралийских аборигенов… | 5.3 |
| Суданский | 5.0 |
| Италия Сардиния(3) | 4.5 |
| Россия Мурманск Саоми | 4.0 |
| Испания Долина Пас | 3.8 |
| Замбия Лусака | 3.5 |
| Буркина-Фасо Римаибе | 3.2 |
| Сингапур Риау Малайский | 3.2 |
| Кения | 3.1 |
| Россия Ненецкая | 3.1 |
| Камерунский пигмей Бакола | 3.0 |
| Таиланд | 2.8 |
| Австралийские аборигены Гру… | 2.7 |
| Сенегал Ниохоло Манденка | 2.7 |
| Камерун Бамилеке | 2.6 |
| Индия Джалпайгури Тото | 2.5 |
| Китай Шанхай | 2.4 |
| Северо-Восток Таиланда | 2.4 |
| Представлены только частоты аллелей | |
| Исследование населения | Частота (в %) [21] |
|---|---|
| Индия Северный Дели | 3.3 |
| Кения Нанди | 2.7 |
| Юго-Восточный Кабо-Верде I… | 1.6 |
| Сенегал Ниохоло Манденка | 1.6 |
| Мали Бандиагара | 1.1 |
| Тунис | 1.0 |
| Гвинея-Бисау | 0.8 |
| Мадейра | 0.8 |
| Афроамериканцы США (3) | 0.7 |
| Аргентина Тоба Росарио | 0,6 |
| США испаноязычный | 0,6 |
| Кения Луо | 0,4 |
| Камерун Бети | 0.3 |
| Россия Тува (2) | 0.3 |
| Уганда Кампала | 0.3 |
| Представлены только частоты аллелей | |
| Исследование населения | Частота (в %) [21] |
|---|---|
| Израиль Ашкенази и не… | 2.1 |
| Кения Нанди | 1.7 |
| Суданский | 1.5 |
| Кения | 0.7 |
| Саудовская Аравия Гураят и… | 0.7 |
| Иран Белудж | 0,6 |
| Ch. Гуандун Мэйчжоу Хань | 0,5 |
| Китай Пекин Шицзячжуань… | 0.2 |
| Представлены только частоты аллелей | |
Большая часть риска заболевания, связанного с A*01:01, представлена либо рисками серотипа A1, либо риском серотипа A1-B8 (в Европе A1-B8 почти всегда состоит из A*01:01 и B*08:01). Другие аллели, A*01:02 и A*01:03, могут нести определенные риски. Например, было обнаружено, что A*01:02 связан с типом инсульта, часто наблюдаемым у детей с серповидноклеточной анемией. [22]
Имеются данные о том, что в сомалийских общинах в США у 2/3 носителей А1 имеется изоформа А*01:03.
Гаплотипы A1-B
- A1-B8 Западная Ирландия, Северная Ирландия, Шотландия, Уэльс, Северо-Западная Англия, Скандинавия, Югославия, Россия,...
- A1-B7 Армения, Австрия, Северо-Западная Европа (региональный рекомбинант между A1-B8 и A2/A3-B7)
- A1-B13 Уральский
- A1-B35 (Албания, Бельгия, Италия, Греция, Франция - Восточно-Средиземноморское происхождение)
- A1-B37 Якуты, племенная Индия, айерс-Индия, монголы, индийцы, орочоны, румыны, югославы, корейцы, албанцы, французы, немцы, маньчжуры
- A1-B51 Югославия, Германия, Иберия, Италия
- A1-B52 Бхаргавы-Индия, Племенная Индия, Италия, Иберия, Франция
- A1-B57 (См. таблицы на странице обсуждения)
- A1-B58 (См. таблицы на странице обсуждения)
Ссылки
- ^ Arce-Gomez B, Jones EA, Barnstable CJ, Solomon E, Bodmer WF (февраль 1978 г.). «Генетический контроль антигенов HLA-A и B в гибридах соматических клеток: потребность в бета2-микроглобулине». Tissue Antigens . 11 (2): 96– 112. doi :10.1111/j.1399-0039.1978.tb01233.x. PMID 77067.
- ^ Форма запроса аллелей IMGT/HLA - Европейский институт биоинформатики
- ^ Шанкаркумар У, Гош К, Прадхан В, Бадакере С, Моханти Д (2005). «Иммуногенетическая ассоциация у пациентов с антинейтрофильными цитоплазматическими антителами (ANCA) из Мумбаи, Махараштра, Индия». J Autoimmun . 24 (3): 227–33 . doi :10.1016/j.jaut.2005.01.009. PMID 15848045.
- ^ Noble JA, Martin A, Valdes AM и др. (2008). «Риск диабета 1 типа для гаплотипов HLA-DR3 зависит от генотипического контекста: ассоциация локусов DPB1 и HLA класса I среди итальянских пациентов и контрольных групп, соответствующих DR3 и DR4». Hum. Immunol . 69 ( 4–5 ): 291–300 . doi :10.1016/j.humimm.2008.02.003. PMC 2505335. PMID 18486765 .
- ^ Noble J, Valdes A, Bugawan T, Apple R, Thomson G, Erlich H (2002). «Локус HLA класса IA влияет на восприимчивость к диабету 1 типа». Hum Immunol . 63 (8): 657– 64. doi :10.1016/S0198-8859(02)00421-4. PMC 4049513. PMID 12121673 .
- ^ Захария Х, Крагбалле К, Теструп-Педерсен К, Киссмейер-Нильсен Ф (1980). «HLA-антигены при циррозе печени, вызванном метотрексатом». Акта Дерм. Венереол . 60 (2): 165–66 . дои : 10.2340/0001555560165166 . PMID 6155028. S2CID 25032022.
- ^ Wagner MM, Darke C (август 1979). «Частоты антигенов HLA-A и B у валлийских угольщиков с пневмокониозом и синдромом Каплана». Tissue Antigens . 14 (2): 165– 8. doi :10.1111/j.1399-0039.1979.tb00834.x. PMID 91226.
- ^ Heise ER, Mentnech MS, Olenchock SA и др. (июнь 1979 г.). «HLA-A1 и пневмокониоз угольщиков». Am. Rev. Respir. Dis . 119 (6): 903– 8. PMID 453710.
- ^ Шанкаркумар У, Гош К, Бадакере С, Моханти Д (2003). «Новые аллели HLA класса I, связанные с индийскими пациентами с проказой». J. Biomed. Biotechnol . 2003 (3): 208–211 . doi : 10.1155/S1110724303210019 . PMC 400212. PMID 12975536.
- ^ ab Russell AS, Schlaut J (октябрь 1975 г.). «Трансплантационные антигены HL-A у субъектов, восприимчивых к рецидивирующему герпесу на губах». Tissue Antigens . 6 (4): 257– 61. doi :10.1111/j.1399-0039.1975.tb00640.x. PMID 1198581.
- ^ Heise ER, Major PC, Mentnech MS, Parrish EJ, Jordon AL, Morgan WK (сентябрь 1975 г.). «Преобладание антигенов гистосовместимости W18 и HL-A1 у шахтеров, устойчивых к осложненному пневмокониозу угольщиков». Inhaled Part . 4 Pt 2: 495–507 . PMID 1236236.
- ↑ Hug G (май 1976 г.). «Генетические факторы и аутоиммунитет при вирусном гепатите». Am. J. Clin. Pathol . 65 (5 Suppl): 870– 5. PMID 218441.
- ^ Honeyman MC, Dorman DC, Menser MA, Forrest JM, Guinan JJ, Clark P (февраль 1975 г.). «Антигены HL-A при врожденной краснухе и роль антигенов 1 и 8 в эпидемиологии естественной краснухи». Tissue Antigens . 5 (1): 12– 8. doi :10.1111/j.1399-0039.1975.tb00520.x. PMID 1138435.
- ^ Harcourt GC, Best JM, Banatvala JE, Kennedy LA (декабрь 1979 г.). «HLA-антигены и ответы на вакцинацию против краснухи». J Hyg (Лондон) . 83 (3): 405–12 . doi :10.1017/S0022172400026231. PMC 2130160. PMID 512353 .
- ^ Овсянникова ИГ, Райан ДЖЕ, Виеркант РА, Панкрац ВС, Якобсон РМ, Польша ГА (декабрь 2005 г.). «Иммунологическое значение генов HLA класса I в иммунных ответах цитокинов ИФН-гамма, специфичных к вирусу кори, и ИЛ-4». Иммуногенетика . 57 (11): 828–36 . doi :10.1007/s00251-005-0061-6. PMID 16331510. S2CID 25508939.
- ^ Форрест Дж. М., Тернбулл Ф. М., Шоллер Г. Ф. и др. (2002). «Пациенты Грегга с врожденной краснухой 60 лет спустя». Med. J. Aust . 177 ( 11– 12): 664– 7. doi :10.5694/j.1326-5377.2002.tb05003.x. PMID 12463994. S2CID 36212779.
- ^ Рассел AS, Шлаут J (декабрь 1977 г.). «Связь антигена HLA-A1 и восприимчивости к рецидивирующему герпесу». Arch Dermatol . 113 (12): 1721– 2. doi :10.1001/archderm.113.12.1721. PMID 596908.
- ^ Джаббар А.А., аль-Самараи А.М., аль-Амар Н.С. (1991). «HLA-антигены, связанные с восприимчивостью к инфекции вируса простого герпеса». Dis. Markers . 9 (5): 281–7 . PMID 1797451.
- ^ Хорс Дж., Доссе Дж. (1983). «HLA и восприимчивость к болезни Ходжкина». Immunol. Rev. 70 : 167–92 . doi : 10.1111/j.1600-065X.1983.tb00714.x. PMID 6403456. S2CID 5400650.
- ^ Hansen JA, Young CW, Whitsett C и др. (1977). «HLA и MLC-типирование у пациентов с болезнью Ходжкина». Prog. Clin. Biol. Res . 16 : 217–27 . PMID 143667.
- ^ abc Middleton, D.; Menchaca, L.; Rood, H.; Komerofsky, R. (2003). "Новая база данных частот аллелей: http://www.allelefrequencies.net". Tissue Antigens . 61 (5): 403– 407. doi :10.1034/j.1399-0039.2003.00062.x. PMID 12753660.
- ^ Hoppe C, Klitz W, Noble J, Vigil L, Vichinsky E, Styles L (апрель 2003 г.). «Отчетливые ассоциации HLA по подтипу инсульта у детей с серповидноклеточной анемией». Blood . 101 (7): 2865– 9. doi : 10.1182/blood-2002-09-2791 . PMID 12517810.
