HDAC4
HDAC4
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыHDAC4 , AHO3, BDMR, HA6116, HD4, HDAC-4, HDAC-A, HDACA, гистондеацетилаза 4, NEDCHID
Внешние идентификаторыОМИМ : 605314; МГИ : 3036234; гомологен : 55946; Генные карты : HDAC4; OMA :HDAC4 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

9759

208727

Ансамбль

ENSG00000068024

ENSMUSG00000026313

UniProt

Р56524

Q6NZM9

РефСек (мРНК)

NM_006037
NM_001378414
NM_001378415
NM_001378416
NM_001378417

NM_207225

RefSeq (белок)

NP_006028
NP_001365343
NP_001365344
NP_001365345
NP_001365346

NP_997108

Местоположение (UCSC)Хр 2: 239,05 – 239,4 МбХр 1: 91.86 – 92.12 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Гистондеацетилаза 4 , также известная как HDAC4 , представляет собой белок , который у людей кодируется геном HDAC4 . [5] [6]

Функция

Гистоны играют важную роль в регуляции транскрипции , прогрессировании клеточного цикла и событиях развития. Ацетилирование /деацетилирование гистонов изменяет структуру хромосом и влияет на доступ факторов транскрипции к ДНК. Белок, кодируемый этим геном, относится к классу II семейства гистондеацетилаз /acuc/apha. Он обладает активностью гистондеацетилазы и подавляет транскрипцию при связывании с промотором. Этот белок не связывает ДНК напрямую, а через факторы транскрипции MEF2C и MEF2D . Он, по-видимому, взаимодействует в мультипротеиновом комплексе с RbAp48 и HDAC3. [7] Кроме того, HDAC4 необходим для миофибробластической дифференцировки, индуцированной TGFbeta1. [8]

Клиническое значение

Исследования показали, что HDAC4 регулирует развитие костей и мышц. Исследователи Гарвардского университета также пришли к выводу, что он способствует здоровому зрению: снижение уровня белка привело к гибели палочковых фоторецепторов и биполярных клеток в сетчатке мышей. [9] [10]

Взаимодействия

Было показано, что HDAC4 взаимодействует с:

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000068024 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000026313 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ ab Grozinger CM, Hassig CA, Schreiber SL (апрель 1999 г.). «Три белка определяют класс человеческих гистондеацетилаз, связанных с дрожжевым Hda1p». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (9): 4868–73. Bibcode : 1999PNAS ... 96.4868G. doi : 10.1073/pnas.96.9.4868 . PMC 21783. PMID  10220385. 
  6. ^ Fischle W, Emiliani S, Hendzel MJ, Nagase T, Nomura N, Voelter W, Verdin E (апрель 1999 г.). «Новое семейство человеческих гистондеацетилаз, связанных с Saccharomyces cerevisiae HDA1p». Журнал биологической химии . 274 (17): 11713–20. doi : 10.1074/jbc.274.17.11713 . PMID  10206986.
  7. ^ "Ген Энтреза: деацетилаза гистонов HDAC4 4".
  8. ^ Glenisson W, Castronovo V, Waltregny D (октябрь 2007 г.). «Гистондеацетилаза 4 необходима для миофибробластической дифференцировки, индуцированной TGFbeta1». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research . 1773 (10): 1572–82. doi : 10.1016/j.bbamcr.2007.05.016 . PMID  17610967.
  9. ^ Белок для зрения , Scientific American , 300 , 3 (март 2009), стр. 23
  10. ^ Chen B, Cepko CL (январь 2009). «HDAC4 регулирует выживание нейронов в нормальной и больной сетчатке». Science . 323 (5911): 256–9. doi :10.1126/science.1166226. PMC 3339762 . PMID  19131628. 
  11. ^ ab Lemercier C, Brocard MP, Puvion-Dutilleul F, Kao HY, Albagli O, Khochbin S (июнь 2002 г.). «Гистондеацетилазы класса II напрямую привлекаются транскрипционным репрессором BCL6». Журнал биологической химии . 277 (24): 22045–52. doi : 10.1074/jbc.M201736200 . PMID  11929873.
  12. ^ Фариоли-Веккьоли С., Танори М., Микели Л., Манкузо М., Леонарди Л., Саран А., Чиотти М.Т., Ферретти Э., Гулино А., Паццалья С., Тироне Ф (июль 2007 г.). «Ингибирование онкогенеза медуллобластомы антипролиферативным и продифференциативным геном PC3». Журнал ФАСЭБ . 21 (9): 2215–25. дои : 10.1096/fj.06-7548com . PMID  17371797. S2CID  4974360.
  13. ^ Micheli L, D'Andrea G, Leonardi L, Tirone F (июль 2017 г.). "HDAC1, HDAC4 и HDAC9 связываются с PC3/Tis21/Btg2 и необходимы для его ингибирования прогрессии клеточного цикла и экспрессии циклина D1" (PDF) . Журнал клеточной физиологии . 232 (7): 1696–1707. doi :10.1002/jcp.25467. PMID  27333946. S2CID  4070837.
  14. ^ Zhang CL, McKinsey TA, Olson EN (октябрь 2002 г.). «Связь деацетилаз гистонов класса II с гетерохроматиновым белком 1: потенциальная роль метилирования гистонов в контроле мышечной дифференцировки». Молекулярная и клеточная биология . 22 (20): 7302–12. doi :10.1128/mcb.22.20.7302-7312.2002. PMC 139799. PMID  12242305 . 
  15. ^ Ватамото К., Товатари М., Одзава Ю., Мията Ю., Окамото М., Абэ А., Наоэ Т., Сайто Х. (декабрь 2003 г.). «Измененное взаимодействие HDAC5 с GATA-1 во время дифференцировки клеток MEL». Онкоген . 22 (57): 9176–84. дои : 10.1038/sj.onc.1206902 . ПМИД  14668799.
  16. ^ abc Fischle W, Dequiedt F, Hendzel MJ, Guenther MG, Lazar MA, Voelter W, Verdin E (январь 2002 г.). «Ферментативная активность, связанная с HDAC класса II, зависит от мультипротеинового комплекса, содержащего HDAC3 и SMRT/N-CoR». Molecular Cell . 9 (1): 45–57. doi :10.1016/s1097-2765(01)00429-4. hdl : 11858/00-001M-0000-002C-9FF9-9 . PMID  11804585.
  17. ^ abc Grozinger CM, Schreiber SL (июль 2000 г.). «Регулирование гистондеацетилазы 4 и 5 и транскрипционной активности с помощью 14-3-3-зависимой клеточной локализации». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (14): 7835–40. Bibcode :2000PNAS...97.7835G. doi : 10.1073 /pnas.140199597 . PMC 16631. PMID  10869435. 
  18. ^ Fischle W, Dequiedt F, Fillion M, Hendzel MJ, Voelter W, Verdin E (сентябрь 2001 г.). «Активность деацетилазы гистонов HDAC7 человека связана с HDAC3 in vivo». Журнал биологической химии . 276 (38): 35826–35. doi : 10.1074/jbc.M104935200 . PMID  11466315.
  19. ^ ab Zhou X, Richon VM, Wang AH, Yang XJ, Rifkind RA, Marks PA (декабрь 2000 г.). «Гистондеацетилаза 4 ассоциируется с внеклеточными сигнально-регулируемыми киназами 1 и 2, и ее клеточная локализация регулируется онкогенным Ras». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (26): 14329–33. Bibcode :2000PNAS...9714329Z. doi : 10.1073/pnas.250494697 . PMC 18918 . PMID  11114188. 
  20. ^ Wang AH, Bertos NR, Vezmar M, Pelletier N, Crosato M, Heng HH, Th'ng J, Han J, Yang XJ (ноябрь 1999 г.). "HDAC4, человеческая гистондеацетилаза, родственная дрожжевой HDA1, является транскрипционным корепрессором". Molecular and Cellular Biology . 19 (11): 7816–27. doi :10.1128/mcb.19.11.7816. PMC 84849 . PMID  10523670. 
  21. ^ Wang AH, Yang XJ (сентябрь 2001 г.). «Гистондеацетилаза 4 обладает внутренними сигналами ядерного импорта и экспорта». Молекулярная и клеточная биология . 21 (17): 5992–6005. doi :10.1128/mcb.21.17.5992-6005.2001. PMC 87317. PMID  11486037 . 
  22. ^ Miska EA, Karlsson C, Langley E, Nielsen SJ, Pines J, Kouzarides T (сентябрь 1999 г.). «HDAC4 деацетилаза ассоциируется с фактором транскрипции MEF2 и подавляет его». The EMBO Journal . 18 (18): 5099–107. doi :10.1093/emboj/18.18.5099. PMC 1171580 . PMID  10487761. 
  23. ^ Lemercier C, Verdel A, Galloo B, Curtet S, Brocard MP, Khochbin S (май 2000 г.). "деацетилаза гистонов mHDA1/HDAC5 взаимодействует с транскрипционной активностью MEF2A и подавляет ее" (PDF) . Журнал биологической химии . 275 (20): 15594–9. doi : 10.1074/jbc.M908437199 . PMID  10748098. S2CID  39220205.
  24. ^ ab Huang EY, Zhang J, Miska EA, Guenther MG, Kouzarides T, Lazar MA (январь 2000 г.). «Ядерные рецепторные корепрессоры взаимодействуют с деацетилазами гистонов класса II в пути репрессии, независимом от Sin3». Genes & Development . 14 (1): 45–54. doi :10.1101/gad.14.1.45. PMC 316335 . PMID  10640275. 
  25. ^ Franco PJ, Li G, Wei LN (август 2003 г.). «Взаимодействие доменов связывания ДНК цинкового пальца ядерного рецептора с гистондеацетилазой». Молекулярная и клеточная эндокринология . 206 (1–2): 1–12. doi :10.1016/s0303-7207(03)00254-5. PMID  12943985. S2CID  19487189.
  26. ^ Franco PJ, Farooqui M, Seto E, Wei LN (август 2001 г.). «Орфанный ядерный рецептор TR2 напрямую взаимодействует с деацетилазами гистонов как класса I, так и класса II». Молекулярная эндокринология . 15 (8): 1318–28. doi : 10.1210/mend.15.8.0682 . PMID  11463856.
  27. ^ Miska EA, Langley E, Wolf D, Karlsson C, Pines J, Kouzarides T (август 2001 г.). «Дифференциальная локализация HDAC4 управляет дифференцировкой мышц». Nucleic Acids Research . 29 (16): 3439–47. doi :10.1093/nar/29.16.3439. PMC 55849. PMID  11504882 . 
  28. ^ Chauchereau A, Mathieu M, de Saintignon J, Ferreira R, Pritchard LL, Mishal Z, Dejean A, Harel-Bellan A (ноябрь 2004 г.). "HDAC4 опосредует транскрипционную репрессию белком PLZF, ассоциированным с острым промиелоцитарным лейкозом". Oncogene . 23 (54): 8777–84. doi : 10.1038/sj.onc.1208128 . PMID  15467736.

Дальнейшее чтение

  • Pazin MJ, Kadonaga JT (май 1997). «Что происходит с деацетилированием и транскрипцией гистонов?». Cell . 89 (3): 325–8. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80211-1 . PMID  9150131. S2CID  11488594.
  • Verdin E, Dequiedt F, Kasler HG (май 2003 г.). «Гистондеацетилазы II класса: универсальные регуляторы». Trends in Genetics . 19 (5): 286–93. doi :10.1016/S0168-9525(03)00073-8. hdl : 2268/80861 . PMID  12711221.
  • Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (апрель 1996 г.). «Метод «двойного адаптера» для улучшенного построения библиотеки дробовика». Аналитическая биохимия . 236 (1): 107–13. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID  8619474.
  • Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование ДНК». Genome Research . 7 (4): 353–8. doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC  139146 . PMID  9110174.
  • Wolffe AP (май 1997). «Транскрипционный контроль. Греховное подавление». Nature . 387 (6628): 16–7. doi : 10.1038/387016a0 . PMID  9139815. S2CID  29803420.
  • Ohara O, Nagase T, Ishikawa K, Nakajima D, Ohira M, Seki N, Nomura N (февраль 1997 г.). «Конструирование и характеристика библиотек ДНК человеческого мозга, подходящих для анализа клонов ДНК, кодирующих относительно большие белки». DNA Research . 4 (1): 53–9. doi : 10.1093/dnares/4.1.53 . PMID  9179496.
  • Fischle W, Emiliani S, Hendzel MJ, Nagase T, Nomura N, Voelter W, Verdin E (апрель 1999 г.). «Новое семейство человеческих гистондеацетилаз, связанных с Saccharomyces cerevisiae HDA1p». Журнал биологической химии . 274 (17): 11713–20. doi : 10.1074/jbc.274.17.11713 . PMID  10206986.
  • Grozinger CM, Hassig CA, Schreiber SL (апрель 1999 г.). «Три белка определяют класс человеческих гистондеацетилаз, связанных с дрожжевым Hda1p». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (9): 4868–73. Bibcode :1999PNAS...96.4868G. doi : 10.1073/pnas.96.9.4868 . PMC  21783 . PMID  10220385.
  • Miska EA, Karlsson C, Langley E, Nielsen SJ, Pines J, Kouzarides T (сентябрь 1999 г.). "HDAC4 деацетилаза ассоциируется с фактором транскрипции MEF2 и подавляет его". The EMBO Journal . 18 (18): 5099–107. doi :10.1093/emboj/18.18.5099. PMC  1171580 . PMID  10487761.
  • Wang AH, Bertos NR, Vezmar M, Pelletier N, Crosato M, Heng HH, Th'ng J, Han J, Yang XJ (ноябрь 1999 г.). "HDAC4, человеческая гистондеацетилаза, родственная дрожжевой HDA1, является транскрипционным корепрессором". Молекулярная и клеточная биология . 19 (11): 7816–27. doi :10.1128/mcb.19.11.7816. PMC  84849. PMID  10523670 .
  • Youn HD, Grozinger CM, Liu JO (июль 2000 г.). «Кальций регулирует транскрипционную репрессию фактора энхансера миоцитов 2 гистондеацетилазой 4». Журнал биологической химии . 275 (29): 22563–7. doi : 10.1074/jbc.C000304200 . PMID  10825153.
  • Grozinger CM, Schreiber SL (июль 2000 г.). «Регулирование гистондеацетилазы 4 и 5 и транскрипционной активности с помощью 14-3-3-зависимой клеточной локализации». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (14): 7835–40. Bibcode :2000PNAS...97.7835G. doi : 10.1073 /pnas.140199597 . PMC  16631. PMID  10869435.
  • Huynh KD, Fischle W, Verdin E, Bardwell VJ (июль 2000 г.). «BCoR, новый корепрессор, участвующий в репрессии BCL-6». Genes & Development . 14 (14): 1810–23. doi :10.1101/gad.14.14.1810. PMC  316791 . PMID  10898795.
  • Li J, Wang J, Wang J, Nawaz Z, Liu JM, Qin J, Wong J (август 2000 г.). «Оба белка-корепрессора SMRT и N-CoR существуют в больших белковых комплексах, содержащих HDAC3». The EMBO Journal . 19 (16): 4342–50. doi :10.1093/emboj/19.16.4342. PMC  302030 . PMID  10944117.
  • Wang AH, Kruhlak MJ, Wu J, Bertos NR, Vezmar M, Posner BI, Bazett-Jones DP, Yang XJ (сентябрь 2000 г.). «Регуляция гистондеацетилазы 4 путем связывания белков 14-3-3». Молекулярная и клеточная биология . 20 (18): 6904–12. doi :10.1128/MCB.20.18.6904-6912.2000. PMC  88766. PMID  10958686 .
  • Zhang CL, McKinsey TA, Lu JR, Olson EN (январь 2001 г.). «Ассоциация белка связывания с COOH-терминалом (CtBP) и взаимодействующего с MEF2 репрессора транскрипции (MITR) способствует транскрипционному подавлению фактора транскрипции MEF2». Журнал биологической химии . 276 (1): 35–9. doi : 10.1074/jbc.M007364200 . PMID  11022042.
  • McKinsey TA, Zhang CL, Lu J, Olson EN (ноябрь 2000 г.). «Сигнально-зависимый ядерный экспорт гистондеацетилазы регулирует мышечную дифференцировку». Nature . 408 (6808): 106–11. Bibcode :2000Natur.408..106M. doi :10.1038/35040593. PMC  4459600 . PMID  11081517.
  • Zhou X, Richon VM, Wang AH, Yang XJ, Rifkind RA, Marks PA (декабрь 2000 г.). «Гистондеацетилаза 4 ассоциируется с внеклеточными сигнально-регулируемыми киназами 1 и 2, и ее клеточная локализация регулируется онкогенным Ras». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (26): 14329–33. Bibcode : 2000PNAS...9714329Z. doi : 10.1073/pnas.250494697 . PMC  18918. PMID  11114188 .
  • McKinsey TA, Zhang CL, Olson EN (декабрь 2000 г.). «Активация фактора транскрипции миоцитарного энхансерного фактора-2 кальций/кальмодулин-зависимым протеинкиназным стимулированным связыванием 14-3-3 с гистондеацетилазой 5». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (26): 14400–5. Bibcode : 2000PNAS ...9714400M. doi : 10.1073/pnas.260501497 . PMC  18930. PMID  11114197.

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .

Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=HDAC4&oldid=1189371786"