HDAC11

HDAC11
Идентификаторы
Псевдонимы	HDAC11 , HD11, гистондеацетилаза 11
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 607226; МГИ : 2385252; Гомологен : 11743; Генные карты : HDAC11; OMA :HDAC11 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 3 (человек)
Конец	13,506,424 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 6 (мышь)
Конец	91,151,674 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	левое яичко; ; нижний ганглий блуждающего нерва; ; правое яичко; ; путамен; ; Миндалевидное тело; ; хвостатое ядро; ; Сегмент С1; ; прилежащее ядро; ; префронтальная кора; ; бледный шар;
	Верх выражен в
	дорсомедиальное гипоталамическое ядро; ; верхний холмик; ; дорсальное ядро покрышки; ; вентральная область покрышки; ; латеральный гипоталамус; ; паравентрикулярное ядро гипоталамуса; ; передняя миндалевидная область; ; вентромедиальное ядро; ; центральное серое вещество среднего мозга; ; Область I гиппокампа;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	НАД-зависимая активность гистондеацетилазы (специфическая для H3-K14); Связывание факторов транскрипции; гидролазная активность; активность гистондеацетилазы; связывание белков;
Клеточный компонент	комплекс гистондеацетилазы; плазматическая мембрана; ядро;
Биологический процесс	деацетилирование гистона H3; развитие олигодендроцитов; регуляция транскрипции, ДНК-шаблонная; деацетилирование гистонов; транскрипция, ДНК-шаблон; организация хроматина;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	79885
	232232
	ENSG00000163517
	ENSMUSG00000034245
	Q96DB2
	Q91WA3
	НМ_001136041 ; НМ_024827 ; НМ_001330636
	NM_144919
	НП_001129513 ; НП_001317565 ; НП_079103
	NP_659168
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Гистондеацетилаза 11 — это фермент гистондеацетилаза массой 39 кДа , который у людей кодируется геном HDAC11 на хромосоме 3 у людей и на хромосоме 6 у мышей. ^[5]^[6]

Это единственный HDAC класса IV , поскольку он не обладает высокой гомологией ни с дрожжевыми ферментами Rpd3, ни с hda1 и поэтому не вписывается ни в класс I, ни в класс II. ^[7] Это самая маленькая изоформа HDAC, и она была впервые описана в 2002 году.

Функция

Гистондеацетилазы, такие как HDAC11, контролируют экспрессию ДНК, модифицируя основные гистоновые октамеры, которые упаковывают ДНК в плотные структуры хроматина и подавляют экспрессию генов. [Предоставлено OMIM] ^[6]

Экспрессия HDAC11 обычно обнаруживается в тканях мозга и яичек, но повышение экспрессии HDAC11 также наблюдалось в различных раковых клетках.

Было показано, что HDAC11 является отрицательным регулятором продукции IL-10 в антигенпрезентирующих клетках. Также было показано, что ингибирование HDAC11 приводит к повышению экспрессии OX40L в клетках лимфомы Ходжкина.

Взаимодействия

Было показано, что HDAC11 взаимодействует с HDAC6 . ^[5]

Смотрите также

Гистондеацетилаза

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000163517 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000034245 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ ab Gao L, Cueto MA, Asselbergs F, Atadja P (июль 2002 г.). «Клонирование и функциональная характеристика HDAC11, нового члена семейства человеческих гистондеацетилаз». Журнал биологической химии . 277 (28): 25748– 55. doi : 10.1074/jbc.M111871200 . PMID 11948178. S2CID 20332854.
^ ab "Ген Entrez: деацетилаза гистонов HDAC11 11".
^ Yang XJ, Seto E (март 2008 г.). «Семейство лизиндеацетилаз Rpd3/Hda1: от бактерий и дрожжей до мышей и людей». Nature Reviews Molecular Cell Biology . 9 (3): 206– 18. doi :10.1038/nrm2346. PMC 2667380. PMID 18292778 .

Дальнейшее чтение

Verdin E, Dequiedt F, Kasler HG (май 2003 г.). «Гистондеацетилазы II класса: универсальные регуляторы». Trends in Genetics . 19 (5): 286–93 . doi :10.1016/S0168-9525(03)00073-8. hdl : 2268/80861 . PMID 12711221.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием in vitro сайт-специфической рекомбинации». Genome Research . 10 (11): 1788– 95. doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863 .
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Reports . 1 (3): 287– 92. doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлигер С., Мерле А., Бектель С., Зауэрманн М., Корф У., Пепперкок Р., Зюльтманн Х., Пустка А. (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования . 14 (10Б): 2136– 44. doi :10.1101/gr.2576704. ПМК 528930 . ПМИД 15489336.
Voelter-Mahlknecht S, Ho AD, Mahlknecht U (октябрь 2005 г.). «Хромосомная организация и локализация нового гена гистондеацетилазы 11 человека класса IV». Международный журнал молекулярной медицины . 16 (4): 589–98 . doi :10.3892/ijmm.16.4.589 (неактивен 1 ноября 2024 г.). PMID 16142391.{{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на ноябрь 2024 г. ( ссылка )
Руаль Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173– 8. Библиографический код : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., Дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бехтель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К.Х., Хубер В., Пепперкок Р., Пустка А., Виманн С. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году». Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D415–8. дои : 10.1093/nar/gkj139. ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901.
Линдберг Д., Акерстрём Г., Вестин Г. (январь 2007 г.). «Мутационный анализ WNT7A и HDAC11 как генов-кандидатов на роль супрессоров опухолей при спорадических злокачественных эндокринных опухолях поджелудочной железы». Клиническая эндокринология . 66 (1): 110– 4. doi :10.1111/j.1365-2265.2006.02694.x. PMID 17201809. S2CID 21975021.

Внешние ссылки

HDAC11+белок,+человек в рубриках медицинских предметов Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 3 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000163517 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000034245 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11948178-5] Gao L, Cueto MA, Asselbergs F, Atadja P (июль 2002 г.). «Клонирование и функциональная характеристика HDAC11, нового члена семейства человеческих гистондеацетилаз». Журнал биологической химии . 277 (28): 25748– 55. doi : 10.1074/jbc.M111871200 . PMID 11948178. S2CID 20332854.

[entrez-6] "Ген Entrez: деацетилаза гистонов HDAC11 11".

[7] Yang XJ, Seto E (март 2008 г.). «Семейство лизиндеацетилаз Rpd3/Hda1: от бактерий и дрожжей до мышей и людей». Nature Reviews Molecular Cell Biology . 9 (3): 206– 18. doi :10.1038/nrm2346. PMC 2667380. PMID 18292778 .