GvpA
| gvpA синтез белка газовых везикул GvpA | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||
| Организм | |||||||
| Символ | гвпА | ||||||
| Энтрез | 1446785 | ||||||
| RefSeq (Прот) | NP_045970.1 | ||||||
| UniProt | Р08958 | ||||||
| Другие данные | |||||||
| хромосома | Геном: 0,02 - 0,02 Мб | ||||||
| |||||||
| GvpA | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | GvpA | ||||||||
| Пфам | ПФ00741 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000638 | ||||||||
| ПРОСИТ | PDOC00207 | ||||||||
| |||||||||
GvpA — это структурный белок газовых везикул , обнаруженный в различных типах бактерий и архей , например, в Halobacterium salinarum или Haloferax mediterranei . Газовые везикулы — это небольшие, полые, заполненные газом белковые структуры, обнаруженные в нескольких цианобактериальных и архебактериальных микроорганизмах. [1] Они позволяют бактериям располагаться на благоприятной глубине для роста .
GvpA ассоциируется с GvpC, образуя газовые везикулы, полые белковые структуры, которые используются планктонными организмами для осуществления вертикальной миграции. GvpA составляет большую часть структуры, так называемые «ребра», жесткие β-слои , тогда как GvpC стабилизирует везикулу от коллапса путем сшивания в α-спирали . [2] [3] [4]
Последовательность
Последовательность GVPa чрезвычайно хорошо сохраняется . Было обнаружено [5], что GvpJ и gvpM, два белка, кодируемые в кластере генов, необходимых для синтеза газовых везикул в архебактериях Halobacterium salinarium и Halobacterium mediterranei (Haloferax mediterranei), эволюционно связаны с GVPa. Точная функция этих двух белков неизвестна, хотя они могут быть важны для определения формы газовых везикул. N-концевой домен белка Aphanizomenon flos-aquae gvpA/J также связан с GVPa.
Структура
GvpA Halobacterium salinarum представляет собой гидрофобный мономер длиной 76 аминокислот и массой 8 кДа. [3]
Газовые везикулы представляют собой полые цилиндрические трубки, закрытые полой конической крышкой на каждом конце. Как конические концевые крышки, так и центральный цилиндр состоят из ребер шириной 4-5 нм , которые проходят под прямым углом к длинной оси структуры. Газовые везикулы , по-видимому, состоят из двух различных белковых компонентов, GVPa и GVPc. GVPa, небольшой белок из примерно 70 аминокислотных остатков, является основным компонентом газовых везикул и образует основное ядро структуры .
Ссылки
- ^ Walsby AE, Hayes PK (декабрь 1989). «Протеины газовых везикул». Biochem. J . 264 (2): 313– 22. doi :10.1042/bj2640313. PMC 1133585 . PMID 2513809.
- ^ Englert C, Pfeifer F (май 1993). «Анализ экспрессии гена газовых пузырьков в Haloferax mediterranei показывает, что GvpA и GvpC являются структурными белками газовых пузырьков». J. Biol. Chem . 268 (13): 9329– 36. doi : 10.1016/S0021-9258(18)98354-7 . PMID 7683649.
- ^ ab UniProt, UniProt GvpA из halobacterium salinarum.
- ^ Walsby AE (март 1994). «Газовые пузырьки». Microbiol. Rev. 58 ( 1): 94– 144. doi :10.1128/mmbr.58.1.94-144.1994. PMC 372955. PMID 8177173 .
- ^ Jones JG, Young DC, DasSarma S (июнь 1991 г.). «Структура и организация кластера генов газовых пузырьков на плазмиде Halobacterium halobium pNRC100». Gene . 102 (1): 117– 22. doi :10.1016/0378-1119(91)90549-Q. PMID 1864501.
