Группа III интрон
Генетический интрон у некоторых простейших

Группа III интронов — это класс интронов , обнаруженных в генах мРНК хлоропластов у эвгленидных протистов . Они имеют обычный тип dVI группы II с выпуклым аденозином, обтекаемый dI, без dII-dV и смягченный консенсус сайта сплайсинга. [1] : рис. 2  Сплайсинг выполняется с помощью двух реакций переэтерификации с выпуклым аденозином dVI в качестве инициирующего нуклеофила ; интрон вырезается как лариат. [2] Мало что известно о том, как они работают, [1] хотя была сконструирована изолированная система трансформации хлоропласта. [3]

Обнаружение и идентификация

В 1984 году Монтандон и Штутц сообщили о примерах нового типа интронов в хлоропласте эвглены . [4] В 1989 году Дэвид А. Кристофер и Ричард Б. Халлик нашли еще несколько примеров и предложили название «Интроны группы III» для идентификации этого нового класса со следующими характеристиками: [5]

  • Интроны группы III намного короче других классов самосплайсинговых интронов, варьируясь от 95 до 110 нуклеотидов среди тех, что известны Кристоферу и Халлику и идентифицированы в хлоропластах. С другой стороны, Кристофер и Халлик заявили: «Напротив, наименьший интрон группы II хлоропласта эвглены ... составляет 277 нуклеотидов». [5]
  • Их консервативные последовательности, расположенные ближе к сайтам сплайсинга, имеют сходство с последовательностями интронов группы II, но имеют меньше консервативных позиций.
  • Они не отображаются в консервативной вторичной структуре интронов группы II. (Действительно, Кристофер и Халлик не смогли идентифицировать какие-либо консервативные элементы вторичной структуры среди интронов группы III.)
  • Обычно они связаны с генами, участвующими в трансляции и транскрипции.
  • Они очень богаты А+Т.

В 1994 году открытие интрона группы III с длиной на один порядок больше показало, что длина сама по себе не является определяющим фактором сплайсинга в интронах группы III. [2]

Сплайсинг интронов группы III происходит посредством образования лариата и кольцевой РНК . [2] Сходства между интронами группы III и ядерными интронами включают консервативные последовательности 5'-границы, образование лариата, отсутствие внутренней структуры и способность использовать альтернативные границы сплайсинга. [1]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abc Copertino DW, Hallick RB (декабрь 1993 г.). "Интроны группы II и группы III твинтронов: потенциальные связи с ядерными пре-мРНК интронами". Trends Biochem. Sci . 18 (12): 467–71 . doi :10.1016/0968-0004(93)90008-b. PMID  8108859.
  2. ^ abc Дональд В. Копертино DW; Холл ET; Ван Хук FW; Дженкинс KP; Халлик RB (1994). "Твинтрон группы III, кодирующий ген, подобный матуразе, вырезает через промежуточные соединения типа лариата". Nucleic Acids Res . 22 (6): 1029– 36. doi :10.1093/nar/22.6.1029. PMC 307926. PMID  7512259 . 
  3. ^ Doetsch, NA; Favreau, MR; Kuscuoglu, N; Thompson, MD; Hallick, RB (февраль 2001 г.). «Трансформация хлоропластов у Euglena gracilis: сплайсинг твинтрона группы III, транскрибированного с трансгенного оперона psbK». Current Genetics . 39 (1): 49– 60. doi :10.1007/s002940000174. PMID  11318107. S2CID  6413004.
  4. ^ Montandon PE, Stutz E (сентябрь 1983 г.). «Нуклеотидная последовательность области генома хлоропласта Euglena gracilis, кодирующая фактор удлинения Tu; доказательства сплайсированной мРНК». Nucleic Acids Res . 11 (17): 5877– 92. doi :10.1093/nar/11.17.5877. PMC 326324. PMID  6310519 . 
  5. ^ ab Christopher DA, Hallick RB (октябрь 1989 г.). "Оперон рибосомального белка хлоропласта Euglena gracilis: новый ген хлоропласта для рибосомального белка L5 и описание новой категории интронов органелл, обозначенной как группа III". Nucleic Acids Res . 17 (19): 7591– 608. doi :10.1093/nar/17.19.7591. PMC 334869. PMID  2477800 . 
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Group_III_intron&oldid=1053701393"