В молекулярной биологии семейство гликозидгидролаз 31 представляет собой семейство гликозидгидролаз .
Гликозидгидролазы EC 3.2.1. — это широко распространенная группа ферментов, которые гидролизуют гликозидную связь между двумя или более углеводами или между углеводом и неуглеводным фрагментом. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению >100 различных семейств. [1] [2] [3] Эта классификация доступна на веб-сайте CAZy , [4] [5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углевод-активных ферментов. [6] [7]
Семейство гликозидгидролаз 31 CAZY GH_31 включает ферменты с несколькими известными видами активности: альфа-глюкозидаза ( EC 3.2.1.20), альфа-галактозидаза ( EC 3.2.1.22); глюкоамилаза ( EC 3.2.1.3), сахараза-изомальтаза ( EC 3.2.1.48) ( EC 3.2.1.10); альфа-ксилозидаза ( EC 3.2.1); альфа-глюканлиаза ( EC 4.2.2.13).
Семейство гликозидгидролаз 31 объединяет ряд гликозилгидролаз на основе сходства последовательностей [8] [9] [10]. Аспарагиновая кислота участвует [11] в каталитической активности сахаразы , изомальтазы и лизосомальной альфа-глюкозидазы .
Внешние ссылки
GH31 в CAZypedia
Ссылки
^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Сохраняющиеся каталитические механизмы и предсказание общей укладки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (15): 7090– 4. Bibcode : 1995PNAS...92.7090H. doi : 10.1073/pnas.92.15.7090 . PMC 41477. PMID 7624375 .
^ Davies G, Henrissat B (сентябрь 1995). "Структуры и механизмы гликозилгидролаз". Structure . 3 (9): 853– 9. doi : 10.1016/S0969-2126(01)00220-9 . PMID 8535779.
^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей». The Biochemical Journal . 316 (Pt 2): 695– 6. doi :10.1042/bj3160695. PMC 1217404. PMID 8687420 .
^ "Главная". CAZy.org . Получено 2018-03-06 .
^ Ломбард В., Голаконда Рамулу Х., Друла Э., Коутиньо П. М., Хенриссат Б. (январь 2014 г.). «База данных углеводно-активных ферментов (CAZy) в 2013 г.». Nucleic Acids Research . 42 (выпуск базы данных): D490-5. doi :10.1093/nar/gkt1178. PMC 3965031. PMID 24270786 .
^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов» (PDF) . Гликобиология . 28 (1): 3– 8. doi : 10.1093/glycob/cwx089 . PMID 29040563.
^ Henrissat B (декабрь 1991 г.). «Классификация гликозилгидролаз на основе сходства аминокислотных последовательностей». The Biochemical Journal . 280 (2): 309– 16. doi :10.1042/bj2800309. PMC 1130547. PMID 1747104 .
^ Kinsella BT, Hogan S, Larkin A, Cantwell BA (декабрь 1991 г.). «Первичная структура и обработка альфа-глюкозидазы Candida tsukubaensis. Гомология с кишечным комплексом сахаразы-изомальтазы кролика и лизосомальной альфа-глюкозидазой человека». European Journal of Biochemistry . 202 (2): 657– 64. doi : 10.1111/j.1432-1033.1991.tb16420.x . PMID 1761061.
^ Naim HY, Niermann T, Kleinhans U, Hollenberg CP, Strasser AW (декабрь 1991 г.). «Поразительное структурное и функциональное сходство предполагает, что кишечная сахараза-изомальтаза, человеческая лизосомальная альфа-глюкозидаза и глюкоамилаза Schwanniomyces occidentalis произошли от общего предкового гена». FEBS Letters . 294 ( 1– 2): 109– 12. doi :10.1016/0014-5793(91)81353-A. PMID 1743281. S2CID 6086792.
^ Hermans MM, Kroos MA, van Beeumen J, Oostra BA, Reuser AJ (июль 1991 г.). «Человеческая лизосомальная альфа-глюкозидаза. Характеристика каталитического сайта». Журнал биологической химии . 266 (21): 13507– 12. doi : 10.1016/S0021-9258(18)92727-4 . PMID 1856189.
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR000322