Геномная информатика

Участок ДНК; последовательность пластинчатых единиц (нуклеотидов) в центре несет информацию .

Геномная информатика (также геноинформатика или обработка генетической информации ) ^[1] — научное исследование обработки информации в геномах .

Введение

Обработка информации и информационный поток происходят в ходе развития организма и на протяжении всей его жизни. ^[2] Суть вычислений заключается в обработке информации, а суть биологической обработки информации — в управлении молекулярными событиями внутри клетки. ^[3] Геномная информатика представляет вычислительные методы и применяет их для получения информации из последовательностей генома. ^[4] Геномная информатика включает методы анализа информации о последовательности ДНК и прогнозирования последовательности и структуры белка . ^[4] Методы изучения больших геномных данных включают вызов вариантов, транскриптомный анализ и интерпретацию вариантов. ^[5] Геномная информатика может анализировать информацию о последовательности ДНК и прогнозировать последовательность и структуру белка . ^[4] Геномная информатика занимается ^[6] микробной и метагеномикой, алгоритмами секвенирования , обнаружением вариантов и сборкой генома, эволюцией, сложными признаками и филогенетикой, персональной и медицинской геномикой, транскриптомикой, структурой и функцией генома. ^[6] Геноинформатика относится к динамике генома и хромосом, количественной биологии и моделированию, молекулярным и клеточным патологиям. ^[7] Геномная информатика также включает в себя область проектирования генома. Мы можем сделать и развить еще очень многое в области геномной информатики. Найти потенциальное заболевание, найти решение для болезни или доказать, почему люди болеют без причины. Для геномной информатики существует несколько основных приложений, в том числе:

анализ геномной информации ^[8]

вычислительное моделирование сетей регуляции генов ^[9]
модели для сложных эукариотических регуляторных последовательностей ДНК ^[9]
алгоритм для обнаружения мотивов ДНК Ab Initio ^[9]

Приложения

Биомолекулярные системы, которые могут обрабатывать информацию, востребованы для вычислительных приложений из-за их потенциала для параллелизма и миниатюризации, а также потому, что их биосовместимость также делает их пригодными для будущих биомедицинских приложений. ДНК использовалась для проектирования машин, двигателей, конечных автоматов, логических вентилей, реакционных сетей и логических программ, среди многих других структур и динамических поведений. ^[10]

Смотрите также

клеточные вычисления

Ссылки

^ Патель, А. (2001). «Почему обработка генетической информации может иметь квантовую основу». Журнал биологических наук . 26 (2): 145–151 . arXiv : quant-ph/0105001 . Bibcode : 2001quant.ph..5001P. doi : 10.1007/BF02703638. ISSN 0250-5991. PMID 11426050. S2CID 12348859.
^ Bajic, Владимир Б.; Wee, Тан Тин (2005). « Обработка информации и живые системы». Серия по достижениям в области биоинформатики и вычислительной биологии . 2. doi :10.1142/p391. ISBN 978-1-86094-563-2. ISSN 1751-6404.
^ Уиллс, Питер Р. (2016-03-13). «ДНК как информация». Философские труды Королевского общества A: Математические, физические и инженерные науки . 374 (2063): 20150417. Bibcode : 2016RSPTA.37450417W. doi : 10.1098/rsta.2015.0417 . hdl : 2292/33048 . PMID 26857666.
^ abc "Геномная информатика - Последние исследования и новости | Nature". www.nature.com . Получено 20.04.2020 .
^ "Genome Informatics (Virtual Conference)". Wellcome Genome Campus Advanced Courses and Scientific Conferences . Архивировано из оригинала 2021-02-27 . Получено 2020-11-14 .
^ ab "Геномная информатика | CSHL". meeting.cshl.edu . Получено 20.04.2020 .
^ "ePole of GenoInformatics". www.ijm.fr (на французском). Архивировано из оригинала 2022-01-08 . Получено 2020-04-21 .
^ Информатика генома человека: перевод генов в здоровье. Ламберт, Кристоф Г., Бейкер, Даррол Дж., Патринос, Джордж П. Лондон, Соединенное Королевство. 2 августа 2018 г. ISBN 978-0-12-813431-3. OCLC 1047959760.{{cite book}}: CS1 maint: местоположение отсутствует издатель ( ссылка ) CS1 maint: другие ( ссылка )
^ abc Bajic, Владимир Б.; Ви, Тан Тин (2005). «Обработка информации и живые системы». Серия по достижениям в области биоинформатики и вычислительной биологии . 2. doi :10.1142/p391. ISBN 978-1-86094-563-2. ISSN 1751-6404.
^ Сантини, Кристина Коста; Бат, Джонатан; Турберфилд, Эндрю Дж.; Тиррелл, Энди М. (2012-04-23). «Сеть ДНК как система обработки информации». Международный журнал молекулярных наук . 13 (4): 5125–5137 . doi : 10.3390/ijms13045125 . ISSN 1422-0067. PMC 3344270. PMID 22606034 .

Эта статья по информатике — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[1] Патель, А. (2001). «Почему обработка генетической информации может иметь квантовую основу». Журнал биологических наук . 26 (2): 145–151 . arXiv : quant-ph/0105001 . Bibcode : 2001quant.ph..5001P. doi : 10.1007/BF02703638. ISSN 0250-5991. PMID 11426050. S2CID 12348859.

[2] ^ Bajic, Владимир Б.; Wee, Тан Тин (2005). « Обработка информации и живые системы». Серия по достижениям в области биоинформатики и вычислительной биологии . 2. doi :10.1142/p391. ISBN 978-1-86094-563-2. ISSN 1751-6404.

[3] Уиллс, Питер Р. (2016-03-13). «ДНК как информация». Философские труды Королевского общества A: Математические, физические и инженерные науки . 374 (2063): 20150417. Bibcode : 2016RSPTA.37450417W. doi : 10.1098/rsta.2015.0417 . hdl : 2292/33048 . PMID 26857666.

[:0-4] "Геномная информатика - Последние исследования и новости | Nature". www.nature.com . Получено 20.04.2020 .

[5] "Genome Informatics (Virtual Conference)". Wellcome Genome Campus Advanced Courses and Scientific Conferences . Архивировано из оригинала 2021-02-27 . Получено 2020-11-14 .

[:1-6] "Геномная информатика | CSHL". meeting.cshl.edu . Получено 20.04.2020 .

[7] "ePole of GenoInformatics". www.ijm.fr (на французском). Архивировано из оригинала 2022-01-08 . Получено 2020-04-21 .

[8] Информатика генома человека: перевод генов в здоровье. Ламберт, Кристоф Г., Бейкер, Даррол Дж., Патринос, Джордж П. Лондон, Соединенное Королевство. 2 августа 2018 г. ISBN 978-0-12-813431-3. OCLC 1047959760.{{cite book}}: CS1 maint: местоположение отсутствует издатель ( ссылка ) CS1 maint: другие ( ссылка )

[:2-9] Bajic, Владимир Б.; Ви, Тан Тин (2005). «Обработка информации и живые системы». Серия по достижениям в области биоинформатики и вычислительной биологии . 2. doi :10.1142/p391. ISBN 978-1-86094-563-2. ISSN 1751-6404.

[10] Сантини, Кристина Коста; Бат, Джонатан; Турберфилд, Эндрю Дж.; Тиррелл, Энди М. (2012-04-23). «Сеть ДНК как система обработки информации». Международный журнал молекулярных наук . 13 (4): 5125–5137 . doi : 10.3390/ijms13045125 . ISSN 1422-0067. PMC 3344270. PMID 22606034 .