GTF2IRD1

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
GTF2IRD1
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыGTF2IRD1 , BEN, CREAM1, GTF3, MUSTRD1, RBAP2, WBS, WBSCR11, WBSCR12, hMusTRD1alpha1, GTF2I повторяющийся домен, содержащий 1
Внешние идентификаторыОМИМ : 604318; МГИ : 1861942; Гомологен : 4158; GeneCards : GTF2IRD1; OMA :GTF2IRD1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

НМ_001199207
НМ_005685
НМ_016328

RefSeq (белок)

НП_001186136
НП_005676
НП_057412

Местоположение (UCSC)Хр 7: 74.45 – 74.6 МбХр 5: 134.39 – 134.49 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Белок 1, содержащий домен повтора общего фактора транскрипции II-I, представляет собой белок , который у человека кодируется геном GTF2IRD1 . [ 5] [6] [7]

Белок, кодируемый этим геном, содержит пять повторов, подобных GTF2I, и каждый повтор обладает потенциальным мотивом спираль-петля-спираль (HLH). Он может иметь способность взаимодействовать с другими белками HLH и функционировать как фактор транскрипции или как положительный регулятор транскрипции под контролем белка ретинобластомы. Этот ген удаляется при синдроме Уильямса , мультисистемном расстройстве развития, вызванном делецией нескольких генов в 7q11.23. Альтернативный сплайсинг этого гена генерирует по крайней мере 2 варианта транскрипта. [7]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000006704 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000023079 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ O'Mahoney JV, Guven KL, Lin J, Joya JE, Robinson CS, Wade RP, Hardeman EC (ноябрь 1998 г.). «Идентификация нового белка, связывающего энхансер медленных мышечных волокон, MusTRD1». Молекулярная и клеточная биология . 18 (11): 6641– 52. doi :10.1128/mcb.18.11.6641. PMC 109249. PMID  9774679 . 
  6. ^ Osborne LR, Campbell T, Daradich A, Scherer SW, Tsui LC (май 1999). «Идентификация предполагаемого гена фактора транскрипции (WBSCR11), который обычно удаляется при синдроме Уильямса-Бойрена». Genomics . 57 (2): 279– 84. doi :10.1006/geno.1999.5784. PMID  10198167.
  7. ^ ab "Ген Entrez: GTF2IRD1 GTF2I повторяющийся домен, содержащий 1".

Дальнейшее чтение

  • Tassabehji M, Carette M, Wilmot C и др. (2000). «Транскрипционный фактор, участвующий в экспрессии генов скелетных мышц, удален у пациентов с синдромом Уильямса». Eur. J. Hum. Genet . 7 (7): 737– 47. doi : 10.1038/sj.ejhg.5200396 . PMID  10573005.
  • Franke Y, Peoples RJ, Francke U (2000). «Идентификация GTF2IRD1, предполагаемого фактора транскрипции в делеции синдрома Уильямса-Бойрена в 7q11.23». Cytogenet. Cell Genet . 86 ( 3– 4): 296– 304. doi :10.1159/000015322. PMID  10575229. S2CID  39033828.
  • Yan X, Zhao X, Qian M и др. (2000). «Характеристика и структура гена нового белка, ассоциированного с белком ретинобластомы, похожего на регулятор транскрипции TFII-I». Biochem. J . 345 Pt 3 (3): 749– 57. doi :10.1042/0264-6021:3450749. PMC  1220813 . PMID  10642537.
  • Tussié-Luna MI, Bayarsaihan D, Ruddle FH, Roy AL (2001). «Репрессия транскрипции, зависящей от TFII-I, путем ядерного исключения». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 98 (14): 7789– 94. Bibcode : 2001PNAS...98.7789T. doi : 10.1073 /pnas.141222298 . PMC  35420. PMID  11438732.
  • Тусси-Луна М.И., Мишель Б., Хакре С., Рой А.Л. (2003). «Член семейства убиквитин-белковых изопептид-лигаз SUMO Miz1/PIASxbeta/Siz2 является транскрипционным кофактором для TFII-I». Ж. Биол. Хим . 277 (45): 43185– 93. doi : 10.1074/jbc.M207635200 . ПМИД  12193603.
  • Tussié-Luna MI, Bayarsaihan D, Seto E и др. (2002). "Физические и функциональные взаимодействия гистондеацетилазы 3 с белками семейства TFII-I и PIASxbeta". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (20): 12807– 12. Bibcode : 2002PNAS...9912807T. doi : 10.1073/pnas.192464499 . PMC  130541. PMID  12239342 .
  • Vullhorst D, Buonanno A (2003). "Характеристика общего фактора транскрипции 3, фактора транскрипции, участвующего в медленной экспрессии мышечно-специфических генов". J. Biol. Chem . 278 (10): 8370– 9. doi : 10.1074/jbc.M209361200 . PMID  12475981.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Hillier LW, Fulton RS, Fulton LA и др. (2003). «Последовательность ДНК человеческой хромосомы 7». Nature . 424 (6945): 157– 64. Bibcode :2003Natur.424..157H. doi : 10.1038/nature01782 . PMID  12853948.
  • Полли П., Хаддади Л.М., Исса Л.Л. и др. (2003). «hMusTRD1alpha1 подавляет активацию MEF2 медленного энхансера тропонина I». Ж. Биол. Хим . 278 (38): 36603– 10. doi : 10.1074/jbc.M212814200 . ПМИД  12857748.
  • Хирота Х., Мацуока Р., Чен XN и др. (2004). «Дефицит визуальной пространственной обработки при синдроме Уильямса, связанный с GTF2IRD1 и GTF2I на хромосоме 7q11.23». Genet. Med . 5 (4): 311– 21. doi :10.1097/01.GIM.0000076975.10224.67. PMID  12865760.
  • Lehner B, Sanderson CM (2004). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека». Genome Res . 14 (7): 1315– 23. doi :10.1101/gr.2122004. PMC  442147. PMID  15231747 .
  • Босолей СА, Едриховски М, Шварц Д и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130– 5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC  514446. PMID  15302935 .
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID  15489334 .
  • Grimsby S, Jaensson H, Dubrovska A и др. (2005). «Идентификация белков, взаимодействующих с Smad3, на основе протеомики: SREBP-2 образует комплекс с Smad3 и подавляет его транскрипционную активность». FEBS Lett . 577 ( 1– 2): 93– 100. doi : 10.1016/j.febslet.2004.09.069 . PMID  15527767. S2CID  82568.
  • Джексон ТА, Тейлор ХЕ, Шарма Д и др. (2005). «Рецептор фактора роста эндотелия сосудов-2: контррегуляция факторами транскрипции TFII-I и TFII-IRD1». J. Biol. Chem . 280 (33): 29856– 63. doi : 10.1074/jbc.M500335200 . PMID  15941713.
  • Rual JF, Venkatesan K, Hao T и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Nature . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  • Tassabehji M, Hammond P, Karmiloff-Smith A и др. (2005). "GTF2IRD1 в краниофациальном развитии людей и мышей". Science . 310 (5751): 1184– 7. Bibcode :2005Sci...310.1184T. doi :10.1126/science.1116142. PMID  16293761. S2CID  26269826.


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=GTF2IRD1&oldid=1142710930"