Фузобактериоты
| Фузобактериоты | |
|---|---|
 | |
| Fusobacterium Novum в жидкой культуре | |
Научная классификация  | |
| Домен: | Бактерии |
| Королевство: | Фузобактерии |
| Тип: | Fusobacteriota Гаррити и Холт 2021 [2] |
| Сорт: | Фузобактерии Стэйли и Уитмен 2012 |
| Заказ: | Fusobacteriales Стэйли и Уитмен 2012 |
| Семьи [1] | |
| |
| Синонимы | |
| |
Fusobacteriota — это облигатно анаэробные неспорообразующие грамотрицательные палочки . Начиная с первых сообщений в конце девятнадцатого века, этим организмам применялись различные названия, иногда одно и то же название применялось к разным видам. Совсем недавно не только произошли изменения в номенклатуре , но и были предприняты попытки дифференцировать виды, которые считаются либо патогенными, либо комменсальными, либо и теми, и другими. Из-за их асахариолитической природы и общей малочисленности положительных результатов в обычных биохимических тестах лабораторная идентификация Fusobacteriota была затруднена. Однако применение новых молекулярно-биологических методов в таксономии установило ряд новых видов, вместе с подвидами Fusobacterium necrophorum и F. nucleatum , и предоставило новые методы идентификации. Участие Fusobacteriota в широком спектре человеческих инфекций, вызывающих некроз тканей и септицемию, давно известно, а совсем недавно было отмечено их значение при внутриамниотических инфекциях, преждевременных родах и тропических язвах.
С момента первых сообщений о Fusobacteriota в конце девятнадцатого века разнообразие названий видов привело к некоторой путанице в родах Fusobacterium и Leptotrichia . Однако новые методы исследования привели к лучшему пониманию таксономии с описанием нескольких новых видов Fusobacteriota. Среди новых описанных видов есть F. ulcerans из тропических язв и несколько видов из полости рта. Также стало возможным подвидообразование важных видов F. necrophorum и F. nucleatum . Вероятно, таксономия Fusobacteriota может быть дополнительно развита в будущем. [3]
Это единственный тип в царстве Fusobacteriati . [4]
Филогения
Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих постоянное место в номенклатуре (LSPN) [5] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI). [6]
| LTP на основе 16S рРНК _10_2024 [7] [8] [9] | 120 маркерных белков на основе GTDB 09-RS220 [10] [11] [12] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
Роль в болезнях человека
Появляются новые доказательства того, что эта бактерия может вызывать или быть связана с раком толстой кишки у человека. В 2011 году исследователи сообщили о наличии Fusobacteriota в тканях рака толстой кишки (Genome Res 2012; 22:292), а новое многоцентровое исследование предоставляет доказательства того, что некоторые случаи, особенно правосторонние, могут быть вызваны инфекцией Fusobacteriota. [13]
Смотрите также
Ссылки
- ^ "Fusobacteriales". Таксономия NCBI . Бетесда, Мэриленд: Национальный центр биотехнологической информации . Получено 3 января 2019 г.
- ^ Oren A, Garrity GM (2021). «Действительная публикация названий сорока двух типов прокариот». Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . PMID 34694987.
- ^ Беннетт, К. У.; Элей, А. (1 октября 1993 г.). «Фузобактерии: новая таксономия и родственные заболевания». Журнал медицинской микробиологии . 39 (4): 246–254 . doi : 10.1099/00222615-39-4-246 . PMID 8411084.
- ^ Гёкер, Маркус; Орен, Аарон (22 января 2024 г.). «Действительная публикация названий двух доменов и семи царств прокариот». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 74 (1). doi :10.1099/ijsem.0.006242.
- ^ JP Euzéby. "Fusobacteria". Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре (LPSN) . Получено 20.03.2016 .
- ^ Sayers; et al. "Fusobacteria". База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Получено 20.03.2016 .
- ^ "The LTP" . Получено 10 декабря 2024 г. .
- ^ "Дерево LTP_all в формате newick" . Получено 10 декабря 2024 г. .
- ^ "LTP_10_2024 Release Notes" (PDF) . Получено 10 декабря 2024 г. .
- ^ "GTDB release 09-RS220". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2024 г.
- ^ "bac120_r220.sp_labels". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2024 г.
- ^ "История таксона". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2024 г.
- ^ Буллман С., Педамаллу К.С., Сичинска Э., Клэнси Т.Э., Чжан Х., Цай Д., Нойберг Д., Хуан К., Гевара Ф., Нельсон Т., Чипашвили О., Хаган Т., Уокер М., Рамачандран А., Диосдадо Б., Серна Г., Мулет. Н, Ландольфи С, Рамон и Кахал С, Фасани Р, Агирре АЖ, Нг К, Элез Э., Огино С., Табернеро Дж., Фукс К.С., Хан В.К., Нусифоро П., Мейерсон М. (2017). «Анализ персистенции фузобактерий и реакции на антибиотики при колоректальном раке». Наука . 358 (6369): 1443–1448 . Бибкод : 2017Sci...358.1443B. doi : 10.1126/science.aal5240. PMC 5823247. PMID 29170280 .
