Francisella novicida

Francisella novicida
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Псевдомонадоты
Сорт:	Гаммапротеобактерии
Заказ:	Тиотрихалес
Семья:	Francisellaceae
Род:	Фрэнсиселла
Разновидность:	F. novicida
Биномиальное имя
Francisella novicida (Ларсон и др. 1955) Олсуфьев и др. 1959 (Утвержденные списки 1980)

Francisella novicida — это бактерия семейства Francisellaceae , состоящего из грамотрицательных патогенных бактерий. Эти бактерии варьируются от мелких кокков до палочковидных и наиболее известны своими внутриклеточными паразитическими способностями. В этом семействе было идентифицировано шесть видов; однако вид F. novicida находится под пристальным вниманием. Хотя некоторые считают, что его следует классифицировать с собственным обозначением вида, другие утверждают, что его следует переклассифицировать в подвид F. tularensis . Если бы его классифицировали как подвид, F. novicida присоединился бы к другим известным подвидам, включая F. t. tularensis (тип A) и F. t. holarctica (тип B). Биохимические анализы для определения подтипов и штаммов F. tularensis не идеальны, поскольку результаты часто неопределенны и подвержены вариациям, поэтому эти анализы следует рассматривать только как дополнительные тесты для определениявидов и подвидов Francisella . ^{[1] [2]} Было описано несколько штаммов F. novicida или бактерий, подобных F. novicida , и эти штаммы могут быть идентифицированы с помощью методов ПЦР. ^[3]

Хотя F. novicida считается редким патогеном, его близкий родственник F. tularensis хорошо известен тем, что вызывает туляремию. В отличие от F. tularensis , не было зафиксировано ни одного случая передачи F. novicida или F. novicida -подобного штамма человеку через укусы членистоногих. Путь заражения большинства случаев заражения человека F. novicida или F. novicida -подобным штаммом неизвестен, хотя упоминается инфицированная вода или лед. Некоторые из основных симптомов, связанных с этой инфекцией, включают пневмонию, мышечные боли и лихорадку, среди многих других. Когда сообщалось о случаях заражения F. novicida или F. novicida -подобными инфекциями, они чаще всего наблюдались у людей с ослабленным иммунитетом. Хотя F. novicida редко ассоциируется с человеческими заболеваниями, несмотря на тесную генетическую связь с F. tularensis , случаи заражения людей были зарегистрированы в Соединенных Штатах. Например, один случай F. novicida был связан с женщиной в Аризоне в 2009 году. ^[1] Кроме того, в 2011 году три подтвержденных случая F. novicida были обнаружены в жилом учреждении в Луизиане. В последнем случае лед был способом передачи; однако, как лед изначально был заражен F. novicida, до сих пор неизвестно. ^[4]

Перевод F. novicida в Francisella tularensis subsp. novicida был рекомендован, и многие микробиологи уже используют это название. Результаты ДНК-ДНК гибридизации и экспериментов по секвенированию генома показывают, что F. novicida генетически близок к F. tularensis . Кроме того, наблюдаемые фенотипические различия согласуются с концепцией подвида. С точки зрения некоторых ученых, нелогично иметь вид F. tularensis с тремя подвидами, поддерживаемыми данными ДНК-ДНК гибридизации, но отличающимися фенотипическими признаками и, таким образом, считающимися отдельным видом. ДНК-ДНК родство составило более 85%. Инфекции человека или животных F. t. novicida очень редки, и мало публикаций описывают их, отчасти потому, что они редко изолируются. Это указывает на то, что большинство лабораторий не могут различать два подвида на основе фенотипа или метаболических потребностей. ^[5] Для медицинских важных организмов, таких как Francisella , существуют четкие руководящие принципы для дифференциации подвидов. Согласно директиве ЕС 2000/54/EC, принятой в 27 европейских странах, F. t. tularensis [ F. tularensis (тип A)] классифицируется как патоген BSL 3, в то время как F. t. holarctica [ F. tularensis (тип B)] классифицируется как патоген BSL 2. Было обнаружено, что у F. novicida и F. tularensis различаются одиннадцать метаболических реакций . Многие ученые утверждают, что этого недостаточно среди 98 признаков, чтобы опровергнуть F. novicida как подвид. Обычно виды бактерий состоят из особей, которые не идентичны по фенотипическим признакам. Например, размер генома Escherichia coli составляет от 4,6 до 5,7 Мб. Это означает, что штаммы одного вида могут различаться на 20-25% своего генома, не влияя на их таксономический статус. Поэтому многие считают, что для того, чтобы различить эти два вида, необходимо больше метаболического разнообразия. Хотя все это говорит в пользу классификации F. novicida как подвида, многие по-прежнему считают, что существует достаточно доказательств для выделения отдельного вида.

При выращивании F. novicida и F. tularensis морфологически кажутся очень похожими. Они оба являются грамотрицательными палочками. Было проведено много тестов, чтобы попытаться различить, следует ли считать F. novicida и F. tularensis отдельными видами. Один из этих тестов включал рост на цистеин-глюкозо-кровяном агаре (CGBA). F. tularensis потребовалось от 2 до 7 дней, чтобы появиться на CGBA, в то время как F. novicida потребовалось всего 24 часа, чтобы появиться. ^[6] F. novicida растет на CGBA намного быстрее, чем F. tularensis . Еще одно различие между ними заключается в том, что вирулентность F. novicida была ниже. F. tularensis был очень вирулентным у мышей и морских свинок, используемых в исследованиях. Для того, чтобы убить животное любого вида, требовалось всего от одной до 10 клеток F. tularensis , хотя для F. novicida требовалось от 10 до 100 клеток у морских свинок и до 1000 клеток у мышей. Однако иммунологические различия являются самым веским доказательством, используемым для поддержки идеи о том, что F. novicida и F. tularensis являются отдельными видами. Неживые вакцины не обеспечивали защиты от гетерологичного организма. Однако эти неживые вакцины обеспечивали защиту от гомологичного организма. Живые вакцины обеспечивали защиту и перекрестную защиту. Никакой защиты от F. tularensis не было продемонстрировано при использовании вакцины F. novicida ни в одном эксперименте. ^[6] Таким образом, по-видимому, существует фундаментальное различие в антигенном составе двух организмов, что также было продемонстрировано перекрестной абсорбцией в тесте пассивной кожной анафилаксии (PCAs). Способность данного антигена удалять всю реактивность из его гомологичной антисыворотки, оставляя гетерологичную антисыворотку нетронутой, указывает на отсутствие антигенной идентичности. Для многих ученых это является достаточным доказательством, чтобы считать F. novicida и F. tularensis отдельными видами. До сих пор ведутся многочисленные споры о том, как классифицировать эти два организма, и для ученых важно установить видовую концепцию для этого организма из-за его медицинской значимости. ^{[ необходима цитата ]}