Формиат-тетрагидрофолатлигаза
| Формиат-тетрагидрофолатрегаза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 6.3.4.3 | ||||||||
| Номер CAS | 9023-66-9 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| ИнтЭнз | IntEnz вид | ||||||||
| БРЕНДА | запись BRENDA | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme вид | ||||||||
| КЕГГ | запись KEGG | ||||||||
| МетаЦик | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| Формиат-тетрагидрофолатрегаза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура формилтетрагидрофолатсинтетазы из moorella thermoacetica | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | ФТХФС | ||||||||
| Пфам | ПФ01268 | ||||||||
| Клан ПФАМ | CL0023 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000559 | ||||||||
| ПРОСИТ | PDOC00595 | ||||||||
| СКОП2 | 1fpm / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
В энзимологии формиат -тетрагидрофолатлигаза ( КФ 6.3.4.3) — это фермент , катализирующий химическую реакцию
- АТФ + формиат + тетрагидрофолат АДФ + фосфат + 10-формилтетрагидрофолат
Тремя субстратами этого фермента являются АТФ , формиат и тетрагидрофолат , тогда как его тремя продуктами являются АДФ , фосфат и 10-формилтетрагидрофолат .
Этот фермент принадлежит к семейству лигаз , в частности, тех, которые образуют общие связи углерод-азот. Этот фермент участвует в метаболизме глиоксилата и дикарбоксилата и в одном углеродном пуле фолата .
У эукариот активность FTHFS выражается многофункциональным ферментом, C-1-тетрагидрофолатсинтаза (C1-THF-синтаза), который также катализирует дегидрогеназную и циклогидролазную активности. Известны две формы синтеза C1-THF, одна из которых расположена в митохондриальном матриксе , а вторая — цитоплазматическая . [1] В обеих формах домен FTHFS состоит примерно из 600 аминокислотных остатков и расположен в C-концевой части C1-THF-синтазы. У прокариот активность FTHFS выражается монофункциональным гомотетрамерным ферментом примерно из 560 аминокислотных остатков. [2]
Номенклатура
Систематическое название этого класса ферментов — формиат:тетрагидрофолатрегаза (АДФ-образующая) . Другие названия, которые обычно используются, включают:
- формилтетрагидрофолатсинтетаза,
- 10-формилтетрагидрофолатсинтетаза,
- тетрагидрофолиевая формилаза и
- тетрагидрофолатоформилаза.
Примеры
Гены человека, кодирующие формиат-тетрагидрофолатлигазы, включают:
Структурные исследования
По состоянию на конец 2007 года для этого класса ферментов были определены 3 структуры с кодами доступа PDB 1EG7, 1FP7 и 1FPM.
Кристаллическая структура N(10)-формилтетрагидрофолатсинтетазы из Moorella thermoacetica показывает, что субъединица состоит из трех доменов, организованных вокруг трех смешанных бета-слоев . Между соседними доменами имеются две полости . Одна из них была идентифицирована как сайт связывания нуклеотидов с помощью гомологического моделирования. Большой домен содержит семицепочечный бета-слоь, окруженный спиралями с обеих сторон. Второй домен содержит пятицепочечный бета-слоь с двумя альфа-спиралями, упакованными с одной стороны, в то время как две другие являются стенкой полости активного центра . Третий домен содержит четырехцепочечный бета-слоь, образующий полубочку. Вогнутая сторона покрыта двумя спиралями, в то время как выпуклая сторона является другой стенкой большой полости. Arg 97, вероятно, участвует в связывании формилфосфата. Тетрамерная молекула относительно плоская и имеет форму буквы X, а активные центры расположены на конце субъединиц вдали от интерфейса субъединицы. [3]
Родственные ферменты
Обратная реакция, превращающая 10-формилтетрагидрофолат в тетрагидрофолат, осуществляется формилтетрагидрофолатдегидрогеназой .
Ссылки
- ^ Шеннон К. В., Рабинович Дж. К. (июнь 1988 г.). «Выделение и характеристика гена MIS1 Saccharomyces cerevisiae, кодирующего митохондриальную C1-тетрагидрофолатсинтазу». J. Biol. Chem . 263 (16): 7717–25. doi : 10.1016/S0021-9258(18)68558-8 . PMID 2836393.
- ^ Lovell CR, Przybyla A, Ljungdahl LG (июнь 1990). "Первичная структура термостабильной формилтетрагидрофолатсинтетазы из Clostridium thermoaceticum". Биохимия . 29 (24): 5687–94. doi :10.1021/bi00476a007. PMID 2200509.
- ^ Radfar R, Shin R, Sheldrick GM, Minor W, Lovell CR, Odom JD, Dunlap RB, Lebioda L (апрель 2000 г.). «Кристаллическая структура N(10)-формилтетрагидрофолатсинтетазы из Moorella thermoacetica». Биохимия . 39 (14): 3920–6. doi :10.1021/bi992790z. PMID 10747779.
Дальнейшее чтение
- JAENICKE L, BRODE E (1961). "[Исследование моноуглеродных соединений. I. Тетрагидрофолатформилаза из печени голубя. Очистка и механизм.]". Biochem. Z. 334 : 108–32. PMID 13789141.
- Long CW; Levitzki A; Houston LL; Koshland DE, Jr (1969). «Структуры субъединиц и взаимодействия синтетазы CTP». Fed. Proc . 28 : 342.
- RABINOWITZ JC, PRICER WE (1962). «Формилтетрагидрофолатсинтетаза. I. Выделение и кристаллизация фермента». J. Biol. Chem . 237 (9): 2898–902. doi : 10.1016/S0021-9258(18)60248-0 . PMID 14489619.
- Whiteley HR, Osborn MJ, Huennekens FM (1959). «Очистка и свойства фермента, активирующего формиат, из Micrococcus aerogenes». J. Biol. Chem . 234 (6): 1538–1543. doi : 10.1016/S0021-9258(18)70046-X . PMID 13654413.
