ФНТА

ФНТА
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1JCQ, 1LD7, 1LD8, 1MZC, 1S63, 1SA4, 1TN6, 2F0Y, 2H6F, 2H6G, 2H6H, 2H6I, 2IEJ, 3E37
Идентификаторы
Псевдонимы	FNTA , FPTA, PGGT1A, PTAR2, фарнезилтрансфераза, CAAX-бокс, альфа
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 134635; МГИ : 104683; Гомологен : 1534; GeneCards : FNTA; ОМА :ФНТА - ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 8 (человек)
Конец	43,085,788 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 8 (мышь)
Конец	26,505,678 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	эпителий десны; ; обонятельная луковица; ; субталамическое ядро; ; нижний ганглий блуждающего нерва; ; протоковая клетка поджелудочной железы; ; амниотическая жидкость; ; околоушная железа; ; кожа бедра; ; зародышевый эпителий; ; тройничный ганглий;
	Верх выражен в
	собирательный проток мозгового вещества; ; двигательное ядро лица; ; ямка; ; Ячейка Панета; ; мыщелок; ; вестибулярная мембрана улиткового протока; ; почечное тельце; ; черная субстанция; ; цилиарное тело; ; мочеточник;
	Больше данных по справочным выражениям
	н/д
Генная онтология
Молекулярная функция	трансферазная активность; активность протеинпренилтрансферазы; активность протеингеранилгеранилтрансферазы; связывание микротрубочек; Активность геранилгеранилтрансферазы Rab; Связывание рецептора тирозинкиназы; связывание альфа-тубулина; активность протеин-фарнезилтрансферазы; активность регулятора ацетилхолинового рецептора; связывание белков; активность пренилтрансферазы; CAAX-белок геранилгеранилтрансферазная активность;
Клеточный компонент	цитоплазма; цитозоль; комплекс белков фарнезилтрансферазы; комплекс, ассоциированный с микротрубочками; Комплекс CAAX-белок геранилгеранилтрансфераза; плазматическая мембрана;
Биологический процесс	позитивная регуляция деацетилирования тубулина; пренилирование белка; геранилгеранилирование белка; развитие нервно-мышечного соединения; кластеризация ацетилхолин-зависимых каналов скелетных мышц; положительная регуляция активности деацетилазы; фарнезилирование белка; сигнальный путь рецептора трансформирующего фактора роста бета; метаболический процесс рецептора нейротрансмиттера; регуляция активности рецепторов нейротрансмиттеров; регуляция сигнального пути, опосредованного родопсином;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	2339
	14272
	ENSG00000168522
	ENSMUSG00000015994
	Р49354
	Q61239
	НМ_001018676 ; НМ_001018677 ; НМ_002027
	NM_008033
	NP_002018
	NP_032059
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Субъединица альфа белка фарнезилтрансферазы/геранилгеранилтрансферазы типа 1 — это фермент , который у человека кодируется геном FNTA . ^[5]^[6]

Пренилтрансферазы присоединяют либо фарнезильную группу, либо геранилгеранильную группу в тиоэфирной связи к цистеиновому остатку белков с C-концевым CAAX-боксом. Геранилгеранилтрансфераза CAAX и фарнезилтрансфераза CAAX являются гетеродимерами, которые имеют одну и ту же альфа-субъединицу, но разные бета-субъединицы. Этот ген кодирует альфа-субъединицу этих трансфераз. Альтернативный сплайсинг приводит к множественным вариантам транскриптов, кодирующим разные изоформы. ^[6]

Взаимодействия

Было показано, что FNTA взаимодействует с рецептором TGF бета 1. ^[7 ]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000168522 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000015994 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Андрес ДА, Милатович А, Озчелик Т, Венцлау ДЖМ, Браун М.С., Голдштейн ДЖЛ, Франке У (февраль 1994 г.). «Клонирование кДНК двух субъединиц человеческой фарнезилтрансферазы CAAX и хромосомное картирование локусов FNTA и FNTB и связанных последовательностей». Геномика . 18 (1): 105–12. doi : 10.1006/geno.1993.1432 . PMID 8276393.
^ ab "Ген Entrez: фарнезилтрансфераза FNTA, CAAX-бокс, альфа".
^ Кавабата М., Имамура Т., Миязоно К., Энгель М.Е., Мозес Х.Л. (декабрь 1995 г.). «Взаимодействие рецептора трансформирующего фактора роста бета типа I с фарнезил-протеинтрансферазой альфа». J. Biol. Chem . 270 (50). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ: 29628–31. doi : 10.1074/jbc.270.50.29628 . ISSN 0021-9258. PMID 8530343.

Дальнейшее чтение

Адамсон П., Маршалл К.Дж., Холл А., Тилбрук ПА. (1992). «Посттрансляционные модификации белков p21rho». J. Biol. Chem . 267 (28): 20033–8. doi : 10.1016/S0021-9258(19)88661-1 . PMID 1400319.
Manne V, Roberts D, Tobin A и др. (1990). «Идентификация и предварительная характеристика протеин-цистеин фарнезилтрансферазы». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 87 (19): 7541–5. Bibcode : 1990PNAS...87.7541M. doi : 10.1073/pnas.87.19.7541 . PMC 54783. PMID 2217184.
Armstrong SA, Hannah VC, Goldstein JL, Brown MS (1995). «CAAX-геранилгеранилтрансфераза переносит фарнезил так же эффективно, как геранилгеранил, в RhoB». J. Biol. Chem . 270 (14): 7864–8. doi : 10.1074/jbc.270.14.7864 . PMID 7713879.
Zhang FL, Diehl RE, Kohl NE и др. (1994). "cDNA cloning and expression of rat and human protein geranylgeranyltransferase type-I". J. Biol. Chem . 269 (5): 3175–80. doi : 10.1016/S0021-9258(17)41845-X . PMID 8106351.
Синенский М., Фантл К., Трухильо М. и др. (1994). «Путь обработки преламина А». J. Cell Sci . 107. (Pt 1): 61–7. doi :10.1242/jcs.107.1.61. PMID 8175923.
Андрес ДА, Голдштейн ДЖЛ, Хо ЙК, Браун МС (1993). "Мутационный анализ альфа-субъединицы белка фарнезилтрансферазы. Доказательства каталитической роли". J. Biol. Chem . 268 (2): 1383–90. doi : 10.1016/S0021-9258(18)54087-4 . PMID 8419339.
Omer CA, Kral AM, Diehl RE и др. (1993). «Характеристика рекомбинантной человеческой фарнезил-протеинтрансферазы: клонирование, экспрессия, связывание фарнезилдифосфата и функциональная гомология с дрожжевыми пренил-протеинтрансферазами». Биохимия . 32 (19): 5167–76. doi :10.1021/bi00070a028. PMID 8494894.
Кавабата М., Имамура Т., Миязоно К. и др. (1996). «Взаимодействие рецептора трансформирующего фактора роста бета типа I с фарнезил-протеинтрансферазой альфа». J. Biol. Chem . 270 (50): 29628–31. doi : 10.1074/jbc.270.50.29628 . PMID 8530343.
Wang T, Danielson PD, Li BY и др. (1996). «Субъединица альфа фарнезилтрансферазы p21(RAS) в передаче сигналов TGF-бета и активина». Science . 271 (5252): 1120–2. Bibcode :1996Sci...271.1120W. doi :10.1126/science.271.5252.1120. PMID 8599089. S2CID 83164753.
Нантаис Д.Э., Швеммле М., Стикни Дж.Т. и др. (1996). «Пренилирование GTP-связывающего белка, индуцированного гамма-интерфероном: человеческий гуанилат-связывающий белок, huGBP1». Дж. Леукок. Биол . 60 (3): 423–31. дои : 10.1002/jlb.60.3.423. PMID 8830800. S2CID 33727864.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов». Genome Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548.
Goalstone ML, Draznin B (1996). «Влияние инсулина на активность фарнезилтрансферазы в адипоцитах 3T3-L1». J. Biol. Chem . 271 (44): 27585–9. doi : 10.1074/jbc.271.44.27585 . PMID 8910345.
Prakash B, Praefcke GJ, Renault L и др. (2000). «Структура человеческого гуанилатсвязывающего белка 1, представляющего уникальный класс ГТФ-связывающих белков». Nature . 403 (6769): 567–71. Bibcode :2000Natur.403..567P. doi :10.1038/35000617. PMID 10676968. S2CID 4431592.
Zeng Q, Si X, Horstmann H и др. (2000). «Зависимая от пренилирования ассоциация протеинтирозиновых фосфатаз PRL-1, -2 и -3 с плазматической мембраной и ранней эндосомой». J. Biol. Chem . 275 (28): 21444–52. doi : 10.1074/jbc.M000453200 . PMID 10747914.
Ashar HR, James L, Gray K и др. (2000). «Ингибиторы фарнезилтрансферазы блокируют фарнезилирование CENP-E и CENP-F и изменяют связь CENP-E с микротрубочками». J. Biol. Chem . 275 (39): 30451–7. doi : 10.1074/jbc.M003469200 . PMID 10852915.
Guenzi E, Töpolt K, Cornali E и др. (2001). «Спиральный домен GBP-1 опосредует ингибирование пролиферации эндотелиальных клеток воспалительными цитокинами». EMBO J . 20 (20): 5568–77. doi :10.1093/emboj/20.20.5568. PMC 125279 . PMID 11598000.
Long SB, Hancock PJ, Kral AM и др. (2001). «Кристаллическая структура человеческой протеиновой фарнезилтрансферазы раскрывает основу для ингибирования тетрапептидами CaaX и их миметиками». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 98 (23): 12948–53. Bibcode : 2001PNAS...9812948L. doi : 10.1073/pnas.241407898 . PMC 60805. PMID 11687658 .
Bell IM, Gallicchio SN, Abrams M и др. (2002). «Ингибиторы фарнезилтрансферазы 3-аминопирролидинона: разработка макроциклических соединений с улучшенной фармакокинетикой и превосходной клеточной активностью». J. Med. Chem . 45 (12): 2388–409. doi :10.1021/jm010531d. PMID 12036349.
Long SB, Casey PJ, Beese LS (2002). «Путь реакции фарнезилтрансферазы белка при атомном разрешении». Nature . 419 (6907): 645–50. Bibcode :2002Natur.419..645L. doi :10.1038/nature00986. PMID 12374986. S2CID 4412580.

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P49354 (субъединица альфа белковой фарнезилтрансферазы/геранилгеранилтрансферазы типа 1) на сайте PDBe-KB .

Эта статья о гене на 8-й хромосоме человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000168522 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000015994 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8276393-5] Андрес ДА, Милатович А, Озчелик Т, Венцлау ДЖМ, Браун М.С., Голдштейн ДЖЛ, Франке У (февраль 1994 г.). «Клонирование кДНК двух субъединиц человеческой фарнезилтрансферазы CAAX и хромосомное картирование локусов FNTA и FNTB и связанных последовательностей». Геномика . 18 (1): 105–12. doi : 10.1006/geno.1993.1432 . PMID 8276393.

[entrez-6] "Ген Entrez: фарнезилтрансфераза FNTA, CAAX-бокс, альфа".

[pmid8530343-7] Кавабата М., Имамура Т., Миязоно К., Энгель М.Е., Мозес Х.Л. (декабрь 1995 г.). «Взаимодействие рецептора трансформирующего фактора роста бета типа I с фарнезил-протеинтрансферазой альфа». J. Biol. Chem . 270 (50). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ: 29628–31. doi : 10.1074/jbc.270.50.29628 . ISSN 0021-9258. PMID 8530343.