FKBP1A
Белок и кодирующий ген у человека

FKBP1A
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыFKBP1A , FKBP-12, FKBP-1A, FKBP1, FKBP12, PKC12, PKCI2, PPIASE, FK506-связывающий белок 1A, FKBP-пролилизомераза 1A
Внешние идентификаторыОМИМ : 186945; МГИ : 95541; гомологен : 105139; Генные карты : FKBP1A; OMA :FKBP1A — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

2280

14225

Ансамбль

ENSG00000088832

ENSMUSG00000032966

UniProt

Р62942

P26883

РефСек (мРНК)

NM_054014
NM_000801
NM_001199786

RefSeq (белок)

NP_000792
NP_001186715
NP_463460

Местоположение (UCSC)Хр 20: 1.37 – 1.39 МбХр 2: 151,38 – 151,4 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Пептидил-пролил цис-транс-изомераза FKBP1A — это фермент , который у людей кодируется геном FKBP1A . [ 5] Его также обычно называют FKBP-12 или FKBP12, и он является членом семейства белков, связывающих FK506 ( FKBP ).

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства иммунофилиновых белков, которые играют роль в иммунорегуляции и основных клеточных процессах, включающих сворачивание и транспортировку белков. Этот кодируемый белок представляет собой цис-транс-пролил-изомеразу , которая связывает иммунодепрессанты FK506 (такролимус) и рапамицин (сиролимус). Он взаимодействует с несколькими внутриклеточными белками передачи сигнала, включая рецептор TGF-бета типа I. Он также взаимодействует с несколькими внутриклеточными каналами высвобождения кальция, включая тетрамерный рецептор рианодина скелетных мышц . У мышей делеция этого гомологичного гена вызывает врожденное заболевание сердца, известное как некомпактность миокарда левого желудочка. Было идентифицировано несколько альтернативно сплайсированных вариантов, кодирующих тот же белок. Геном человека содержит пять псевдогенов, связанных с этим геном, по крайней мере один из которых транскрибируется. [6]

Взаимодействия

Было показано, что FKBP1A взаимодействует с:

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000088832 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000032966 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ DiLella AG (сентябрь 1991 г.). «Хромосомное распределение гена человеческого иммунофилина FKBP-12». Biochemical and Biophysical Research Communications . 179 (3): 1427–33. doi :10.1016/0006-291X(91)91732-R. PMID  1930186.
  6. ^ "Ген Entrez: FKBP1A FK506 связывающий белок 1A, 12kDa".
  7. ^ Chambraud B, Radanyi C, Camonis JH, Shazand K, Rajkowski K, Baulieu EE (декабрь 1996 г.). "FAP48, новый белок, который образует специфические комплексы с иммунофилинами FKBP59 и FKBP12. Профилактика иммунодепрессантами FK506 и рапамицином". Журнал биологической химии . 271 (51): 32923–9. doi : 10.1074/jbc.271.51.32923 . PMID  8955134.
  8. ^ Нейе Х (март 2001 г.). «Мутация белка 48, связанного с FKBP (FAP48), в положении пролина 219 нарушает взаимодействие с FKBP12 и FKBP52». Регуляторные пептиды . 97 (2–3): 147–52. doi :10.1016/s0167-0115(00)00206-8. PMID  11164950. S2CID  20617551.
  9. ^ MacMillan D, Currie S, Bradley KN, Muir TC, McCarron JG (декабрь 2005 г.). «В гладких мышцах белок, связывающий FK506, модулирует вызванное рецептором IP3 высвобождение Ca2+ mTOR и кальциневрином». Journal of Cell Science . 118 (Pt 23): 5443–51. doi : 10.1242/jcs.02657 . PMID  16278292.
  10. ^ Cameron AM, Nucifora FC, Fung ET, Livingston DJ, Aldape RA, Ross CA, Snyder SH (октябрь 1997 г.). «FKBP12 связывает рецептор инозитола 1,4,5-трифосфата с лейцин-пролином (1400-1401) и прикрепляет кальциневрин к этому домену, подобному FK506». Журнал биологической химии . 272 ​​(44): 27582–8. doi : 10.1074/jbc.272.44.27582 . PMID  9346894.
  11. ^ ab Jacinto E, Loewith R, Schmidt A, Lin S, Rüegg MA, Hall A, Hall MN (ноябрь 2004 г.). «Комплекс TOR 2 млекопитающих контролирует актиновый цитоскелет и нечувствителен к рапамицину». Nature Cell Biology . 6 (11): 1122–8. doi :10.1038/ncb1183. PMID  15467718. S2CID  13831153.
  12. ^ ab Sarbassov DD, Ali SM, Kim DH, Guertin DA, Latek RR, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Sabatini DM (июль 2004 г.). «Rictor, новый связывающий партнер mTOR, определяет нечувствительный к рапамицину и независимый от раптора путь, который регулирует цитоскелет». Current Biology . 14 (14): 1296–302. Bibcode :2004CBio...14.1296D. doi : 10.1016/j.cub.2004.06.054 . PMID  15268862. S2CID  4658268.
  13. ^ Choi J, Chen J, Schreiber SL, Clardy J (июль 1996 г.). «Структура комплекса FKBP12-рапамицин, взаимодействующего с доменом связывания человеческого FRAP». Science . 273 (5272): 239–42. Bibcode :1996Sci...273..239C. doi :10.1126/science.273.5272.239. PMID  8662507. S2CID  27706675.
  14. ^ Luker KE, Smith MC, Luker GD, Gammon ST, Piwnica-Worms H, Piwnica-Worms D (август 2004 г.). «Кинетика регулируемых белок-белковых взаимодействий, выявленная с помощью визуализации комплементации люциферазы светлячков в клетках и живых животных». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12288–93. Bibcode : 2004PNAS..10112288L. doi : 10.1073/pnas.0404041101 . PMC 514471. PMID  15284440 . 
  15. ^ Banaszynski LA, Liu CW, Wandless TJ (апрель 2005 г.). «Характеристика тройного комплекса FKBP.rapamycin.FRB». Журнал Американского химического общества . 127 (13): 4715–21. doi :10.1021/ja043277y. PMID  15796538.
  16. ^ Sabers CJ, Martin MM, Brunn GJ, Williams JM, Dumont FJ, Wiederrecht G, Abraham RT (январь 1995 г.). «Выделение белковой мишени комплекса FKBP12-рапамицин в клетках млекопитающих». Журнал биологической химии . 270 (2): 815–22. doi : 10.1074/jbc.270.2.815 . PMID  7822316.
  17. ^ Avila G, Lee EH, Perez CF, Allen PD, Dirksen RT (июнь 2003 г.). «Связывание FKBP12 с RyR1 модулирует сопряжение возбуждения и сокращения в скелетных миотрубках мыши». Журнал биологической химии . 278 (25): 22600–8. doi : 10.1074/jbc.M205866200 . PMID  12704193.
  18. ^ Bultynck G, De Smet P, Rossi D, Callewaert G, Missiaen L, Sorrentino V, De Smedt H, Parys JB (март 2001 г.). «Характеристика и картирование сайта связывания 12 кДа FK506-связывающего белка (FKBP12) на различных изоформах рианодинового рецептора и инозитол-1,4,5-трифосфатного рецептора». The Biochemical Journal . 354 (Pt 2): 413–22. doi :10.1042/bj3540413. PMC 1221670 . PMID  11171121. 
  19. ^ Gaburjakova M, Gaburjakova J, Reiken S, Huang F, Marx SO, Rosemblit N, Marks AR (май 2001 г.). «Связывание FKBP12 модулирует регуляцию канала рианодинового рецептора». Журнал биологической химии . 276 (20): 16931–5. doi : 10.1074/jbc.M100856200 . PMID  11279144.
  20. ^ Wang T, Donahoe PK, Zervos AS (июль 1994). «Специфическое взаимодействие рецепторов типа I семейства TGF-бета с иммунофилином FKBP-12». Science . 265 (5172): 674–6. Bibcode :1994Sci...265..674W. doi :10.1126/science.7518616. PMID  7518616.
  21. ^ Liu F, Ventura F, Doody J, Massagué J (июль 1995 г.). «Человеческий рецептор II типа для костных морфогенетических белков (BMP): расширение модели двухкиназного рецептора на BMP». Молекулярная и клеточная биология . 15 (7): 3479–86. doi :10.1128/mcb.15.7.3479. PMC 230584. PMID  7791754 . 

Дальнейшее чтение

  • Schiene-Fischer C, Yu C (апрель 2001 г.). "Вспомогательные ферменты фолдинга рецепторов: функциональная роль пептидилпролилцис/трансизомераз". FEBS Letters . 495 (1–2): 1–6. doi : 10.1016/S0014-5793(01)02326-2 . PMID  11322937. S2CID  42263861.
  • DiLella AG, Hawkins A, Craig RJ, Schreiber SL, Griffin CA (декабрь 1992 г.). «Назначение хромосомных полос генов, кодирующих человеческие FKBP12 и FKBP13». Biochemical and Biophysical Research Communications . 189 (2): 819–23. doi :10.1016/0006-291X(92)92276-4. PMID  1281998.
  • Jayaraman T, Brillantes AM, Timerman AP, Fleischer S, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Marks AR (май 1992). "FK506-связывающий белок, связанный с каналом высвобождения кальция (рианодиновый рецептор)". Журнал биологической химии . 267 (14): 9474–7. doi : 10.1016/S0021-9258(19)50114-4 . PMID  1374404.
  • Lepre CA, Thomson JA, Moore JM (май 1992). "Структура раствора FK506, связанного с FKBP-12". FEBS Letters . 302 (1): 89–96. doi : 10.1016/0014-5793(92)80292-O . PMID  1375171. S2CID  41469360.
  • Maki N, Sekiguchi F, Nishimaki J, Miwa K, Hayano T, Takahashi N, Suzuki M (июль 1990 г.). «Комплементарная ДНК, кодирующая белок, связывающий FK506 Т-клеток человека, пептидилпролилцис-транс-изомеразу, отличную от циклофилина». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 87 (14): 5440–3. Bibcode : 1990PNAS...87.5440M. doi : 10.1073/pnas.87.14.5440 . PMC  54340. PMID  1695378 .
  • Standaert RF, Galat A, Verdine GL, Schreiber SL (август 1990 г.). «Молекулярное клонирование и сверхэкспрессия человеческого FK506-связывающего белка FKBP». Nature . 346 (6285): 671–4. Bibcode :1990Natur.346..671S. doi :10.1038/346671a0. PMID  1696686. S2CID  4368221.
  • Siekierka JJ, Wiederrecht G, Greulich H, Boulton D, Hung SH, Cryan J, Hodges PJ, Sigal NH (декабрь 1990 г.). «Цитозольный связывающий белок для иммунодепрессанта FK-506 является как повсеместной, так и высококонсервативной пептидил-пролил цис-транс-изомеразой». Журнал биологической химии . 265 (34): 21011–5. doi : 10.1016/S0021-9258(17)45319-1 . PMID  1701173.
  • Michnick SW, Rosen MK, Wandless TJ, Karplus M, Schreiber SL (май 1991). "Структура раствора FKBP, фермента ротамазы и рецептора для FK506 и рапамицина". Science . 252 (5007): 836–9. Bibcode :1991Sci...252..836M. doi :10.1126/science.1709301. PMID  1709301. S2CID  28289138.
  • Van Duyne GD, Standaert RF, Karplus PA, Schreiber SL, Clardy J (май 1991). "Атомная структура FKBP-FK506, комплекса иммунофилин-иммунодепрессант". Science . 252 (5007): 839–42. Bibcode :1991Sci...252..839V. doi :10.1126/science.1709302. PMID  1709302. S2CID  32539611.
  • Rosen MK, Michnick SW, Karplus M, Schreiber SL (май 1991 г.). «Последовательное назначение протонов и азота и определение вторичной структуры человеческого FK506 и белка, связывающего рапамицин». Биохимия . 30 (19): 4774–89. CiteSeerX  10.1.1.559.2890 . doi :10.1021/bi00233a020. PMID  1709363.
  • Jin YJ, Albers MW, Lane WS, Bierer BE, Schreiber SL, Burakoff SJ (август 1991 г.). «Молекулярное клонирование мембранно-ассоциированного человеческого белка FK506 и связывающего рапамицин белка FKBP-13». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 88 (15): 6677–81. Bibcode : 1991PNAS...88.6677J. doi : 10.1073/pnas.88.15.6677 . PMC  52151. PMID  1713687 .
  • DiLella AG, Craig RJ (сентябрь 1991 г.). «Организация экзонов гена FKBP-12 человека: корреляция со структурными и функциональными доменами белка». Биохимия . 30 (35): 8512–7. doi :10.1021/bi00099a002. PMID  1716149.
  • Harding MW, Galat A, Uehling DE, Schreiber SL (октябрь 1989 г.). «Рецептор иммунодепрессанта FK506 — это цис-транс-пептидил-пролил-изомераза». Nature . 341 (6244): 758–60. Bibcode :1989Natur.341..758H. doi :10.1038/341758a0. PMID  2477715. S2CID  4349152.
  • Wang T, Donahoe PK, Zervos AS (июль 1994). "Специфическое взаимодействие рецепторов типа I семейства TGF-бета с иммунофилином FKBP-12". Science . 265 (5172): 674–6. Bibcode :1994Sci...265..674W. doi :10.1126/science.7518616. PMID  7518616.
  • Peattie DA, Hsiao K, Benasutti M, Lippke JA (декабрь 1994 г.). «Три различных матричных РНК могут кодировать белок, связывающий иммунодепрессанты человека FKBP12». Gene . 150 (2): 251–7. doi :10.1016/0378-1119(94)90434-0. PMID  7529739.
  • Yang WM, Inouye CJ, Seto E (июнь 1995 г.). «Циклофилин A и FKBP12 взаимодействуют с YY1 и изменяют его транскрипционную активность». Журнал биологической химии . 270 (25): 15187–93. doi : 10.1074/jbc.270.25.15187 . PMID  7541038.
  • Kawamura A, Su MS (июнь 1995 г.). «Взаимодействие FKBP12-FK506 с кальциневрином A в домене связывания субъединицы B». Журнал биологической химии . 270 (26): 15463–6. doi : 10.1074/jbc.270.26.15463 . PMID  7541044.
  • Griffith JP, Kim JL, Kim EE, Sintchak MD, Thomson JA, Fitzgibbon MJ, Fleming MA, Caron PR, Hsiao K, Navia MA (август 1995 г.). "Рентгеновская структура кальциневрина, ингибируемого комплексом иммунофилин-иммунодепрессант FKBP12-FK506". Cell . 82 (3): 507–22. doi : 10.1016/0092-8674(95)90439-5 . PMID  7543369. S2CID  15502270.
  • Van Duyne GD, Standaert RF, Karplus PA, Schreiber SL, Clardy J (январь 1993 г.). «Атомные структуры комплексов человеческого иммунофилина FKBP-12 с FK506 и рапамицином». Журнал молекулярной биологии . 229 (1): 105–24. doi :10.1006/jmbi.1993.1012. PMID  7678431.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=FKBP1A&oldid=1216296412"