FABP7
Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
FABP7
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыFABP7 , B-FABP, BLBP, FABPB, MRG, LTR2-белок, связывающий жирные кислоты 7
Внешние идентификаторыОМИМ : 602965; МГИ : 101916; гомологен : 37880; GeneCards : FABP7; OMA :FABP7 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

2173

12140

Ансамбль

ENSG00000164434

ENSMUSG00000019874

UniProt

О15540

Р51880

РефСек (мРНК)

NM_001446
NM_001319039
NM_001319041
NM_001319042

NM_021272

RefSeq (белок)

NP_001305968
NP_001305970
NP_001305971
NP_001437

NP_067247

Местоположение (UCSC)Хр 6: 122.78 – 122.78 МбХр 10: 57.66 – 57.66 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Белок, связывающий жирные кислоты 7, мозг ( FABP7 ; также белок, связывающий липиды мозга , BLBP ), является человеческим геном . [5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является мозговым белком, связывающим жирные кислоты. Белки, связывающие жирные кислоты (FABP), представляют собой семейство небольших, высококонсервативных цитоплазматических белков, которые связывают длинноцепочечные жирные кислоты и другие гидрофобные лиганды. Считается, что FABP играют роль в поглощении, транспорте и метаболизме жирных кислот . [5]

FABP7 экспрессируется в ходе развития в радиальной глии путем активации рецепторов Notch . [6] Было показано, что рилин индуцирует экспрессию FABP7 в нейрональных клетках-предшественниках посредством активации Notch-1 . [7]

Согласно одному исследованию, FABP7 связывает DHA с самой высокой степенью сродства среди всех FABP. [8]

Экспрессия белка Fabp7 в мозге мыши на 16-й день эмбрионального развития (слева) и на 0-й день постнатального развития (справа). На обеих стадиях Fabp7 сильно экспрессируется в желудочковой зоне и радиальной глии , где нейрогенез является выраженным.

Роль в патологии

FABP7 картируется на человеческой хромосоме 6q22.31, регионе сцепления с шизофренией , что подтверждается метаанализом. [9]

По состоянию на 2008 год было проведено два исследования FABP7 как возможного гена риска шизофрении , [10] одно из которых, в котором проверялся только один SNP, показало отрицательный результат [11], а другое, с семью SNP, [12] дало положительный результат. Эффект гена в последнем исследовании был сильнее у самцов. Это исследование также связало вариацию FABP7 со слабым преимпульсным торможением у мышей; дефицит PPI ​​является эндофенотипическим признаком, наблюдаемым у пациентов с шизофренией и их родственников.

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000164434 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000019874 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ ab "Ген Энтреза: белок 7, связывающий жирные кислоты FABP7, мозг".
  6. ^ Энтони TE, Мейсон HA, Гридли T, Фишелл G, Хайнц N (май 2005). «Мозговой липид-связывающий белок является прямой целью сигнализации Notch в радиальных глиальных клетках». Гены и развитие . 19 (9): 1028–33. doi :10.1101/gad.1302105. PMC 1091737. PMID  15879553. 
  7. ^ Keilani S, Sugaya K (июль 2008 г.). «Рилин индуцирует радиальный глиальный фенотип в человеческих нейральных прогениторных клетках путем активации Notch-1». BMC Developmental Biology . 8 (1): 69. doi : 10.1186/1471-213X-8-69 . PMC 2447831 . PMID  18593473. 
  8. ^ Xu LZ, Sánchez R, Sali A, Heintz N (октябрь 1996 г.). «Специфичность лиганда белка, связывающего липиды мозга». Журнал биологической химии . 271 (40): 24711–9. doi : 10.1074/jbc.271.40.24711 . PMID  8798739.
  9. ^ Льюис СМ, Левинсон Д.Ф., Уайз Л.Х., ДеЛизи Л.Е., Штрауб Р.Э., Оватта I, Уильямс Н.М., Шваб С.Г., Пулвер А.Е., Фараоне С.В., Бжустович Л.М., Кауфманн К.А., Гарвер Д.Л., Гурлинг Х.М., Линдхольм Э., Кун Х., Мойзес Х.В., Байерли В., Шоу Ш., Месен А., Шеррингтон Р., О'Нил Ф.А., Уолш Д., Кендлер К.С., Экелунд Дж., Паунио Т., Леннквист Дж., Пелтонен Л., О'Донован М.К., Оуэн М.Дж., Вильденауэр Д.Б., Майер В., Нештадт Г., Блуэн Дж.Л., Антонаракис С.Э., Моури Б.Дж., Сильверман Дж.М., Кроу Р.Р., Клонингер Ч.Р., Цуанг М.Т., Маласпина Д., Харкави-Фридман Дж.М., Svrakic DM, Bassett AS, Holcomb J, Kalsi G, McQuillin A, Brynjolfson J, Sigmundsson T, Petursson H, Jazin E, Zoëga T, Helgason T (июль 2003 г.). «Метаанализ сканирования генома шизофрении и биполярного расстройства, часть II: Шизофрения». Американский журнал генетики человека . 73 (1): 34–48. doi : 10.1086/376549. PMC 1180588. PMID 12802786  . 
  10. ^ Обзор генов всех опубликованных исследований связи шизофрении с геном FABP7 — база данных SZGene на веб-сайте Форума по исследованию шизофрении.
  11. ^ Юнгериус Б.Дж., Хугендорн М.Л., Баккер СК, Вант Слот Р., Бардоэль А.Ф., Офофф Р.А., Вейменга С., Кан Р.С., Синке Р.Дж. (ноябрь 2008 г.). «Скрининг ассоциации генов, связанных с миелином, выявил участие гена PIK4CA хромосомы 22q11 в развитии шизофрении». Молекулярная психиатрия . 13 (11): 1060–8. дои : 10.1038/sj.mp.4002080 . ПМИД  17893707.
  12. ^ Watanabe A, Toyota T, Owada Y, Hayashi T, Iwayama Y, Matsumata M, Ishitsuka Y, Nakaya A, Maekawa M, Ohnishi T, Arai R, Sakurai K, Yamada K, Kondo H, Hashimoto K, Osumi N, Yoshikawa T (ноябрь 2007 г.). "Fabp7 сопоставляется с локусом количественного признака эндофенотипа шизофрении". PLOS Biology . 5 (11): e297. doi : 10.1371/journal.pbio.0050297 . PMC 2071943 . PMID  18001149. 

Дальнейшее чтение

  • Börchers T, Hohoff C, Buhlmann C, Spener F (июль 1997 г.). "Связывающий белок жирных кислот сердечного типа - участие в ингибировании роста и дифференциации". Простагландины, лейкотриены и незаменимые жирные кислоты . 57 (1): 77–84. doi :10.1016/S0952-3278(97)90496-8. PMID  9250612.
  • Xu LZ, Sánchez R, Sali A, Heintz N (октябрь 1996 г.). «Специфичность лиганда белка, связывающего липиды мозга». Журнал биологической химии . 271 (40): 24711–9. doi : 10.1074/jbc.271.40.24711 . PMID  8798739.
  • Young JK, Baker JH, Muller T (март 1996 г.). «Иммунореактивность белка, связывающего жирные кислоты мозга, в гомори-позитивных астроцитах». Glia . 16 (3): 218–26. doi :10.1002/(SICI)1098-1136(199603)16:3<218::AID-GLIA4>3.0.CO;2-Y. PMID  8833192. S2CID  9757285.
  • Shi YE, Ni J, Xiao G, Liu YE, Fuchs A, Yu G, Su J, Cosgrove JM, Xing L, Zhang M, Li J, Aggarwal BB, Meager A, Gentz ​​R (август 1997 г.). «Противоопухолевая активность нового ингибитора роста рака молочной железы человека, гена, связанного с ингибитором роста молочной железы, MRG». Cancer Research . 57 (15): 3084–91. PMID  9242429.
  • Shimizu F, Watanabe TK, Shinomiya H, Nakamura Y, Fujiwara T (октябрь 1997 г.). "Выделение и экспрессия кДНК для белка, связывающего жирные кислоты человеческого мозга (B-FABP)". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия генов . 1354 (1): 24–8. doi :10.1016/S0167-4781(97)00115-2. PMID  9375786.
  • Godbout R, Bisgrove DA, Shkolny D, Day RS (апрель 1998 г.). «Корреляция экспрессии B-FABP и GFAP при злокачественной глиоме». Oncogene . 16 (15): 1955–62. doi : 10.1038/sj.onc.1201740 . PMID  9591779.
  • Pu L, Igbavboa U, Wood WG, Roths JB, Kier AB, Spener F, Schroeder F (август 1999). «Экспрессия белков, связывающих жирные кислоты, изменяется в мозге старых мышей». Молекулярная и клеточная биохимия . 198 (1–2): 69–78. doi :10.1023/A:1006946027619. PMID  10497880. S2CID  6180992.
  • Balendiran GK, Schnutgen F, Scapin G, Borchers T, Xhong N, Lim K, Godbout R, Spener F, Sacchettini JC (сентябрь 2000 г.). «Кристаллическая структура и термодинамический анализ белка, связывающего жирные кислоты человеческого мозга». Журнал биологической химии . 275 (35): 27045–54. doi : 10.1074/jbc.M003001200 . PMID  10854433.
  • Rademacher M, Zimmerman AW, Rüterjans H, Veerkamp JH, Lücke C (октябрь 2002 г.). «Структура раствора белка, связывающего жирные кислоты, из человеческого мозга». Молекулярная и клеточная биохимия . 239 (1–2): 61–8. doi :10.1023/A:1020566909213. PMID  12479569. S2CID  24296178.
  • Miller SJ, Li H, Rizvi TA, Huang Y, Johansson G, Bowersock J, Sidani A, Vitullo J, Vogel K, Parysek LM, DeClue JE, Ratner N (март 2003 г.). "Мозговой липидсвязывающий белок во взаимодействиях аксон-шванновские клетки и периферический нервный опухолегенез". Молекулярная и клеточная биология . 23 (6): 2213–24. doi :10.1128/MCB.23.6.2213-2224.2003. PMC  149461. PMID  12612091 .
  • Санчес-Фонт М.Ф., Бош-Комас А., Гонсалес-Дуарте Р., Марфани Г. (июнь 2003 г.). «Сверхэкспрессия FABP7 в мозге плода с синдромом Дауна связана с дисбалансом дозировки гена PKNOX1». Исследования нуклеиновых кислот . 31 (11): 2769–77. дои : 10.1093/nar/gkg396. ПМК  156729 . ПМИД  12771203.
  • Wang M, Liu YE, Goldberg ID, Shi YE (ноябрь 2003 г.). «Индукция дифференциации молочной железы у трансгенных мышей с помощью белка MRG, связывающего жирные кислоты». Журнал биологической химии . 278 (47): 47319–25. doi : 10.1074/jbc.M308131200 . PMID  12975368.
  • Liang Y, Diehn M, Watson N, Bollen AW, Aldape KD, Nicholas MK, Lamborn KR , Berger MS, Botstein D, Brown PO, Israel MA (апрель 2005 г.). «Профилирование экспрессии генов выявляет молекулярно и клинически различные подтипы мультиформной глиобластомы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (16): 5814–9. Bibcode : 2005PNAS..102.5814L. doi : 10.1073/pnas.0402870102 . PMC  556127. PMID  15827123 .
  • Liang Y, Bollen AW, Aldape KD, Gupta N (2006). "Ядерная иммунореактивность FABP7 преимущественно выражена в инфильтративной глиоме и связана с плохим прогнозом при глиобластоме с повышенной экспрессией EGFR". BMC Cancer . 6 : 97. doi : 10.1186/1471-2407-6-97 . PMC  1479358 . PMID  16623952.
  • Kaloshi G, Mokhtari K, Carpentier C, Taillibert S, Lejeune J, Marie Y, Delattre JY, Godbout R, Sanson M (сентябрь 2007 г.). «Экспрессия FABP7 в глиобластомах: связь с прогнозом, инвазией и статусом EGFR». Журнал нейроонкологии . 84 (3): 245–8. doi :10.1007/s11060-007-9377-4. PMID  17415524. S2CID  23880935.
  • Takaoka N, Takayama T, Teratani T, Sugiyama T, Mugiya S, Ozono S (2011). "Анализ регуляции экспрессии белка 7, связывающего жирные кислоты, в клеточных линиях почечной карциномы человека". BMC Molecular Biology . 12 (1): 31. doi : 10.1186/1471-2199-12-31 . PMC  3162894. PMID  21771320 .
  • Шизофрения, реакция испуга и Fabp7: Будущие изменения в питании для матерей из группы риска? Блог Schizophrenia Daily News, 2007-11-07
  • Гросс Л. (2007). «Ген-кандидат на роль биологического маркера шизофрении у мышей». PLOS Biology . 5 (11): e320. doi : 10.1371/journal.pbio.0050320 . PMC  2071941. PMID  20076655 .- краткий обзор для широкой аудитории.
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O15540 (белок, связывающий жирные кислоты, мозг) на сайте PDBe-KB .
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=FABP7&oldid=1188012160"