Экзонуклеаза III | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||
Организм | |||||||
Символ | xthA | ||||||
Альтернативные символы | ExoIII | ||||||
Энтрез | 946254 | ||||||
RefSeq (Прот) | NP_416263 | ||||||
UniProt | Р09030 | ||||||
Другие данные | |||||||
Номер ЕС | 3.1.11.2 | ||||||
хромосома | геном: 1,83 - 1,83 Мб | ||||||
|
Экзонуклеаза III (ExoIII) — фермент , принадлежащий к семейству экзонуклеаз . ExoIII катализирует поэтапное удаление мононуклеотидов с 3´-гидроксильных концов двухцепочечной ДНК . [1] Во время каждого события связывания удаляется ограниченное количество нуклеотидов , что приводит к скоординированным прогрессивным делециям в популяции молекул ДНК . [2]
Предпочтительными субстратами являются тупые или углубленные 3´-концы, хотя ExoIII также действует на надрезы в дуплексной ДНК, создавая одноцепочечные разрывы. Фермент не активен на одноцепочечной ДНК, и, таким образом, 3´-выступающие концы устойчивы к расщеплению. Степень устойчивости зависит от длины удлинения, при этом удлинения длиной 4 основания или длиннее по существу устойчивы к расщеплению. Это свойство используется для создания однонаправленных делеций из линейной молекулы с одним устойчивым (3´-выступ) и одним восприимчивым (тупым или 5´-выступ) концом. [3]
Активность ExoIII частично зависит от спиральной структуры ДНК [4] и проявляет зависимость от последовательности (C>A=T>G) [5] .
Также сообщалось, что ExoIII обладает активностью РНКазы H, 3´-фосфатазы и AP-эндонуклеазы. [1]
Существует много различных экзонуклеаз, и многие из них еще предстоит открыть в бактериях, текущие исследования проводятся на E. coli . Многие экзонуклеазы попадают в суперсемейства с различными доменами жизни, что доказывает, что экзонуклеаза III является древней. Экзонуклеазы появились на ранних этапах истории жизни и играют жизненно важную биологическую роль. [6]
Температура , концентрация соли и соотношение фермента и ДНК существенно влияют на активность фермента, поэтому условия реакции должны подбираться в соответствии с конкретными задачами.