ЭПРС

ЭПРС1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1FYJ, 4HVC, 4K86, 4K87, 4K88, 5A34, 5BMU, 5A1N, 5A5H
Идентификаторы
Псевдонимы	EPRS1 , EARS, GLUPRORS, PARS, QARS, QPRS, PIG32, глутамил-пролил-тРНК-синтетаза, HLD15, глутамил-пролил-тРНК-синтетаза 1, EPRS
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 138295; МГИ : 97838; гомологен : 5870; GeneCards : EPRS1; OMA :EPRS1 – ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 1 (человек)
Конец	220,046,530 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 1 (мышь)
Конец	185,160,557 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	околоушная железа; ; зрительный нерв; ; вторичный ооцит; ; Ахиллово сухожилие; ; латеральная группа ядер таламуса; ; желудочковая зона; ; большеберцовая кость; ; островок Лангерганса; ; внешний бледный шар; ; Район Бродмана 23;
	Верх выражен в
	слуховая плакода; ; Ростральный миграционный поток; ; околоушная железа; ; мешочек; ; верхнечелюстной выступ; ; человеческий плод; ; выступ нижней челюсти; ; хвост эмбриона; ; генитальный бугорок; ; слуховой пузырек;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание нуклеотидов; связывание белков; Связывание РНК-стебля с петлей; Связывание АТФ; каталитическая активность; активность лигазы; активность аминоацил-тРНК-лигазы; Связывание ГТФазы; Связывание РНК; активность глутамат-тРНК-лигазы; активность пролин-тРНК-лигазы; связывание ионов цинка; активность гомодимеризации белка; связывание ионов металлов; идентичное связывание белков;
Клеточный компонент	мембрана; Комплекс ПОХОДКИ; цитоплазма; мультиферментный комплекс аминоацил-тРНК-синтетазы; цитозоль; плазматическая мембрана; рибонуклеопротеиновый комплекс;
Биологический процесс	регулирование перевода; аминоацилирование тРНК; метаболизм; биосинтез белка; Аминоацилирование тРНК для трансляции белка; негативная регуляция трансляции; клеточный ответ на интерферон-гамма; аминоацилирование глутамил-тРНК; аминоацилирование пролил-тРНК; клеточный ответ на стимуляцию инсулином; Импорт длинноцепочечных жирных кислот в клетку; белок-содержащий комплексный агрегат; регуляция импорта длинноцепочечных жирных кислот в клетку;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	2058
	107508
	ENSG00000136628
	ENSMUSG00000026615
	Р07814
	Q8CGC7
	NM_004446
	NM_029735 ; NM_001357474
	NP_004437
	NP_084011 ; NP_001344403
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Бифункциональная аминоацил-тРНК-синтетаза — это фермент , который у человека кодируется геном EPRS . [ ^5]^[6]

Ген

Для этого гена наблюдался альтернативный сплайсинг, но полноразмерная природа и биологическая ценность варианта не были определены. ^[6]

Функция

Аминоацил-тРНК-синтетазы — это класс ферментов, которые заряжают тРНК своими родственными аминокислотами. Белок, кодируемый этим геном, является многофункциональной аминоацил-тРНК-синтетазой, которая катализирует аминоацилирование глутаминовой кислоты и пролиновых видов тРНК. ^[6]

Сообщается, что фосфорилирование EPRS необходимо для формирования комплекса GAIT (гамма-интерферон-активируемый ингибитор трансляции), который регулирует трансляцию множества генов в моноцитах и макрофагах . ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что EPRS взаимодействует с POU2F1 ^[8] , белком теплового шока 90 кДа альфа (цитозольным), членом A1 ^[9] и IARS ^[10] .

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000136628 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000026615 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Fett R, Knippers R (февраль 1991). "Первичная структура человеческой глутаминил-тРНК-синтетазы. Высококонсервативное ядро, области повторения аминокислот и гомологии с факторами удлинения трансляции". J Biol Chem . 266 (3): 1448–55 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)52315-2 . PMID 1988429.
^ abc "Ген Энтреза: глутамил-пролил-тРНК-синтетаза EPRS".
^ Ариф А, Цзя Дж, Мукхопадхай Р, Уиллард Б, Кинтер М, Фокс ПЛ (июль 2009 г.). «Двухсайтовое фосфорилирование EPRS координирует мультимодальную регуляцию неканонической трансляционной контрольной активности». Mol. Cell . 35 (2): 164– 80. doi :10.1016/j.molcel.2009.05.028. PMC 2752289 . PMID 19647514.
^ Nie J, Sakamoto S, Song D, Qu Z, Ota K, Taniguchi T (март 1998). "Взаимодействие Oct–1 и домена автомодификации поли(АДФ-рибозы)синтетазы". FEBS Lett . 424 ( 1– 2): 27– 32. doi : 10.1016/S0014-5793(98)00131-8 . PMID 9537509. S2CID 872132.
^ Kang J, Kim T, Ko YG, Rho SB, Park SG, Kim MJ, Kwon HJ, Kim S (октябрь 2000 г.). «Белок теплового шока 90 опосредует белок-белковые взаимодействия между аминоацил-тРНК-синтетазами человека». J. Biol. Chem . 275 (41): 31682– 8. doi : 10.1074/jbc.M909965199 . ISSN 0021-9258. PMID 10913161.
^ Rho SB, Lee JS, Jeong EJ, Kim KS, Kim YG, Kim S (май 1998). «Многофункциональный повторяющийся мотив присутствует в человеческой бифункциональной тРНК-синтетазе». J. Biol. Chem . 273 (18): 11267– 73. doi : 10.1074/jbc.273.18.11267 . ISSN 0021-9258. PMID 9556618.

Дальнейшее чтение

Kaiser E, Eberhard D, Knippers R (1992). «Экзоны, кодирующие высококонсервативную часть человеческой глутаминил-тРНК-синтетазы». J. Mol. Evol . 34 (1): 45– 53. Bibcode :1992JMolE..34...45K. doi :10.1007/BF00163851. PMID 1556743. S2CID 6021527.
Norcum MT (1991). «Структурный анализ комплекса аминоацил-тРНК-синтетазы с высокой молекулярной массой. Влияние нейтральных солей и детергентов». J. Biol. Chem . 266 (23): 15398– 405. doi : 10.1016/S0021-9258(18)98629-1 . PMID 1651330.
Серини С., Керджан П., Астье М. и др. (1992). «Компонентом мультисинтетазного комплекса является многофункциональная аминоацил-тРНК-синтетаза». ЭМБО Дж . 10 (13): 4267–77 . doi :10.1002/j.1460-2075.1991.tb05005.x. ПМЦ 453179 . ПМИД 1756734.
Кунце Н., Биттлер Э., Фетт Р. и др. (1990). «Локус QARS человека: присвоение человеческого гена глутаминил-тРНК-синтетазы хромосоме 1q32-42». Хм. Жене . 85 (5): 527–30 . doi : 10.1007/BF00194231. PMID 2227938. S2CID 27487450.
Thömmes P, Fett R, Schray B, et al. (1988). "Основная область гомологии человеческой глутаминил-тРНК-синтетазы с ферментами Escherichia coli и дрожжей". Nucleic Acids Res . 16 (12): 5391– 406. doi :10.1093/nar/16.12.5391. PMC 336774. PMID 3290852 .
Kaiser E, Hu B, Becher S и др. (1994). «Человеческий локус EPRS (ранее локус QARS): ген, кодирующий аминоацил-тРНК-синтетазу класса I и класса II». Genomics . 19 (2): 280–90 . doi :10.1006/geno.1994.1059. PMID 8188258.
Хиллер Л. Д., Леннон Г., Беккер М. и др. (1997). «Создание и анализ 280 000 экспрессируемых человеком последовательностей». Genome Res . 6 (9): 807–28 . doi : 10.1101/gr.6.9.807 . PMID 8889549.
Rho SB, Lee JS, Jeong EJ и др. (1998). «Многофункциональный повторяющийся мотив присутствует в бифункциональной тРНК-синтетазе человека». J. Biol. Chem . 273 (18): 11267– 73. doi : 10.1074/jbc.273.18.11267 . PMID 9556618.
Quevillon S, Robinson JC, Berthonneau E и др. (1999). «Макромолекулярная сборка аминоацил-тРНК-синтетаз: идентификация белок-белковых взаимодействий и характеристика основного белка». J. Mol. Biol . 285 (1): 183–95 . doi :10.1006/jmbi.1998.2316. PMID 9878398.
Kang J, Kim T, Ko YG и др. (2000). «Белок теплового шока 90 опосредует белок-белковые взаимодействия между аминоацил-тРНК-синтетазами человека». J. Biol. Chem . 275 (41): 31682– 8. doi : 10.1074/jbc.M909965199 . PMID 10913161.
Jeong EJ, Hwang GS, Kim KH и др. (2001). «Структурный анализ многофункциональных пептидных мотивов в бифункциональной тРНК-синтетазе человека: идентификация остатков, связывающих РНК, и функциональные последствия для тандемных повторов». Биохимия . 39 (51): 15775– 82. doi :10.1021/bi001393h. PMID 11123902. S2CID 25514243.
Санг Ли Дж., Гю Пак С., Пак Х. и др. (2002). «Сеть взаимодействия человеческих аминоацил-тРНК-синтетаз и субъединиц комплекса фактора элонгации 1». Biochem. Biophys. Res. Commun . 291 (1): 158– 64. doi :10.1006/bbrc.2002.6398. PMID 11829477.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H и др. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала человеческого TNF-альфа/NF-каппа B». Nat. Cell Biol . 6 (2): 97– 105. doi :10.1038/ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986.
Босолей СА, Едриховски М, Шварц Д и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130– 5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446. PMID 15302935 .
Сампат П., Мазумдер Б., Сешадри В. и др. (2004). «Неканоническая функция глутамил-пролил-тРНК-синтетазы: ген-специфическое подавление трансляции». Клетка . 119 (2): 195–208 . doi : 10.1016/j.cell.2004.09.030 . PMID 15479637. S2CID 18944876.
Kato T, Daigo Y, Hayama S и др. (2005). «Новая человеческая тРНК-дигидроуридинсинтаза, участвующая в легочном канцерогенезе». Cancer Res . 65 (13): 5638– 46. doi :10.1158/0008-5472.CAN-05-0600. PMID 15994936.
Босолей СА, Виллен ДЖ, Гербер СА и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации участков». Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285– 92. doi :10.1038/nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.
Ewing RM, Chu P, Elisma F и др. (2007). "Крупномасштабное картирование взаимодействий белок-белок человека с помощью масс-спектрометрии". Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948 . PMID 17353931.

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 1 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000136628 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000026615 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1988429-5] Fett R, Knippers R (февраль 1991). "Первичная структура человеческой глутаминил-тРНК-синтетазы. Высококонсервативное ядро, области повторения аминокислот и гомологии с факторами удлинения трансляции". J Biol Chem . 266 (3): 1448–55 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)52315-2 . PMID 1988429.

[entrez-6] "Ген Энтреза: глутамил-пролил-тРНК-синтетаза EPRS".

[pmid19647514-7] Ариф А, Цзя Дж, Мукхопадхай Р, Уиллард Б, Кинтер М, Фокс ПЛ (июль 2009 г.). «Двухсайтовое фосфорилирование EPRS координирует мультимодальную регуляцию неканонической трансляционной контрольной активности». Mol. Cell . 35 (2): 164– 80. doi :10.1016/j.molcel.2009.05.028. PMC 2752289 . PMID 19647514.

[pmid9537509-8] Nie J, Sakamoto S, Song D, Qu Z, Ota K, Taniguchi T (март 1998). "Взаимодействие Oct–1 и домена автомодификации поли(АДФ-рибозы)синтетазы". FEBS Lett . 424 ( 1– 2): 27– 32. doi : 10.1016/S0014-5793(98)00131-8 . PMID 9537509. S2CID 872132.

[pmid10913161-9] Kang J, Kim T, Ko YG, Rho SB, Park SG, Kim MJ, Kwon HJ, Kim S (октябрь 2000 г.). «Белок теплового шока 90 опосредует белок-белковые взаимодействия между аминоацил-тРНК-синтетазами человека». J. Biol. Chem . 275 (41): 31682– 8. doi : 10.1074/jbc.M909965199 . ISSN 0021-9258. PMID 10913161.

[pmid9556618-10] Rho SB, Lee JS, Jeong EJ, Kim KS, Kim YG, Kim S (май 1998). «Многофункциональный повторяющийся мотив присутствует в человеческой бифункциональной тРНК-синтетазе». J. Biol. Chem . 273 (18): 11267– 73. doi : 10.1074/jbc.273.18.11267 . ISSN 0021-9258. PMID 9556618.