ЭНОД40
ЭНОД40
Логотип последовательности пептида ENOD40.
Идентификаторы
СимволЭНОД40
ПфамПФ08247
ИнтерПроIPR013186
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры
ЭНОД40
Вторичная структура и сохранение последовательности ENOD40
Идентификаторы
СимволЭНОД40
РфамРФ01845
Другие данные
Тип РНКНекодирующая РНК
ДоменыМагнолиофиты
Структуры PDBПДБе

enod40 , также известный как ранний нодулин 40, — это ген, обнаруженный в цветковых растениях . Ген обладает характеристиками какгенов белка , так и некодирующих РНК . [1] Имеются некоторые свидетельства того, что некодирующие характеристики этого гена более широко сохранены, чем последовательности, кодирующие белок. [2] Было обнаружено, что в соевых бобах enod40 экспрессируется на ранних стадиях формирования азотфиксирующих корневых клубеньков, которые связаны с симбиотическими почвенными ризобиальными бактериями . [3] [4] Ген также активен в корнях, содержащих грибы, образующие фосфат-усваивающую арбускулярную микоризу . [5] Взаимодействие с новым РНК-связывающим белком MtRBP1 ( РНК-связывающий белок 1 Medicago truncatula ), исследованное при развитии корневого клубенька, предполагает, что ENOD40 выполняет функцию цитоплазматической релокализации ядерных белков . [6] При изучении небобовых растений наблюдалось чрезмерное увеличение экспрессии ENOD40 в трансгенных линиях Arabidopsis, что приводило к снижению расширения клеток. [7]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Креспи М.Д., Юркевич Э., Пуаре М., д'Обентон-Карафа Ю., Петрович Г., Кондороси Э., Кондороси А. (1994). «enod40, ген, экспрессируемый во время органогенеза клубеньков, кодирует непереводимую РНК, участвующую в росте растений». ЭМБО Дж . 13 (21): 5099–5112. doi :10.1002/j.1460-2075.1994.tb06839.x. ПМЦ  395456 . ПМИД  7957074.
  2. ^ Гультяев AP, Руссис A (2007). «Идентификация консервативных вторичных структур и сегментов расширения в РНК enod40 выявляет новые гомологи enod40 в растениях». Nucleic Acids Res . 35 (9): 3144–3152. doi :10.1093/nar/gkm173. PMC 1888808. PMID 17452360  . 
  3. ^ Ян В.К., Катинакис П., Хендрикс П., Смолдерс А., де Врис Ф., Спи Дж., ван Каммен А., Бисселинг Т., Франссен Х. (1993). «Характеристика GmENOD40, гена, демонстрирующего новые закономерности клеточно-специфической экспрессии во время развития клубеньков сои». Плант Дж . 3 (4): 573–585. дои : 10.1046/j.1365-313X.1993.03040573.x . ПМИД  8220464.
  4. ^ Kouchi H, Hata S (1993). «Выделение и характеристика новых кДНК нодулина, представляющих гены, экспрессируемые на ранних стадиях развития клубеньков сои». Mol Gen Genet . 238 (1–2): 106–119. doi :10.1007/bf00279537. PMID  7683079. S2CID  23793878.
  5. ^ van Rhijn P, Fang Y, Galili S, Shaul O, Atzmon N, Wininger S, Eshed Y, Lum M, Li Y, To V, Fujishige N, Kapulnik Y, Hirsch AM (1997). «Экспрессия ранних генов нодулина в микоризе люцерны указывает на то, что пути передачи сигнала, используемые при формировании арбускулярной микоризы и клубеньков, вызванных Rhizobium, могут быть сохранены». Proc Natl Acad Sci USA . 94 (10): 5467–5472. Bibcode :1997PNAS...94.5467V. doi : 10.1073/pnas.94.10.5467 . PMC 24702 . PMID  11038545. 
  6. ^ Campalans A, Kondorosi A, Crespi M (2004). «Enod40, короткая открытая рамка считывания, содержащая мРНК, индуцирует цитоплазматическую локализацию ядерного РНК-связывающего белка в Medicago truncatula». Plant Cell . 16 (4): 1047–1059. doi :10.1105/tpc.019406. PMC 412876 . PMID  15037734. 
  7. ^ Гуццо Ф., Порталуппи П., Гризи Р., Бароне С., Зампиери С., Франссен Х., Леви М. (2005). «Уменьшение размера клеток, индуцированное enod40 у Arabidopsis thaliana». J Exp Бот . 56 (412): 507–513. дои : 10.1093/jxb/eri028 . ПМИД  15557291.

Дальнейшее чтение

  • Подковинский Дж, Змиенко А, Флорек Б, Войцеховский П, Рыбарчик А, Вжесински Дж, Цеселка Дж, Блажевич Дж, Кондороси А, Креспи М, Легоцки А (2009). «Трансляционный и структурный анализ самого короткого гена ENOD40 бобовых у Lupinus luteus». Акта Биохим Пол . 56 (1): 89–102. дои : 10.18388/abp.2009_2520 . ПМИД  19287803.
  • Ван Х, Онтелес Дж., Лилло А., Гуарнерио С., ван де Пеут Д., Федорова Е., Бисселинг Т., Франссен Х. (2007). «Medicago truncatula ENOD40-1 и ENOD40-2 участвуют в зарождении узелков и развитии бактероидов». J Exp Бот . 58 (8): 2033–2041. дои : 10.1093/jxb/erm072 . ПМИД  17452749.
  • Гультяев АП, Руссис А (2007). «Идентификация консервативных вторичных структур и сегментов расширения в РНК enod40 выявляет новые гомологи enod40 в растениях». Nucleic Acids Res . 35 (9): 3144–3152. doi :10.1093/nar/gkm173. PMC 1888808.  PMID 17452360  .
  • Murakami Y, Miwa H, Imaizumi-Anraku H, Kouchi H, Downie JA, Kawaguchi M, Kawasaki S (2006). «Позиционное клонирование идентифицирует Lotus japonicus NSP2, предполагаемый фактор транскрипции семейства GRAS, необходимый для экспрессии генов NIN и ENOD40 при инициации клубеньков». DNA Res . 13 (6): 255–265. doi : 10.1093/dnares/dsl017 . PMID  17244637.
  • Ли А., Лам М. Р., Хирш А. М. (2007). «Экспрессия гена ENOD40 и ответы цитокинина в неклубеньковом, немикоризном (NodMyc) мутанте Masym3 Melilotus alba Desr». Plant Signal Behav . 2 (1): 33–42. doi :10.4161/psb.2.1.3734. PMC  2633896. PMID  19516966 .
  • Ruttink T, Boot K, Kijne J, Bisseling T, Franssen H (2006). «ENOD40 влияет на рост удлинения в клетках табака Bright Yellow-2 путем изменения кинетики биосинтеза этилена». J Exp Bot . 57 (12): 3271–3282. doi : 10.1093/jxb/erl089 . PMID  16957021.
  • Grønlund M, Roussis A, Flemetakis E, Quaedvlieg NE, Schlaman HR, Umehara Y, Katinakis P, Stougaard J, Spaink HP (2005). "Анализ активности промотора раннего нодулина Enod40 в Lotus japonicus". Mol Plant Microbe Interact . 18 (5): 414–427. doi : 10.1094/MPMI-18-0414 . hdl : 1887/61968 . PMID  15915640.
  • Röhrig H, John M, Schmidt J (2004). «Модификация синтазы сахарозы сои путем S-тиолирования с помощью пептида ENOD40 A». Biochem Biophys Res Commun . 325 (3): 864–870. doi :10.1016/j.bbrc.2004.10.100. hdl : 11858/00-001M-0000-0012-3B5C-C . PMID  15541370.
  • Dey M, Complainville A, Charon C, Torrizo L, Kondorosi A, Crespi M, Datta S (2004). "Фитогормональные реакции в растениях Medicago truncatula и риса с повышенной экспрессией enod40". Physiol. Plant . 120 (1): 132–139. doi :10.1111/j.0031-9317.2004.0208.x. PMID  15032885.
  • Compaan B, Ruttink T, Albrecht C, Meeley R, Bisseling T, Franssen H (2003). «Идентификация и характеристика линии Zea mays, несущей транспозон-меченый ENOD40». Biochim Biophys Acta . 1629 (1–3): 84–91. doi :10.1016/j.bbaexp.2003.08.004. PMID  14522083.
  • Влегельс И., Онтелес Дж., Рибейро А., Франц П., Бисселинг Т., Франссен Х. (2003). «Экспрессия ENOD40 во время развития томата». Планта . 218 (1): 42–49. дои : 10.1007/s00425-003-1081-9. PMID  14508686. S2CID  37198384.
  • Santi C, von Groll U, Ribeiro A, Chiurazzi M, Auguy F, Bogusz D, Franche C, Pawlowski K (2003). "Сравнение индукции клубеньков в бобовых и актиноризных симбиозах: индукция актиноризных клубеньков не включает ENOD40". Mol Plant Microbe Interact . 16 (9): 808–816. doi : 10.1094/MPMI.2003.16.9.808 . PMID  12971604.
  • Girard G, Roussis A, Gultyaev AP, Pleij CW, Spaink HP (2003). «Структурные мотивы в РНК, кодируемой геном раннего клубенькования enod40 сои». Nucleic Acids Res . 31 (17): 5003–5015. doi :10.1093/nar/gkg721. PMC  212817. PMID  12930950 .
  • Larsen K (2003). «Молекулярное клонирование и характеристика кДНК, кодирующей гомолог ENOD40 райграса (Lolium perenne)». J Plant Physiol . 160 (6): 675–687. doi :10.1078/0176-1617-00962. PMID  12872490.
  • Favery B, Complainville A, Vinardell JM, Lecomte P, Vaubert D, Mergaert P, Kondorosi A, Kondorosi E, Crespi M, Abad P (2002). «Гены ENOD40 и CCS52a, индуцированные эндосимбиозом, участвуют во взаимодействиях эндопаразитов и нематод у Medicago truncatula». Mol Plant Microbe Interact . 15 (10): 1008–1013. doi : 10.1094/MPMI.2002.15.10.1008 . PMID  12437298.
  • Varkonyi-Gasic E, White DW (2002). «Семейство генов enod40 белого клевера. Паттерны экспрессии двух типов генов указывают на роль в сосудистой функции». Plant Physiol . 129 (3): 1107–1118. doi :10.1104/pp.010916. PMC  166505. PMID  12114565 .
  • Rohrig H, Schmidt J, Miklashevichs E, Schell J, John M (2002). «Соевый ENOD40 кодирует два пептида, которые связываются с сахарозосинтазой». Proc Natl Acad Sci USA . 99 (4): 1915–1920. Bibcode : 2002PNAS...99.1915R. doi : 10.1073/pnas.022664799 . PMC  122294. PMID  11842184 .
  • Staehelin C, Charon C, Boller T, Crespi M, Kondorosi A (2001). «Растения Medicago truncatula, сверхэкспрессирующие ранний ген нодулина enod40, демонстрируют ускоренную микоризную колонизацию и усиленное образование арбускул». Proc Natl Acad Sci USA . 98 (26): 15366–15371. Bibcode : 2001PNAS...9815366S. doi : 10.1073 /pnas.251491698 . PMC  65035. PMID  11752473.
  • Imaizumi-Anraku H, Kouchi H, Syono K, Akao S, Kawaguchi M (2000). «Анализ экспрессии ENOD40 в alb1, симбиотическом мутанте Lotus japonicus, который образует пустые узелки с не полностью развитыми сосудистыми пучками узелков». Mol Gen Genet . 264 (4): 402–410. doi :10.1007/s004380000330. PMID  11129043. S2CID  10727926.
  • Sousa C, Johansson C, Charon C, Manyani H, Sautter C, Kondorosi A, Crespi M (2001). "Трансляционные и структурные требования раннего гена нодулина enod40, РНК, содержащей короткую открытую рамку считывания, для выявления специфической для клеток реакции роста в коре корня люцерны". Mol Cell Biol . 21 (1): 354–366. doi :10.1128/MCB.21.1.354-366.2001. PMC  88808 . PMID  11113209.
  • Flemetakis E, Kavroulakis N, Quaedvlieg NE, Spaink HP, Dimou M, Roussis A, Katinakis P (2000). «Lotus japonicus содержит два различных гена ENOD40, которые экспрессируются в симбиотических, несимбиотических и эмбриональных тканях». Mol Plant Microbe Interact . 13 (9): 987–994. doi : 10.1094/MPMI.2000.13.9.987 . PMID  10975655.
  • Charon C, Sousa C, Crespi M, Kondorosi A (1999). «Изменение экспрессии enod40 изменяет развитие корневых клубеньков medicago truncatula, вызванное sinorhizobium meliloti». Plant Cell . 11 (10): 1953–1966. doi :10.1105/tpc.11.10.1953. PMC  144109 . PMID  10521525.
  • Kouchi H, Takane K, So RB, Ladha JK, Reddy PM (1999). "ENOD40 риса: изоляция и анализ экспрессии в корневых клубеньках риса и трансгенной сои". Plant J . 18 (2): 121–129. doi : 10.1046/j.1365-313X.1999.00432.x . PMID  10363365.
  • Mirabella R, Martirani L, Lamberti A, Iaccarino M, Chiurazzi M (1999). «Промотор соевого ENOD40(2) активен в Arabidopsis thaliana и регулируется во времени и пространстве». Plant Mol Biol . 39 (1): 177–181. doi :10.1023/A:1006146627301. PMID  10080720. S2CID  27117762.
  • Корич В., Гурмахтиг С., Ливенс С., Ван Монтегю М., Хольстерс М. (1998). «Закономерности экспрессии гена ENOD40 в стеблевых узелках Sesbania rostrata». Plant Mol Biol . 37 (1): 67–76. doi :10.1023/A:1005925607793. PMID  9620265. S2CID  6061623.
  • Fang Y, Hirsch AM (1998). «Изучение экспрессии раннего гена нодулина ENOD40 и индукции фактором клубенькования и цитокинином в трансгенной люцерне». Plant Physiol . 116 (1): 53–68. doi :10.1104/pp.116.1.53. PMC 35188.  PMID 9449836  .
  • Charon C, Johansson C, Kondorosi E, Kondorosi A, Crespi M (1997). "enod40 вызывает дедифференциацию и деление клеток коры корня бобовых". Proc Natl Acad Sci USA . 94 (16): 8901–8906. Bibcode : 1997PNAS ...94.8901C. doi : 10.1073/pnas.94.16.8901 . PMC  23190. PMID  11038563.
  • Minami E, Kouchi H, Cohn JR, Ogawa T, Stacey G (1996). «Экспрессия раннего нодулина, ENOD40, в корнях сои в ответ на различные сигнальные молекулы липохитина». Plant J . 10 (1): 23–32. doi : 10.1046/j.1365-313X.1996.10010023.x . PMID  8758977.
  • Papadopoulou K, Roussis A, Katinakis P (1996). "Phaseolus ENOD40 участвует в симбиотических и несимбиотических органогенетических процессах: экспрессия во время развития клубеньков и боковых корней". Plant Mol Biol . 30 (3): 403–417. doi :10.1007/BF00049320. PMID  8605294. S2CID  2726636.
  • Креспи М.Д., Юркевич Э., Пуаре М., д'Обентон-Карафа Ю., Петрович Г., Кондороси Е., Кондороси А. (1994). «enod40, ген, экспрессируемый во время органогенеза клубеньков, кодирует непереводимую РНК, участвующую в росте растений». ЭМБО Дж . 13 (21): 5099–5112. doi :10.1002/j.1460-2075.1994.tb06839.x. ПМЦ  395456 . ПМИД  7957074.
  • Матвиенко М., Ван де Санде К., Янг В.К., ван Каммен А., Бисселинг Т., Франссен Х. (1994). «Сравнение клонов ENOD40 кДНК сои и гороха, представляющих гены, экспрессируемые как на ранних, так и на поздних стадиях развития клубенька». Plant Mol Biol . 26 (1): 487–493. doi :10.1007/BF00039559. PMID  7948896. S2CID  11639458.
  • Страница ENTREZ для Lotus japonicus ENOD40
  • Страница для раннего нодулина 40 в Rfam
  • Запись NONCODE для РНК ENOD40
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=ENOD40&oldid=1184022577"