ЭЛП3

ЭЛП3
Идентификаторы
Псевдонимы	ELP3 , KAT9, субъединица 3 комплекса ацетилтрансферазы элонгатора
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 612722; МГИ : 1921445; Гомологен : 7105; Генные карты : ELP3; OMA :ELP3 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 8 (человек)
Конец	28,191,156 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 14 (мышь)
Конец	65,830,524 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	эндотелиальная клетка; ; Район Бродмана 23; ; средняя височная извилина; ; эндометрий; ; Ахиллово сухожилие; ; эпителий толстой кишки; ; зародышевый эпителий; ; внутренний бледный шар; ; первичная зрительная кора; ; семенные пузырьки;
	Верх выражен в
	примитивная черта; ; желудочковая зона; ; сомит; ; эпибласт; ; зубчатая извилина гиппокампа гранулярная клетка образования; ; мышца бедра; ; верхнечелюстной выступ; ; кальвария; ; выступ нижней челюсти; ; нервная трубка;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	трансферазная активность; Связывание комплекса РНК-полимеразы II; связывание кластера железа и серы; Активность ацетилтрансферазы гистонов H4; Активность ацетилтрансферазы гистонов H3; связывание ионов металлов; активность ацетилтрансферазы гистонов; активность регулятора киназы фосфорилазы; связывание белков; каталитическая активность; активность ацилтрансферазы; активность ацетилтрансферазы;
Клеточный компонент	цитоплазма; комплекс холоферментов элонгатора; ядрышко; комплекс гистонацетилтрансферазы; комплекс факторов удлинения транскрипции; ядро;
Биологический процесс	регуляция транскрипции, ДНК-шаблонная; позитивная регуляция миграции клеток; регуляция транскрипции РНК-полимеразой II; удлинение транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; миграция нейронов; транскрипция, ДНК-шаблон; развитие нервной системы; развитие центральной нервной системы; ацетилирование гистона H3; ацетилирование гистона H4; регуляция активности протеинкиназы; tRNA колебательное основание 5-метоксикарбонилметил-2-тиоуридинилирование; ацетилирование гистонов;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	55140
	74195
	ENSG00000134014
	ENSMUSG00000022031
	Q9H9T3
	Q9CZX0
NM_001284220 ; NM_001284222 ; NM_001284224 ; NM_001284225 ; NM_001284226;
	NM_018091
	NM_001253812 ; NM_028811
NP_001271149 ; NP_001271151 ; NP_001271153 ; NP_001271154 ; NP_001271155;
	NP_060561
	NP_001240741 ; NP_083087
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Белок комплекса элонгатора 3 , также называемый KAT9, представляет собой белок , который у людей кодируется геном ELP3 . ^[5]^[6] ELP3 представляет собой каталитическую субъединицу ацетилтрансферазы гистонов комплекса элонгатора РНК-полимеразы II, который является компонентом голофермента РНК-полимеразы II (Pol II) и участвует в транскрипционной элонгации . ELP3 поддерживает миграцию и ветвление проекционных нейронов посредством ацетилирования альфа-тубулина в развивающейся коре головного мозга . ^[7] У млекопитающих ELP3 важен для деметилирования отцовской ДНК после оплодотворения . ^[8] ELP3 потенциально участвует в клеточном окислительно-восстановительном гомеостазе , опосредуя ацетилирование глюкозо-6-фосфатдегидрогеназы . ^[9] Кроме того, ELP3 может играть роль в ремоделировании хроматина и участвует в ацетилировании гистонов H3 и, вероятно, H4 .

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000134014 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000022031 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Hawkes NA, Otero G, Winkler GS, Marshall N, Dahmus ME, Krappmann D, Scheidereit C, Thomas CL, Schiavo G, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Svejstrup JQ (январь 2002 г.). «Очистка и характеристика комплекса элонгатора человека». J Biol Chem . 277 (4): 3047–52. doi : 10.1074/jbc.M110445200 . PMID 11714725.
^ "Ген Entrez: гомолог белка удлинения 3 ELP3 (S. cerevisiae)".
^ Creppe C, Malinouskaya L, Volvert ML, Gillard M, Close P, Malaise O, Laguesse S, Cornez I, Rahmouni S, Ormenese S, Belachew S, Malgrange B, Chapelle JP, Siebenlist U, Moonen G, Chariot A, Nguyen L (февраль 2009 г.). "Elongator контролирует миграцию и дифференциацию корковых нейронов посредством ацетилирования альфа-тубулина". Cell . 136 (3): 551–64. doi : 10.1016/j.cell.2008.11.043 . PMID 19185337. S2CID 18351772.
^ Okada Y, Yamagata K, Hong K, Wakayama T, Zhang Y (январь 2010 г.). «Роль комплекса элонгатора в деметилировании зиготического отцовского генома». Nature . 463 (7280): 554–8. Bibcode :2010Natur.463..554O. doi :10.1038/nature08732. PMC 2834414 . PMID 20054296.
^ Wang YP, Zhou LS, Zhao YZ, Wang SW, Chen LL, Liu LX, Ling ZQ, Hu FJ, Sun YP, Zhang JY, Yang C, Yang Y, Xiong Y, Guan KL, Ye D (июнь 2014 г.). «Регуляция ацетилирования G6PD с помощью SIRT2 и KAT9 модулирует гомеостаз NADPH и выживаемость клеток во время окислительного стресса». The EMBO Journal . 33 (12): 1304–20. doi :10.1002/embj.201387224. PMC 4194121 . PMID 24769394.

Дальнейшее чтение

Ренго Ф., Бреветти Дж., Пишоне Ф. и др. (1977). «[Поведение некоторых метаболических параметров во время постишемической и постсокращенной вазодилатации у нормальных субъектов]». Боллеттино делла Сосьета итальянского кардиологического общества . 20 (12): 1801–6. ПМИД 10936.
Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Ниномия Y, Окада M, Котомура N и др. (1996). «Геномная организация и изоформы гена ELP мыши». J. Biochem . 118 (2): 380–9. doi :10.1093/oxfordjournals.jbchem.a124918. PMID 8543574.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K и др. (1997). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). «Клонирование ДНК с использованием in vitro сайт-специфической рекомбинации». Genome Res . 10 (11): 1788–95. doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863 .
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R и др. (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных кодирующих белок человеческих кДНК». Genome Res . 11 (3): 422–35. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166 .
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep . 1 (3): 287–92. doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614 .
Kim JH, Lane WS, Reinberg D (2002). «Человеческий элонгатор облегчает транскрипцию РНК-полимеразы II через хроматин». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (3): 1241–6. Bibcode : 2002PNAS...99.1241K. doi : 10.1073/pnas.251672198 . PMC 122174. PMID 11818576 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H и др. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала человеческого TNF-альфа/NF-каппа B». Nat. Cell Biol . 6 (2): 97–105. doi :10.1038/ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986.
Wiemann S, Arlt D, Huber W и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res . 14 (10B): 2136–44. doi :10.1101/gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336 .
Kouskouti A, Talianidis I (2005). «Модификации гистонов, определяющие активные гены, сохраняются после транскрипционной и митотической инактивации». EMBO J . 24 (2): 347–57. doi :10.1038/sj.emboj.7600516. PMC 545808 . PMID 15616580.
Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B, et al. (2005). "Высокопроизводительное картирование динамической сигнальной сети в клетках млекопитающих". Science . 307 (5715): 1621–5. Bibcode :2005Sci...307.1621B. doi :10.1126/science.1105776. PMID 15761153. S2CID 39457788.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Nucleic Acids Res . 34 (выпуск базы данных): D415–8. doi :10.1093/nar/gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901 .
Han Q, Hou X, Su D и др. (2007). «Субъединица hELP3 комплекса Elongator регулирует транскрипцию гена HSP70 в клетках человека». Acta Biochim. Biophys. Sin. (Шанхай) . 39 (6): 453–61. doi : 10.1111/j.1745-7270.2007.00293.x . PMID 17558451.

Эта статья о гене на 8-й хромосоме человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000134014 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000022031 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11714725-5] Hawkes NA, Otero G, Winkler GS, Marshall N, Dahmus ME, Krappmann D, Scheidereit C, Thomas CL, Schiavo G, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Svejstrup JQ (январь 2002 г.). «Очистка и характеристика комплекса элонгатора человека». J Biol Chem . 277 (4): 3047–52. doi : 10.1074/jbc.M110445200 . PMID 11714725.

[entrez-6] "Ген Entrez: гомолог белка удлинения 3 ELP3 (S. cerevisiae)".

[7] Creppe C, Malinouskaya L, Volvert ML, Gillard M, Close P, Malaise O, Laguesse S, Cornez I, Rahmouni S, Ormenese S, Belachew S, Malgrange B, Chapelle JP, Siebenlist U, Moonen G, Chariot A, Nguyen L (февраль 2009 г.). "Elongator контролирует миграцию и дифференциацию корковых нейронов посредством ацетилирования альфа-тубулина". Cell . 136 (3): 551–64. doi : 10.1016/j.cell.2008.11.043 . PMID 19185337. S2CID 18351772.

[8] Okada Y, Yamagata K, Hong K, Wakayama T, Zhang Y (январь 2010 г.). «Роль комплекса элонгатора в деметилировании зиготического отцовского генома». Nature . 463 (7280): 554–8. Bibcode :2010Natur.463..554O. doi :10.1038/nature08732. PMC 2834414 . PMID 20054296.

[9] Wang YP, Zhou LS, Zhao YZ, Wang SW, Chen LL, Liu LX, Ling ZQ, Hu FJ, Sun YP, Zhang JY, Yang C, Yang Y, Xiong Y, Guan KL, Ye D (июнь 2014 г.). «Регуляция ацетилирования G6PD с помощью SIRT2 и KAT9 модулирует гомеостаз NADPH и выживаемость клеток во время окислительного стресса». The EMBO Journal . 33 (12): 1304–20. doi :10.1002/embj.201387224. PMC 4194121 . PMID 24769394.