E74-подобный фактор 5 (фактор транскрипции домена ets) — это ген, обнаруженный как у мышей, так и у людей. [5] У людей он также называется ESE2.
Функция
Белок, кодируемый этим геном, является членом эпителиально-специфического подкласса семейства факторов транскрипции ETS . В дополнение к своей роли в регуляции поздних стадий терминальной дифференциации кератиноцитов, он, по-видимому, регулирует ряд эпителиально-специфических генов, обнаруженных в тканях, содержащих железистый эпителий, таких как слюнная железа и простата. Он имеет очень низкое сродство к ДНК из-за своего отрицательного регуляторного домена на аминоконце. Для этого гена были описаны два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, кодирующих различные изоформы. [5]
Отношение к болезни
Известна роль в развитии рака груди или простаты. [6] Имеются предварительные сообщения о том, что генетический вариант аллеля C rs61882275 вблизи хромосомы 11.13 с переменной частотой в популяциях людей [7] связан с тяжелым течением COVID-19 . [8] Дальнейшие исследования других авторов показали, что эта связь была вызвана тканеспецифическим эффектом этого аллеля на экспрессию ELF5 в эндотелии легких , что приводит к более чем 4-кратному повышению риска тяжелого течения COVID-19 у лиц с инфекцией SARS-CoV2 . [9]
Ссылки
^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000135374 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000027186 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Piggin CL, Roden DL, Gallego-Ortega D, Lee HJ, Oakes SR, Ormandy CJ (7 января 2016 г.). «Экспрессия изоформы ELF5 специфична для тканей и существенно изменяется при раке». Breast Cancer Research . 18 (1). 4. doi : 10.1186/s13058-015-0666-0 . PMC 4704400 . PMID 26738740.
^ "dbSNP Short Genetic Variations: rs61882275" . Получено 21 января 2022 г. .
^ Kousathanas A, et al. (8 сентября 2021 г.). «Полногеномное секвенирование выявляет множественные локусы критического заболевания, вызванного COVID-19». medRxiv 10.1101/2021.09.02.21262965 .
^ Pietzner M, et al. (19 января 2022 г.). «ELF5 — это специфический для респираторных эпителиальных клеток ген риска тяжелого течения COVID-19». medRxiv 10.1101/2022.01.17.22269283 .
Дальнейшее чтение
Sharrocks AD, Brown AL, Ling Y, Yates PR (декабрь 1997 г.). «Семейство факторов транскрипции ETS-домена». Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 29 (12): 1371–87. doi :10.1016/S1357-2725(97)00086-1. PMID 9570133.
Zhou J, Ng AY, Tymms MJ, Jermiin LS, Seth AK, Thomas RS, Kola I (ноябрь 1998 г.). «Новый фактор транскрипции ELF5 принадлежит к подсемейству ELF генов ETS и отображается в человеческой хромосоме 11p13-15, области, подверженной LOH и перестройке в клеточных линиях человеческой карциномы». Oncogene . 17 (21): 2719–32. doi : 10.1038/sj.onc.1202198 . PMID 9840936.
Oettgen P, Kas K, Dube A, Gu X, Grall F, Thamrongsak U, Akbarali Y, Finger E, Boltax J, Endress G, Munger K, Kunsch C, Libermann TA (октябрь 1999 г.). «Характеристика ESE-2, нового фактора транскрипции Ets, связанного с ESE-1 и ограниченного железистым эпителием и дифференцированными кератиноцитами». Журнал биологической химии . 274 (41): 29439–52. doi : 10.1074/jbc.274.41.29439 . PMID 10506207.
Lapinskas EJ, Palmer J, Ricardo S, Hertzog PJ, Hammacher A, Pritchard MA (декабрь 2004 г.). «Основным местом экспрессии фактора транскрипции ets Elf5 является эпителий экзокринных желез». Histochemistry and Cell Biology . 122 (6): 521–6. doi :10.1007/s00418-004-0713-x. PMID 15655699. S2CID 28936823.
Yaniw D, Hu J (июнь 2005 г.). «Эпителий-специфический фактор транскрипции ets 2 повышает экспрессию цитокератина 18 в легочных эпителиальных клетках посредством взаимодействия с интроном 1 цитокератина 18». Cell Research . 15 (6): 423–9. doi :10.1038/sj.cr.7290310. PMC 4494830 . PMID 15987600.
Tummala R, Sinha S (март 2006 г.). «Дифференциально-специфическая транскрипционная регуляция гена ESE-2 новым фактором, ограниченным кератиноцитами». Журнал клеточной биохимии . 97 (4): 766–81. doi :10.1002/jcb.20685. PMID 16229011. S2CID 46125527.
Choi YS, Sinha S (сентябрь 2006 г.). «Определение консенсусной ДНК-связывающей последовательности и домена транскрипционной активации для ESE-2». The Biochemical Journal . 398 (3): 497–507. doi :10.1042/BJ20060375. PMC 1559455 . PMID 16704374.
Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (май 2006 г.). «Сеть взаимодействия белок-белок при наследственных атаксиях и расстройствах дегенерации клеток Пуркинье у человека». Cell . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569. S2CID 13709685.
